44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_4848 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_4848  hypothetical protein  100 
 
 
102 aa  202  1e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5421  hypothetical protein  99.02 
 
 
121 aa  200  6e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.226004  normal  0.0109981 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5441  hypothetical protein  99.02 
 
 
121 aa  200  6e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4762  hypothetical protein  94.12 
 
 
102 aa  194  4.0000000000000005e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0980147  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0231  hypothetical protein  93.14 
 
 
102 aa  192  1e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2198  membrane-associated protein  67.65 
 
 
102 aa  147  4e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1889  hypothetical protein  49.5 
 
 
112 aa  103  6e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.716507  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2016  hypothetical protein  40 
 
 
99 aa  70.5  0.000000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.18491 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3776  hypothetical protein  38.64 
 
 
108 aa  64.7  0.0000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000562489  hitchhiker  0.00860307 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0575  hypothetical protein  37.84 
 
 
104 aa  62  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0214  hypothetical protein  33.33 
 
 
117 aa  56.2  0.0000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5792  hypothetical protein  28.72 
 
 
101 aa  55.1  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1502  hypothetical protein  30.3 
 
 
116 aa  52.8  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1261  hypothetical protein  26.67 
 
 
96 aa  52.8  0.000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.247211  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5249  hypothetical protein  36.84 
 
 
97 aa  51.2  0.000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0282  hypothetical protein  33.33 
 
 
142 aa  51.6  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5647  hypothetical protein  36.84 
 
 
97 aa  51.2  0.000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5078  hypothetical protein  34.07 
 
 
99 aa  51.2  0.000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.322327 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5526  hypothetical protein  35 
 
 
97 aa  51.2  0.000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5190  hypothetical protein  35 
 
 
97 aa  51.2  0.000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5576  hypothetical protein  35 
 
 
97 aa  51.2  0.000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5520  hypothetical protein  35 
 
 
97 aa  50.8  0.000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1237  hypothetical protein  33.33 
 
 
100 aa  50.8  0.000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000614631  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5431  hypothetical protein  35 
 
 
96 aa  50.8  0.000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3918  hypothetical protein  34.67 
 
 
96 aa  50.8  0.000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5095  hypothetical protein  35.53 
 
 
97 aa  50.4  0.000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.490527  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5492  hypothetical protein  35.53 
 
 
97 aa  50.4  0.000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5078  hypothetical protein  35.53 
 
 
97 aa  50.4  0.000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000186097  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1353  hypothetical protein  28.74 
 
 
120 aa  50.4  0.000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.139683  normal  0.153644 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2651  hypothetical protein  41.54 
 
 
101 aa  49.7  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.123559 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0276  hypothetical protein  26.32 
 
 
103 aa  49.7  0.00001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00194964  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3170  hypothetical protein  31.52 
 
 
99 aa  49.3  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.8741 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1315  hypothetical protein  27.66 
 
 
113 aa  48.1  0.00004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1333  hypothetical protein  39.19 
 
 
156 aa  47.4  0.00006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00349105  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1106  hypothetical protein  27.66 
 
 
127 aa  47.4  0.00007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.076779 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4327  hypothetical protein  27.16 
 
 
140 aa  47.4  0.00007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.31741  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4023  hypothetical protein  28.57 
 
 
116 aa  46.6  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.653706  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1650  hypothetical protein  35.37 
 
 
100 aa  45.1  0.0003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0214311  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2549  hypothetical protein  24.68 
 
 
103 aa  43.5  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1951  inner membrane protein  31.96 
 
 
119 aa  43.1  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0518016  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3889  hypothetical protein  30.86 
 
 
107 aa  42.7  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.993431  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4949  putative transmembrane protein  32.58 
 
 
107 aa  42  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.640095  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11958  hypothetical protein  23.33 
 
 
89 aa  40.8  0.007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3957  hypothetical protein  24.49 
 
 
111 aa  40  0.01  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00169792  normal  0.0939077 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>