55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_3347 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_3347  hypothetical protein  100 
 
 		 123 aa  236  5.999999999999999e-62  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3957  hypothetical protein  54.35 
 
 		 111 aa  94  6e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00169792  normal  0.0939077 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3578  hypothetical protein  51.61 
 
 		 111 aa  90.9  6e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0282  hypothetical protein  48.45 
 
 		 142 aa  87.4  6e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4023  hypothetical protein  47.47 
 
 		 116 aa  84.7  4e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.653706  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0753  hypothetical protein  49.09 
 
 		 127 aa  84  6e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0998951  normal  0.0100681 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1816  hypothetical protein  41.05 
 
 		 102 aa  83.6  8e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000551329  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4327  hypothetical protein  46.67 
 
 		 140 aa  83.6  9e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.31741  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1531  hypothetical protein  42.11 
 
 		 105 aa  81.6  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00883847  normal  0.0165491 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5661  hypothetical protein  41.84 
 
 		 100 aa  78.2  0.00000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3536  hypothetical protein  40.32 
 
 		 142 aa  75.9  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000435682  hitchhiker  0.00283491 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24650  hypothetical protein  40.62 
 
 		 114 aa  75.1  0.0000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.757383  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0829  hypothetical protein  40.4 
 
 		 105 aa  73.2  0.000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.45042 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11372  hypothetical protein  40.43 
 
 		 120 aa  73.2  0.000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.352268 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0013  hypothetical protein  45.83 
 
 		 115 aa  71.2  0.000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1974  hypothetical protein  37.76 
 
 		 116 aa  68.2  0.00000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.955707  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3073  hypothetical protein  39.58 
 
 		 143 aa  67.4  0.00000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.116175 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2362  hypothetical protein  37.37 
 
 		 114 aa  66.2  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.10199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3827  hypothetical protein  33 
 
 		 119 aa  64.7  0.0000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.146373  normal  0.27226 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3915  hypothetical protein  33 
 
 		 119 aa  64.7  0.0000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.214464  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0054  hypothetical protein  38.39 
 
 		 145 aa  64.7  0.0000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.152097  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3841  hypothetical protein  33 
 
 		 119 aa  64.7  0.0000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0616324  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2549  hypothetical protein  33.59 
 
 		 157 aa  64.3  0.0000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.763476  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4284  hypothetical protein  36.56 
 
 		 114 aa  62.8  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.523579  normal  0.303611 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28410  hypothetical protein  33.63 
 
 		 136 aa  58.2  0.00000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.723045 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1301  hypothetical protein  36 
 
 		 125 aa  57.4  0.00000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.322737  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0648  hypothetical protein  30.25 
 
 		 129 aa  57.4  0.00000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.672224  normal  0.428961 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5399  hypothetical protein  33.63 
 
 		 135 aa  55.8  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0702  hypothetical protein  37.84 
 
 		 134 aa  53.9  0.0000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0165  hypothetical protein  30.7 
 
 		 141 aa  53.1  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.769455  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5078  hypothetical protein  32.56 
 
 		 99 aa  52.8  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.322327 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0276  hypothetical protein  30 
 
 		 103 aa  50.8  0.000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00194964  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3039  hypothetical protein  37.5 
 
 		 147 aa  50.8  0.000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000824128 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0575  hypothetical protein  32.58 
 
 		 104 aa  50.1  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3776  hypothetical protein  27.84 
 
 		 108 aa  49.7  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000562489  hitchhiker  0.00860307 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1889  hypothetical protein  29.21 
 
 		 112 aa  46.6  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.716507  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1261  hypothetical protein  26.74 
 
 		 96 aa  45.8  0.0002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.247211  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2870  hypothetical protein  33.33 
 
 		 170 aa  43.1  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0855535  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07670  hypothetical protein  27 
 
 		 127 aa  42.7  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.10496  normal  0.422177 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08790  hypothetical protein  32.76 
 
 		 133 aa  42.4  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.707108  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3918  hypothetical protein  28.05 
 
 		 96 aa  42.7  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5792  hypothetical protein  26.37 
 
 		 101 aa  42.7  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2549  hypothetical protein  24.18 
 
 		 103 aa  41.6  0.004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5249  hypothetical protein  25.56 
 
 		 97 aa  41.2  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5647  hypothetical protein  25.56 
 
 		 97 aa  41.2  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1333  hypothetical protein  36.99 
 
 		 156 aa  41.2  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00349105  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5492  hypothetical protein  25.56 
 
 		 97 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5095  hypothetical protein  25.56 
 
 		 97 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.490527  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5078  hypothetical protein  25.56 
 
 		 97 aa  41.2  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000186097  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5190  hypothetical protein  25.56 
 
 		 97 aa  40.8  0.007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5526  hypothetical protein  25.56 
 
 		 97 aa  40.8  0.007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5576  hypothetical protein  25.56 
 
 		 97 aa  40.8  0.007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1262  hypothetical protein  32.1 
 
 		 102 aa  40.4  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1237  hypothetical protein  31.82 
 
 		 100 aa  40.4  0.008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000614631  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2016  hypothetical protein  31.76 
 
 		 99 aa  40  0.01  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.18491 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>