65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_5661 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_5661  hypothetical protein  100 
 
 		 100 aa  193  8.000000000000001e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24650  hypothetical protein  54.17 
 
 		 114 aa  105  1e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.757383  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4327  hypothetical protein  51.61 
 
 		 140 aa  96.3  1e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.31741  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0829  hypothetical protein  51 
 
 		 105 aa  91.7  3e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.45042 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3347  hypothetical protein  45.92 
 
 		 123 aa  91.7  3e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0282  hypothetical protein  53.41 
 
 		 142 aa  91.3  4e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3957  hypothetical protein  49.45 
 
 		 111 aa  89.4  1e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00169792  normal  0.0939077 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1531  hypothetical protein  48.96 
 
 		 105 aa  89.4  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00883847  normal  0.0165491 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3536  hypothetical protein  48.94 
 
 		 142 aa  89.7  1e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000435682  hitchhiker  0.00283491 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3578  hypothetical protein  49.45 
 
 		 111 aa  88.6  3e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1816  hypothetical protein  40.21 
 
 		 102 aa  81.6  0.000000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000551329  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1301  hypothetical protein  43.56 
 
 		 125 aa  81.6  0.000000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.322737  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4023  hypothetical protein  42.86 
 
 		 116 aa  73.2  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.653706  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0753  hypothetical protein  47.78 
 
 		 127 aa  71.6  0.000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0998951  normal  0.0100681 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3776  hypothetical protein  36.96 
 
 		 108 aa  71.2  0.000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000562489  hitchhiker  0.00860307 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3073  hypothetical protein  40 
 
 		 143 aa  71.6  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.116175 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2362  hypothetical protein  38.71 
 
 		 114 aa  70.5  0.000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.10199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3827  hypothetical protein  35.05 
 
 		 119 aa  69.7  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.146373  normal  0.27226 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4284  hypothetical protein  39.13 
 
 		 114 aa  69.7  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.523579  normal  0.303611 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3915  hypothetical protein  35.05 
 
 		 119 aa  69.7  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.214464  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3841  hypothetical protein  35.05 
 
 		 119 aa  69.7  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0616324  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1974  hypothetical protein  36.46 
 
 		 116 aa  67.4  0.00000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.955707  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0648  hypothetical protein  38.04 
 
 		 129 aa  65.5  0.0000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.672224  normal  0.428961 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0702  hypothetical protein  42.27 
 
 		 134 aa  65.9  0.0000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11372  hypothetical protein  36.56 
 
 		 120 aa  65.1  0.0000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.352268 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28410  hypothetical protein  45.16 
 
 		 136 aa  64.7  0.0000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.723045 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0013  hypothetical protein  39.81 
 
 		 115 aa  64.3  0.0000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5792  hypothetical protein  32.97 
 
 		 101 aa  61.2  0.000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08790  hypothetical protein  32.38 
 
 		 133 aa  60.5  0.000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.707108  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0054  hypothetical protein  37.78 
 
 		 145 aa  57.4  0.00000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.152097  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5399  hypothetical protein  36.36 
 
 		 135 aa  57.8  0.00000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0165  hypothetical protein  35.09 
 
 		 141 aa  57  0.00000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.769455  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2549  hypothetical protein  36.54 
 
 		 157 aa  56.2  0.0000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.763476  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2549  hypothetical protein  34.07 
 
 		 103 aa  56.2  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6084  hypothetical protein  34.04 
 
 		 124 aa  55.8  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11958  hypothetical protein  33.72 
 
 		 89 aa  55.1  0.0000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07670  hypothetical protein  31.82 
 
 		 127 aa  54.3  0.0000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.10496  normal  0.422177 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5078  hypothetical protein  34.48 
 
 		 99 aa  54.3  0.0000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.322327 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2341  hypothetical protein  30.77 
 
 		 124 aa  53.9  0.0000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.281359  normal  0.49324 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2847  hypothetical protein  33.7 
 
 		 97 aa  53.1  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.460622  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1333  hypothetical protein  38.75 
 
 		 156 aa  52.8  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00349105  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4140  hypothetical protein  36.23 
 
 		 103 aa  51.6  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.193534  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3170  hypothetical protein  30.43 
 
 		 99 aa  52  0.000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.8741 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17180  hypothetical protein  38.24 
 
 		 153 aa  51.2  0.000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.185889  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4949  putative transmembrane protein  35.05 
 
 		 107 aa  50.8  0.000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.640095  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5237  hypothetical protein  32.58 
 
 		 188 aa  50.8  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.109087 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0276  hypothetical protein  28.57 
 
 		 103 aa  50.8  0.000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00194964  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5176  hypothetical protein  36.76 
 
 		 140 aa  50.4  0.000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0667281  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2390  hypothetical protein  34.57 
 
 		 116 aa  50.1  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0727974  normal  0.904998 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4315  membrane protein  34.94 
 
 		 115 aa  47  0.00008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.25101  normal  0.607274 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1951  inner membrane protein  27.96 
 
 		 119 aa  46.6  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0518016  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4304  hypothetical protein  34.48 
 
 		 127 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.617821  normal  0.537638 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1261  hypothetical protein  26.67 
 
 		 96 aa  46.2  0.0001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.247211  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1266  hypothetical protein  29.67 
 
 		 116 aa  45.4  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.390774  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0575  hypothetical protein  28.92 
 
 		 104 aa  44.7  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3039  hypothetical protein  32.99 
 
 		 147 aa  44.7  0.0005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000824128 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2870  hypothetical protein  39.62 
 
 		 170 aa  43.5  0.0009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0855535  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1889  hypothetical protein  32.31 
 
 		 112 aa  42.7  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.716507  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1596  hypothetical protein  28.41 
 
 		 123 aa  43.1  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000114337 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3889  hypothetical protein  31.71 
 
 		 107 aa  42.4  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.993431  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2577  hypothetical protein  37.74 
 
 		 167 aa  42.7  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000171223 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3918  hypothetical protein  30.77 
 
 		 96 aa  41.6  0.003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28530  hypothetical protein  32.93 
 
 		 124 aa  42  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.158089 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1353  hypothetical protein  32 
 
 		 120 aa  41.2  0.005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.139683  normal  0.153644 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4864  export protein  32.58 
 
 		 111 aa  40.4  0.009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.917726  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>