44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_6084 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_6084  hypothetical protein  100 
 
 		 124 aa  250  4.0000000000000004e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4331  membrane protein  47.32 
 
 		 148 aa  99.8  1e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1951  inner membrane protein  51.52 
 
 		 119 aa  99  2e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0518016  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2341  hypothetical protein  49 
 
 		 124 aa  99.4  2e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.281359  normal  0.49324 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5237  hypothetical protein  51.04 
 
 		 188 aa  95.9  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.109087 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28530  hypothetical protein  52.94 
 
 		 124 aa  93.2  1e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.158089 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3849  hypothetical protein  46.43 
 
 		 126 aa  91.3  4e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00630454 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4304  hypothetical protein  46.79 
 
 		 127 aa  90.1  8e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.617821  normal  0.537638 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1596  hypothetical protein  46.88 
 
 		 123 aa  89.4  1e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000114337 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3863  hypothetical protein  48.98 
 
 		 126 aa  90.1  1e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.778203  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3937  hypothetical protein  48.98 
 
 		 126 aa  90.1  1e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.112267 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4949  putative transmembrane protein  42 
 
 		 107 aa  88.2  3e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.640095  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1602  hypothetical protein  46.08 
 
 		 120 aa  86.3  1e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.291918  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4864  export protein  47.78 
 
 		 111 aa  81.3  0.000000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.917726  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4315  membrane protein  46.61 
 
 		 115 aa  80.1  0.000000000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.25101  normal  0.607274 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2390  hypothetical protein  44.09 
 
 		 116 aa  79  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0727974  normal  0.904998 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24600  hypothetical protein  43.3 
 
 		 168 aa  74.7  0.0000000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1266  hypothetical protein  37.5 
 
 		 116 aa  67.8  0.00000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.390774  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37260  hypothetical protein  42.27 
 
 		 132 aa  67.4  0.00000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2278  inner membrane protein  44.76 
 
 		 109 aa  67  0.00000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03630  hypothetical protein  38 
 
 		 155 aa  60.1  0.00000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5176  hypothetical protein  35.14 
 
 		 140 aa  58.5  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0667281  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17180  hypothetical protein  37 
 
 		 153 aa  54.3  0.0000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.185889  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24650  hypothetical protein  35.56 
 
 		 114 aa  48.9  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.757383  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5661  hypothetical protein  33.33 
 
 		 100 aa  48.9  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3918  hypothetical protein  38.54 
 
 		 96 aa  47.8  0.00004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1333  hypothetical protein  30.36 
 
 		 156 aa  48.1  0.00004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00349105  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3889  hypothetical protein  30.77 
 
 		 107 aa  46.2  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.993431  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3536  hypothetical protein  42.86 
 
 		 142 aa  45.4  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000435682  hitchhiker  0.00283491 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3841  hypothetical protein  30.3 
 
 		 119 aa  43.5  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0616324  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5792  hypothetical protein  32.65 
 
 		 101 aa  43.1  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3915  hypothetical protein  30.3 
 
 		 119 aa  43.5  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.214464  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0575  hypothetical protein  37.5 
 
 		 104 aa  42.7  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3827  hypothetical protein  30.3 
 
 		 119 aa  43.5  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.146373  normal  0.27226 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2847  hypothetical protein  29.35 
 
 		 97 aa  43.1  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.460622  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5520  hypothetical protein  33.33 
 
 		 97 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5431  hypothetical protein  33.33 
 
 		 96 aa  40.8  0.007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5526  hypothetical protein  33.33 
 
 		 97 aa  40.4  0.008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5576  hypothetical protein  33.33 
 
 		 97 aa  40.4  0.008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5190  hypothetical protein  33.33 
 
 		 97 aa  40.4  0.008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5492  hypothetical protein  33 
 
 		 97 aa  40  0.01  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2549  hypothetical protein  34.09 
 
 		 103 aa  40  0.01  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5095  hypothetical protein  33 
 
 		 97 aa  40  0.01  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.490527  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5078  hypothetical protein  33 
 
 		 97 aa  40  0.01  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000186097  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>