53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_24650 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_24650  hypothetical protein  100 
 
 		 114 aa  227  5e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.757383  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1531  hypothetical protein  54.44 
 
 		 105 aa  100  5e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00883847  normal  0.0165491 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3536  hypothetical protein  44.79 
 
 		 142 aa  95.1  3e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000435682  hitchhiker  0.00283491 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0829  hypothetical protein  46.94 
 
 		 105 aa  88.6  2e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.45042 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5661  hypothetical protein  54.17 
 
 		 100 aa  87.8  4e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07670  hypothetical protein  36.63 
 
 		 127 aa  81.3  0.000000000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.10496  normal  0.422177 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4327  hypothetical protein  44.14 
 
 		 140 aa  81.3  0.000000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.31741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0282  hypothetical protein  43.14 
 
 		 142 aa  79.3  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3957  hypothetical protein  50 
 
 		 111 aa  78.6  0.00000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00169792  normal  0.0939077 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08790  hypothetical protein  38.74 
 
 		 133 aa  79  0.00000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.707108  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1816  hypothetical protein  45.36 
 
 		 102 aa  77.8  0.00000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000551329  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3578  hypothetical protein  49.45 
 
 		 111 aa  77.8  0.00000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2362  hypothetical protein  38.95 
 
 		 114 aa  77  0.00000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.10199  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3347  hypothetical protein  40.62 
 
 		 123 aa  74.7  0.0000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4284  hypothetical protein  35.42 
 
 		 114 aa  73.9  0.0000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.523579  normal  0.303611 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1974  hypothetical protein  40.37 
 
 		 116 aa  73.6  0.0000000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.955707  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4023  hypothetical protein  45.36 
 
 		 116 aa  71.6  0.000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.653706  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0648  hypothetical protein  41.51 
 
 		 129 aa  70.1  0.000000000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.672224  normal  0.428961 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11372  hypothetical protein  34.62 
 
 		 120 aa  67.8  0.00000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.352268 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3827  hypothetical protein  35.4 
 
 		 119 aa  67  0.00000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.146373  normal  0.27226 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3915  hypothetical protein  35.4 
 
 		 119 aa  67  0.00000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.214464  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3841  hypothetical protein  35.4 
 
 		 119 aa  67  0.00000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0616324  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3073  hypothetical protein  46.07 
 
 		 143 aa  66.6  0.00000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.116175 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0702  hypothetical protein  36.84 
 
 		 134 aa  60.8  0.000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28410  hypothetical protein  45.56 
 
 		 136 aa  58.9  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.723045 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1301  hypothetical protein  30.56 
 
 		 125 aa  57.4  0.00000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.322737  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5399  hypothetical protein  33.96 
 
 		 135 aa  55.1  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2549  hypothetical protein  37.62 
 
 		 157 aa  55.1  0.0000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.763476  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0753  hypothetical protein  37.5 
 
 		 127 aa  54.7  0.0000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0998951  normal  0.0100681 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3776  hypothetical protein  24.24 
 
 		 108 aa  54.3  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000562489  hitchhiker  0.00860307 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0165  hypothetical protein  35.45 
 
 		 141 aa  53.9  0.0000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.769455  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5792  hypothetical protein  28.12 
 
 		 101 aa  52.4  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0013  hypothetical protein  47.06 
 
 		 115 aa  52.8  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6084  hypothetical protein  32.67 
 
 		 124 aa  49.7  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1889  hypothetical protein  28.57 
 
 		 112 aa  50.1  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.716507  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11958  hypothetical protein  28.24 
 
 		 89 aa  48.9  0.00002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0214  hypothetical protein  30 
 
 		 117 aa  48.9  0.00002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3039  hypothetical protein  36.36 
 
 		 147 aa  48.1  0.00003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000824128 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1333  hypothetical protein  31.11 
 
 		 156 aa  48.1  0.00004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00349105  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0054  hypothetical protein  34.83 
 
 		 145 aa  47.8  0.00005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.152097  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16480  hypothetical protein  28.91 
 
 		 182 aa  46.2  0.0001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.671549  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2577  hypothetical protein  28.69 
 
 		 167 aa  46.2  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000171223 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1502  hypothetical protein  31.46 
 
 		 116 aa  45.4  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2870  hypothetical protein  26.36 
 
 		 170 aa  44.3  0.0005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0855535  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2341  hypothetical protein  28.57 
 
 		 124 aa  44.3  0.0005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.281359  normal  0.49324 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2549  hypothetical protein  25 
 
 		 103 aa  43.9  0.0008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2390  hypothetical protein  29.07 
 
 		 116 aa  43.1  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0727974  normal  0.904998 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4315  membrane protein  34.44 
 
 		 115 aa  42.7  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.25101  normal  0.607274 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4949  putative transmembrane protein  28.89 
 
 		 107 aa  42.7  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.640095  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4140  hypothetical protein  26.47 
 
 		 103 aa  42.7  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.193534  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17180  hypothetical protein  31.52 
 
 		 153 aa  42.7  0.002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.185889  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3918  hypothetical protein  28.41 
 
 		 96 aa  41.2  0.005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1951  inner membrane protein  23.4 
 
 		 119 aa  40.8  0.006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0518016  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>