39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_4315 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_4315  membrane protein  100 
 
 		 115 aa  219  9e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.25101  normal  0.607274 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4331  membrane protein  51.46 
 
 		 148 aa  87.4  6e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28530  hypothetical protein  53.12 
 
 		 124 aa  82.4  0.000000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.158089 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6084  hypothetical protein  46.61 
 
 		 124 aa  80.1  0.000000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1951  inner membrane protein  44.76 
 
 		 119 aa  80.1  0.00000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0518016  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5237  hypothetical protein  47.83 
 
 		 188 aa  76.3  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.109087 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2390  hypothetical protein  42.16 
 
 		 116 aa  70.1  0.000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0727974  normal  0.904998 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1266  hypothetical protein  40.78 
 
 		 116 aa  66.2  0.0000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.390774  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1602  hypothetical protein  42.72 
 
 		 120 aa  63.9  0.0000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.291918  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4864  export protein  47.83 
 
 		 111 aa  62.4  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.917726  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3849  hypothetical protein  38.32 
 
 		 126 aa  60.8  0.000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00630454 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17180  hypothetical protein  40.62 
 
 		 153 aa  59.7  0.00000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.185889  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1596  hypothetical protein  41.05 
 
 		 123 aa  60.1  0.00000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000114337 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3937  hypothetical protein  37.5 
 
 		 126 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.112267 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2341  hypothetical protein  38.82 
 
 		 124 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.281359  normal  0.49324 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3863  hypothetical protein  37.5 
 
 		 126 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.778203  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4304  hypothetical protein  42.86 
 
 		 127 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.617821  normal  0.537638 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03630  hypothetical protein  42.55 
 
 		 155 aa  55.1  0.0000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24600  hypothetical protein  41.94 
 
 		 168 aa  53.5  0.0000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37260  hypothetical protein  45.71 
 
 		 132 aa  53.1  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4949  putative transmembrane protein  35.29 
 
 		 107 aa  52  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.640095  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2278  inner membrane protein  38.71 
 
 		 109 aa  50.4  0.000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1301  hypothetical protein  33.33 
 
 		 125 aa  49.7  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.322737  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5176  hypothetical protein  33.94 
 
 		 140 aa  48.9  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0667281  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11958  hypothetical protein  31.03 
 
 		 89 aa  48.9  0.00003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1353  hypothetical protein  31.96 
 
 		 120 aa  46.2  0.0001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.139683  normal  0.153644 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1261  hypothetical protein  38.16 
 
 		 96 aa  45.8  0.0002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.247211  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1650  hypothetical protein  36 
 
 		 100 aa  45.4  0.0003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0214311  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1333  hypothetical protein  35.64 
 
 		 156 aa  43.9  0.0007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00349105  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24650  hypothetical protein  34.44 
 
 		 114 aa  42.7  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.757383  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5661  hypothetical protein  34.94 
 
 		 100 aa  42.7  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5078  hypothetical protein  38.46 
 
 		 99 aa  42.4  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.322327 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3918  hypothetical protein  34.41 
 
 		 96 aa  41.2  0.004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0276  hypothetical protein  27.59 
 
 		 103 aa  41.2  0.005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00194964  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5647  hypothetical protein  34.41 
 
 		 97 aa  41.2  0.005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5249  hypothetical protein  34.41 
 
 		 97 aa  41.2  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5492  hypothetical protein  33.33 
 
 		 97 aa  40.4  0.008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5095  hypothetical protein  33.33 
 
 		 97 aa  40.4  0.008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.490527  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5078  hypothetical protein  33.33 
 
 		 97 aa  40.4  0.008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000186097  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>