31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_2390 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_2390  hypothetical protein  100 
 
 		 116 aa  225  1e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0727974  normal  0.904998 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4864  export protein  59.6 
 
 		 111 aa  102  2e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.917726  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2278  inner membrane protein  55.1 
 
 		 109 aa  89  2e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2341  hypothetical protein  46.39 
 
 		 124 aa  85.5  2e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.281359  normal  0.49324 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3863  hypothetical protein  47.78 
 
 		 126 aa  81.6  0.000000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.778203  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3937  hypothetical protein  47.78 
 
 		 126 aa  81.6  0.000000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.112267 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3849  hypothetical protein  48.89 
 
 		 126 aa  82  0.000000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00630454 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28530  hypothetical protein  49.46 
 
 		 124 aa  81.3  0.000000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.158089 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4949  putative transmembrane protein  41.18 
 
 		 107 aa  79  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.640095  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6084  hypothetical protein  44.09 
 
 		 124 aa  79  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4331  membrane protein  44.57 
 
 		 148 aa  76.3  0.0000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37260  hypothetical protein  56.44 
 
 		 132 aa  75.9  0.0000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5237  hypothetical protein  41.94 
 
 		 188 aa  74.7  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.109087 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1951  inner membrane protein  42.11 
 
 		 119 aa  74.7  0.0000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0518016  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4304  hypothetical protein  50.5 
 
 		 127 aa  73.9  0.0000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.617821  normal  0.537638 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4315  membrane protein  42.16 
 
 		 115 aa  70.1  0.000000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.25101  normal  0.607274 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1602  hypothetical protein  37.72 
 
 		 120 aa  69.3  0.00000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.291918  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1266  hypothetical protein  42.86 
 
 		 116 aa  67.8  0.00000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.390774  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1596  hypothetical protein  37.78 
 
 		 123 aa  59.7  0.00000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000114337 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24600  hypothetical protein  41.58 
 
 		 168 aa  59.7  0.00000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17180  hypothetical protein  36.27 
 
 		 153 aa  56.6  0.0000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.185889  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0575  hypothetical protein  36.05 
 
 		 104 aa  50.1  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5176  hypothetical protein  40.54 
 
 		 140 aa  48.9  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0667281  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03630  hypothetical protein  36.7 
 
 		 155 aa  46.6  0.0001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5661  hypothetical protein  34.57 
 
 		 100 aa  44.7  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2670  hypothetical protein  29.47 
 
 		 115 aa  43.9  0.0007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24650  hypothetical protein  29.07 
 
 		 114 aa  42.7  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.757383  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11958  hypothetical protein  30.49 
 
 		 89 aa  42  0.003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1333  hypothetical protein  36.49 
 
 		 156 aa  42  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00349105  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2651  hypothetical protein  37.25 
 
 		 101 aa  41.6  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.123559 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2953  hypothetical protein  35.21 
 
 		 116 aa  40.8  0.007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0941351 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>