49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_3889 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_3889  hypothetical protein  100 
 
 
107 aa  211  2.9999999999999995e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.993431  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1333  hypothetical protein  60.71 
 
 
156 aa  95.5  2e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00349105  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5176  hypothetical protein  55.1 
 
 
140 aa  93.2  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0667281  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0575  hypothetical protein  38.89 
 
 
104 aa  68.9  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11958  hypothetical protein  32.95 
 
 
89 aa  61.2  0.000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3170  hypothetical protein  36 
 
 
99 aa  60.5  0.000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.8741 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5237  hypothetical protein  40.91 
 
 
188 aa  58.2  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.109087 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2847  hypothetical protein  30.43 
 
 
97 aa  55.5  0.0000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.460622  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4331  membrane protein  40.86 
 
 
148 aa  53.9  0.0000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1262  hypothetical protein  43.9 
 
 
102 aa  53.9  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1889  hypothetical protein  31.31 
 
 
112 aa  51.6  0.000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.716507  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1650  hypothetical protein  34.12 
 
 
100 aa  51.2  0.000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0214311  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4949  putative transmembrane protein  33.33 
 
 
107 aa  50.4  0.000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.640095  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1502  hypothetical protein  35.58 
 
 
116 aa  48.9  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0276  hypothetical protein  32.65 
 
 
103 aa  49.3  0.00002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00194964  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3536  hypothetical protein  32.95 
 
 
142 aa  49.3  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000435682  hitchhiker  0.00283491 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28530  hypothetical protein  39.08 
 
 
124 aa  48.1  0.00004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.158089 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4762  hypothetical protein  33.33 
 
 
102 aa  47.4  0.00007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0980147  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1951  inner membrane protein  35.62 
 
 
119 aa  46.6  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0518016  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5792  hypothetical protein  30.34 
 
 
101 aa  46.6  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6084  hypothetical protein  30.77 
 
 
124 aa  46.2  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2198  membrane-associated protein  30.77 
 
 
102 aa  45.1  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0231  hypothetical protein  32.91 
 
 
102 aa  45.1  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0829  hypothetical protein  28.57 
 
 
105 aa  44.7  0.0004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.45042 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2651  hypothetical protein  37.21 
 
 
101 aa  45.1  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.123559 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3776  hypothetical protein  34.02 
 
 
108 aa  45.1  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000562489  hitchhiker  0.00860307 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24600  hypothetical protein  36.9 
 
 
168 aa  44.7  0.0004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5421  hypothetical protein  32.1 
 
 
121 aa  44.3  0.0005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.226004  normal  0.0109981 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5441  hypothetical protein  32.1 
 
 
121 aa  44.3  0.0005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1816  hypothetical protein  29.35 
 
 
102 aa  44.3  0.0006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000551329  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1353  hypothetical protein  34.34 
 
 
120 aa  44.3  0.0006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.139683  normal  0.153644 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2129  hypothetical protein  31.87 
 
 
111 aa  43.9  0.0007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5078  hypothetical protein  31.76 
 
 
99 aa  43.9  0.0008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.322327 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1106  hypothetical protein  45.1 
 
 
127 aa  43.5  0.0009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.076779 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1315  hypothetical protein  45.1 
 
 
113 aa  42.7  0.001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3957  hypothetical protein  30.12 
 
 
111 aa  43.1  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00169792  normal  0.0939077 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3578  hypothetical protein  29.59 
 
 
111 aa  43.1  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1261  hypothetical protein  29.55 
 
 
96 aa  42.7  0.002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.247211  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1596  hypothetical protein  36.05 
 
 
123 aa  42.7  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000114337 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4848  hypothetical protein  30.86 
 
 
102 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0013  hypothetical protein  35.38 
 
 
115 aa  42.7  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0282  hypothetical protein  33.73 
 
 
142 aa  42  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4327  hypothetical protein  32.35 
 
 
140 aa  41.2  0.005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.31741  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0214  hypothetical protein  36 
 
 
117 aa  40.8  0.006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5095  hypothetical protein  36.05 
 
 
97 aa  40.4  0.008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.490527  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5492  hypothetical protein  36.05 
 
 
97 aa  40.4  0.008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5078  hypothetical protein  36.05 
 
 
97 aa  40.4  0.008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000186097  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1531  hypothetical protein  30.3 
 
 
105 aa  40.4  0.009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00883847  normal  0.0165491 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1602  hypothetical protein  39.53 
 
 
120 aa  40.4  0.009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.291918  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>