66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_5078 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_5078  hypothetical protein  100 
 
 		 99 aa  196  1.0000000000000001e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.322327 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3776  hypothetical protein  52.13 
 
 		 108 aa  104  3e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000562489  hitchhiker  0.00860307 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1261  hypothetical protein  51.65 
 
 		 96 aa  97.8  4e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.247211  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2549  hypothetical protein  51.58 
 
 		 103 aa  97.4  6e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5095  hypothetical protein  52.27 
 
 		 97 aa  95.1  3e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.490527  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5078  hypothetical protein  52.27 
 
 		 97 aa  95.1  3e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000186097  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5492  hypothetical protein  52.27 
 
 		 97 aa  95.1  3e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5647  hypothetical protein  51.14 
 
 		 97 aa  94.7  4e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5249  hypothetical protein  51.14 
 
 		 97 aa  94.7  4e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5526  hypothetical protein  52.27 
 
 		 97 aa  94.4  5e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5576  hypothetical protein  52.27 
 
 		 97 aa  94.4  5e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5190  hypothetical protein  52.27 
 
 		 97 aa  94.4  5e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0575  hypothetical protein  48.86 
 
 		 104 aa  94  6e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5431  hypothetical protein  52.27 
 
 		 96 aa  94  6e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5520  hypothetical protein  52.27 
 
 		 97 aa  94  6e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0276  hypothetical protein  48.31 
 
 		 103 aa  93.6  8e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00194964  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3170  hypothetical protein  51.14 
 
 		 99 aa  92.4  2e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.8741 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3918  hypothetical protein  51.14 
 
 		 96 aa  91.7  3e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5792  hypothetical protein  48.39 
 
 		 101 aa  91.3  4e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11958  hypothetical protein  44.83 
 
 		 89 aa  87  7e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1353  hypothetical protein  41.67 
 
 		 120 aa  77  0.00000000000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.139683  normal  0.153644 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2651  hypothetical protein  47.25 
 
 		 101 aa  76.3  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.123559 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1106  hypothetical protein  41.38 
 
 		 127 aa  73.9  0.0000000000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.076779 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1315  hypothetical protein  41.11 
 
 		 113 aa  72.4  0.000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4140  hypothetical protein  49.47 
 
 		 103 aa  70.1  0.000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.193534  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1237  hypothetical protein  47.44 
 
 		 100 aa  68.6  0.00000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000614631  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1262  hypothetical protein  41.11 
 
 		 102 aa  68.6  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2847  hypothetical protein  38.2 
 
 		 97 aa  65.9  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.460622  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2129  hypothetical protein  41.57 
 
 		 111 aa  61.2  0.000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1333  hypothetical protein  32.94 
 
 		 156 aa  60.8  0.000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00349105  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4848  hypothetical protein  34.07 
 
 		 102 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1889  hypothetical protein  34 
 
 		 112 aa  60.1  0.00000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.716507  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3957  hypothetical protein  32.95 
 
 		 111 aa  60.1  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00169792  normal  0.0939077 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3347  hypothetical protein  32.56 
 
 		 123 aa  59.3  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4762  hypothetical protein  34.07 
 
 		 102 aa  58.2  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0980147  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1650  hypothetical protein  40 
 
 		 100 aa  58.2  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0214311  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5441  hypothetical protein  34.57 
 
 		 121 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5421  hypothetical protein  34.57 
 
 		 121 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.226004  normal  0.0109981 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0231  hypothetical protein  33.33 
 
 		 102 aa  57  0.00000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1951  inner membrane protein  39.74 
 
 		 119 aa  57  0.00000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0518016  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4327  hypothetical protein  33.71 
 
 		 140 aa  56.6  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.31741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3578  hypothetical protein  32.61 
 
 		 111 aa  56.2  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1502  hypothetical protein  35.87 
 
 		 116 aa  55.5  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2198  membrane-associated protein  34.07 
 
 		 102 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5176  hypothetical protein  30 
 
 		 140 aa  55.1  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0667281  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0282  hypothetical protein  32.58 
 
 		 142 aa  54.7  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0753  hypothetical protein  38.04 
 
 		 127 aa  54.3  0.0000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0998951  normal  0.0100681 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0054  hypothetical protein  29.47 
 
 		 145 aa  53.5  0.0000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.152097  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5661  hypothetical protein  34.48 
 
 		 100 aa  53.1  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2341  hypothetical protein  34.88 
 
 		 124 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.281359  normal  0.49324 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1816  hypothetical protein  23.66 
 
 		 102 aa  52  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000551329  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0214  hypothetical protein  35.71 
 
 		 117 aa  52  0.000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3889  hypothetical protein  31.76 
 
 		 107 aa  51.6  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.993431  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2016  hypothetical protein  33.72 
 
 		 99 aa  51.2  0.000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.18491 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4315  membrane protein  38.46 
 
 		 115 aa  51.2  0.000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.25101  normal  0.607274 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1266  hypothetical protein  33.78 
 
 		 116 aa  50.8  0.000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.390774  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3536  hypothetical protein  38.64 
 
 		 142 aa  50.4  0.000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000435682  hitchhiker  0.00283491 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4331  membrane protein  34.48 
 
 		 148 aa  48.5  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2390  hypothetical protein  33.33 
 
 		 116 aa  47.4  0.00007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0727974  normal  0.904998 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6084  hypothetical protein  31.58 
 
 		 124 aa  44.7  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1301  hypothetical protein  25.51 
 
 		 125 aa  43.9  0.0007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.322737  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1596  hypothetical protein  32.29 
 
 		 123 aa  43.1  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000114337 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2670  hypothetical protein  36.71 
 
 		 115 aa  43.1  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24650  hypothetical protein  25.29 
 
 		 114 aa  42.7  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.757383  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5399  hypothetical protein  25.49 
 
 		 135 aa  40.8  0.006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5237  hypothetical protein  32.53 
 
 		 188 aa  40.4  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.109087 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>