30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_1266 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_1266  hypothetical protein  100 
 
 		 116 aa  229  1e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.390774  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1951  inner membrane protein  48.98 
 
 		 119 aa  90.1  9e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0518016  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4331  membrane protein  42.48 
 
 		 148 aa  76.3  0.0000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2341  hypothetical protein  41.94 
 
 		 124 aa  73.9  0.0000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.281359  normal  0.49324 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28530  hypothetical protein  42 
 
 		 124 aa  69.3  0.00000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.158089 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1602  hypothetical protein  34.51 
 
 		 120 aa  69.3  0.00000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.291918  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2390  hypothetical protein  42.86 
 
 		 116 aa  67.8  0.00000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0727974  normal  0.904998 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6084  hypothetical protein  37.5 
 
 		 124 aa  67.8  0.00000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4949  putative transmembrane protein  44.19 
 
 		 107 aa  66.6  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.640095  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4315  membrane protein  40.78 
 
 		 115 aa  66.2  0.0000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.25101  normal  0.607274 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4864  export protein  40.54 
 
 		 111 aa  65.5  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.917726  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1596  hypothetical protein  37.63 
 
 		 123 aa  65.5  0.0000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000114337 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17180  hypothetical protein  39.77 
 
 		 153 aa  62  0.000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.185889  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4304  hypothetical protein  43.16 
 
 		 127 aa  61.2  0.000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.617821  normal  0.537638 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3849  hypothetical protein  33.33 
 
 		 126 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00630454 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37260  hypothetical protein  38.46 
 
 		 132 aa  56.2  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24600  hypothetical protein  44.44 
 
 		 168 aa  56.2  0.0000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03630  hypothetical protein  39.39 
 
 		 155 aa  55.5  0.0000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3937  hypothetical protein  33.33 
 
 		 126 aa  56.2  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.112267 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3863  hypothetical protein  33.33 
 
 		 126 aa  56.2  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.778203  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5237  hypothetical protein  38.27 
 
 		 188 aa  51.2  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.109087 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5176  hypothetical protein  35.8 
 
 		 140 aa  47.4  0.00007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0667281  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11958  hypothetical protein  27.63 
 
 		 89 aa  46.6  0.0001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2278  inner membrane protein  37.78 
 
 		 109 aa  43.1  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5661  hypothetical protein  29.67 
 
 		 100 aa  43.1  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2847  hypothetical protein  31.33 
 
 		 97 aa  43.1  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.460622  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1333  hypothetical protein  34.72 
 
 		 156 aa  41.2  0.005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00349105  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3776  hypothetical protein  35.06 
 
 		 108 aa  41.2  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000562489  hitchhiker  0.00860307 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5078  hypothetical protein  33.78 
 
 		 99 aa  40.4  0.008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.322327 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4327  hypothetical protein  30.59 
 
 		 140 aa  40.4  0.008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.31741  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>