73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_4327 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_4327  hypothetical protein  100 
 
 		 140 aa  274  3e-73  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.31741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0282  hypothetical protein  60.34 
 
 		 142 aa  138  1.9999999999999998e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3578  hypothetical protein  53.98 
 
 		 111 aa  110  6e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3957  hypothetical protein  60 
 
 		 111 aa  108  2.0000000000000002e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00169792  normal  0.0939077 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0753  hypothetical protein  47.9 
 
 		 127 aa  97.4  6e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0998951  normal  0.0100681 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0054  hypothetical protein  40.34 
 
 		 145 aa  92  2e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.152097  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4023  hypothetical protein  48.18 
 
 		 116 aa  92.8  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.653706  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1816  hypothetical protein  43.43 
 
 		 102 aa  89.7  1e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000551329  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0829  hypothetical protein  48.11 
 
 		 105 aa  89.7  1e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.45042 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3347  hypothetical protein  46.67 
 
 		 123 aa  83.6  9e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3536  hypothetical protein  43.48 
 
 		 142 aa  79.7  0.00000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000435682  hitchhiker  0.00283491 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5661  hypothetical protein  47.31 
 
 		 100 aa  79.3  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1531  hypothetical protein  48 
 
 		 105 aa  77.8  0.00000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00883847  normal  0.0165491 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24650  hypothetical protein  44.44 
 
 		 114 aa  76.6  0.0000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.757383  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3073  hypothetical protein  41.94 
 
 		 143 aa  73.6  0.0000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.116175 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08790  hypothetical protein  39.05 
 
 		 133 aa  69.7  0.00000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.707108  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1301  hypothetical protein  33.06 
 
 		 125 aa  66.2  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.322737  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3776  hypothetical protein  30.3 
 
 		 108 aa  65.1  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000562489  hitchhiker  0.00860307 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0013  hypothetical protein  38.54 
 
 		 115 aa  65.1  0.0000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3827  hypothetical protein  40.71 
 
 		 119 aa  63.2  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.146373  normal  0.27226 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3915  hypothetical protein  40.71 
 
 		 119 aa  63.2  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.214464  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1974  hypothetical protein  36.7 
 
 		 116 aa  63.2  0.000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.955707  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2549  hypothetical protein  37.07 
 
 		 157 aa  62.8  0.000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.763476  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3841  hypothetical protein  40.71 
 
 		 119 aa  63.2  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0616324  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0165  hypothetical protein  31.82 
 
 		 141 aa  62  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.769455  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0702  hypothetical protein  33.33 
 
 		 134 aa  61.6  0.000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07670  hypothetical protein  36.79 
 
 		 127 aa  61.2  0.000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.10496  normal  0.422177 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28410  hypothetical protein  40.65 
 
 		 136 aa  60.8  0.000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.723045 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4284  hypothetical protein  35.71 
 
 		 114 aa  60.5  0.000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.523579  normal  0.303611 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0276  hypothetical protein  32.32 
 
 		 103 aa  60.1  0.000000009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00194964  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11372  hypothetical protein  33.94 
 
 		 120 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.352268 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1261  hypothetical protein  33.33 
 
 		 96 aa  58.9  0.00000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.247211  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2362  hypothetical protein  35.48 
 
 		 114 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.10199  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5399  hypothetical protein  34.75 
 
 		 135 aa  58.5  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2870  hypothetical protein  27.74 
 
 		 170 aa  57.8  0.00000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0855535  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0648  hypothetical protein  34.41 
 
 		 129 aa  57  0.00000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.672224  normal  0.428961 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3039  hypothetical protein  34.15 
 
 		 147 aa  55.8  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000824128 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5792  hypothetical protein  31.87 
 
 		 101 aa  53.5  0.0000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16480  hypothetical protein  31.01 
 
 		 182 aa  52.8  0.000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.671549  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1889  hypothetical protein  30.68 
 
 		 112 aa  50.8  0.000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.716507  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2577  hypothetical protein  28.57 
 
 		 167 aa  51.2  0.000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000171223 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1237  hypothetical protein  36.59 
 
 		 100 aa  50.4  0.000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000614631  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5078  hypothetical protein  33.71 
 
 		 99 aa  50.1  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.322327 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3918  hypothetical protein  30.59 
 
 		 96 aa  48.5  0.00003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3170  hypothetical protein  29.76 
 
 		 99 aa  48.5  0.00003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.8741 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2549  hypothetical protein  29.89 
 
 		 103 aa  48.1  0.00004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4140  hypothetical protein  31.34 
 
 		 103 aa  47.8  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.193534  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0231  hypothetical protein  27.66 
 
 		 102 aa  47.8  0.00005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4848  hypothetical protein  27.16 
 
 		 102 aa  47.4  0.00006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5492  hypothetical protein  31.18 
 
 		 97 aa  46.2  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5421  hypothetical protein  26.6 
 
 		 121 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.226004  normal  0.0109981 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5441  hypothetical protein  26.6 
 
 		 121 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1333  hypothetical protein  31.63 
 
 		 156 aa  47  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00349105  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5095  hypothetical protein  31.18 
 
 		 97 aa  46.2  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.490527  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5078  hypothetical protein  31.18 
 
 		 97 aa  46.2  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000186097  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5249  hypothetical protein  30.11 
 
 		 97 aa  45.8  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11958  hypothetical protein  21.69 
 
 		 89 aa  45.4  0.0002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2651  hypothetical protein  30.77 
 
 		 101 aa  45.4  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.123559 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5576  hypothetical protein  31.18 
 
 		 97 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5190  hypothetical protein  31.18 
 
 		 97 aa  45.8  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4762  hypothetical protein  27.16 
 
 		 102 aa  45.8  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0980147  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5647  hypothetical protein  30.11 
 
 		 97 aa  45.8  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5526  hypothetical protein  31.18 
 
 		 97 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5520  hypothetical protein  30.11 
 
 		 97 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5431  hypothetical protein  29.41 
 
 		 96 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1650  hypothetical protein  26.19 
 
 		 100 aa  44.3  0.0005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0214311  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2016  hypothetical protein  31.87 
 
 		 99 aa  44.7  0.0005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.18491 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0214  hypothetical protein  32.46 
 
 		 117 aa  42.4  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2198  membrane-associated protein  44.74 
 
 		 102 aa  42  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0575  hypothetical protein  28.05 
 
 		 104 aa  41.2  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3889  hypothetical protein  32.35 
 
 		 107 aa  41.2  0.005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.993431  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4949  putative transmembrane protein  36.76 
 
 		 107 aa  40.8  0.007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.640095  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1266  hypothetical protein  30.59 
 
 		 116 aa  40.4  0.008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.390774  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>