33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_4331 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_4331  membrane protein  100 
 
 		 148 aa  286  8e-77  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24600  hypothetical protein  58.9 
 
 		 168 aa  135  2e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03630  hypothetical protein  50.34 
 
 		 155 aa  109  2.0000000000000002e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6084  hypothetical protein  47.32 
 
 		 124 aa  99.8  1e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5237  hypothetical protein  56.1 
 
 		 188 aa  93.6  9e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.109087 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28530  hypothetical protein  51.4 
 
 		 124 aa  87.8  5e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.158089 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4315  membrane protein  51.46 
 
 		 115 aa  87.4  6e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.25101  normal  0.607274 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1602  hypothetical protein  49.46 
 
 		 120 aa  82  0.000000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.291918  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17180  hypothetical protein  46.09 
 
 		 153 aa  80.9  0.000000000000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.185889  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4864  export protein  56.52 
 
 		 111 aa  80.5  0.000000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.917726  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4949  putative transmembrane protein  37.38 
 
 		 107 aa  79  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.640095  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1951  inner membrane protein  40.91 
 
 		 119 aa  78.2  0.00000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0518016  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1596  hypothetical protein  44.32 
 
 		 123 aa  78.2  0.00000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000114337 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1266  hypothetical protein  42.48 
 
 		 116 aa  76.3  0.0000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.390774  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2390  hypothetical protein  44.57 
 
 		 116 aa  76.3  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0727974  normal  0.904998 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2341  hypothetical protein  42.7 
 
 		 124 aa  72.8  0.000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.281359  normal  0.49324 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37260  hypothetical protein  52.87 
 
 		 132 aa  72.4  0.000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3849  hypothetical protein  36.28 
 
 		 126 aa  66.6  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00630454 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3937  hypothetical protein  38.14 
 
 		 126 aa  66.2  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.112267 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3863  hypothetical protein  38.14 
 
 		 126 aa  66.2  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.778203  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2278  inner membrane protein  44.32 
 
 		 109 aa  65.9  0.0000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4304  hypothetical protein  46.07 
 
 		 127 aa  61.2  0.000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.617821  normal  0.537638 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5176  hypothetical protein  39.08 
 
 		 140 aa  58.5  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0667281  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1333  hypothetical protein  37.96 
 
 		 156 aa  57  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00349105  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3889  hypothetical protein  40.86 
 
 		 107 aa  53.9  0.0000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.993431  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3170  hypothetical protein  30.69 
 
 		 99 aa  48.9  0.00003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.8741 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2129  hypothetical protein  32.58 
 
 		 111 aa  47  0.00008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2847  hypothetical protein  32.26 
 
 		 97 aa  46.2  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.460622  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2651  hypothetical protein  35.05 
 
 		 101 aa  44.3  0.0006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.123559 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1261  hypothetical protein  30.77 
 
 		 96 aa  42.7  0.001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.247211  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11958  hypothetical protein  30.95 
 
 		 89 aa  42.7  0.002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1353  hypothetical protein  32.43 
 
 		 120 aa  41.2  0.005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.139683  normal  0.153644 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3536  hypothetical protein  31.18 
 
 		 142 aa  40.8  0.006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000435682  hitchhiker  0.00283491 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>