60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_3170 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_3170  hypothetical protein  100 
 
 
99 aa  197  3e-50  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.8741 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0276  hypothetical protein  44 
 
 
103 aa  89  2e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00194964  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1261  hypothetical protein  47.06 
 
 
96 aa  88.2  3e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.247211  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2651  hypothetical protein  40.21 
 
 
101 aa  81.3  0.000000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.123559 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3776  hypothetical protein  40.62 
 
 
108 aa  79.3  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000562489  hitchhiker  0.00860307 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5078  hypothetical protein  51.14 
 
 
99 aa  77.4  0.00000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.322327 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11958  hypothetical protein  44.19 
 
 
89 aa  77  0.00000000000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0575  hypothetical protein  47.44 
 
 
104 aa  76.6  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1650  hypothetical protein  41.57 
 
 
100 aa  76.3  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0214311  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5095  hypothetical protein  42.05 
 
 
97 aa  76.3  0.0000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.490527  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5078  hypothetical protein  42.05 
 
 
97 aa  76.3  0.0000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000186097  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5492  hypothetical protein  42.05 
 
 
97 aa  76.3  0.0000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1353  hypothetical protein  48.86 
 
 
120 aa  76.6  0.0000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.139683  normal  0.153644 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5249  hypothetical protein  40.91 
 
 
97 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5431  hypothetical protein  45.05 
 
 
96 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5520  hypothetical protein  44.57 
 
 
97 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5576  hypothetical protein  44.57 
 
 
97 aa  75.5  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5190  hypothetical protein  44.57 
 
 
97 aa  75.5  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5526  hypothetical protein  44.57 
 
 
97 aa  75.5  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5647  hypothetical protein  40.91 
 
 
97 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3918  hypothetical protein  45.05 
 
 
96 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2549  hypothetical protein  35.56 
 
 
103 aa  67.4  0.00000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1262  hypothetical protein  43.82 
 
 
102 aa  66.6  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1315  hypothetical protein  40 
 
 
113 aa  64.7  0.0000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2129  hypothetical protein  38.89 
 
 
111 aa  64.7  0.0000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1106  hypothetical protein  42.31 
 
 
127 aa  63.9  0.0000000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.076779 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1333  hypothetical protein  37.63 
 
 
156 aa  63.2  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00349105  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3889  hypothetical protein  36 
 
 
107 aa  60.5  0.000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.993431  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5792  hypothetical protein  35.71 
 
 
101 aa  60.1  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2847  hypothetical protein  37.11 
 
 
97 aa  60.1  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.460622  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5176  hypothetical protein  38.37 
 
 
140 aa  57  0.00000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0667281  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1502  hypothetical protein  33.68 
 
 
116 aa  57  0.00000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0214  hypothetical protein  36.25 
 
 
117 aa  56.6  0.0000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1889  hypothetical protein  34.94 
 
 
112 aa  55.5  0.0000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.716507  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0054  hypothetical protein  32.56 
 
 
145 aa  56.2  0.0000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.152097  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3957  hypothetical protein  31.82 
 
 
111 aa  54.3  0.0000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00169792  normal  0.0939077 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3578  hypothetical protein  30.34 
 
 
111 aa  51.6  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4140  hypothetical protein  35.82 
 
 
103 aa  50.1  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.193534  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4848  hypothetical protein  31.52 
 
 
102 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4327  hypothetical protein  29.76 
 
 
140 aa  48.5  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.31741  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4331  membrane protein  30.69 
 
 
148 aa  48.9  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1237  hypothetical protein  34.57 
 
 
100 aa  48.1  0.00004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000614631  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0282  hypothetical protein  30.26 
 
 
142 aa  48.1  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1951  inner membrane protein  36.84 
 
 
119 aa  47.4  0.00006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0518016  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0231  hypothetical protein  33.75 
 
 
102 aa  47.8  0.00006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5421  hypothetical protein  33.33 
 
 
121 aa  47.4  0.00006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.226004  normal  0.0109981 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5441  hypothetical protein  33.33 
 
 
121 aa  47.4  0.00006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4762  hypothetical protein  30.43 
 
 
102 aa  47  0.00008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0980147  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2198  membrane-associated protein  31.52 
 
 
102 aa  46.6  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5661  hypothetical protein  28.99 
 
 
100 aa  45.8  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1816  hypothetical protein  25.29 
 
 
102 aa  45.4  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000551329  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0013  hypothetical protein  27.55 
 
 
115 aa  45.1  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4949  putative transmembrane protein  34.02 
 
 
107 aa  45.1  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.640095  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1602  hypothetical protein  32.95 
 
 
120 aa  45.1  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.291918  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2016  hypothetical protein  27.96 
 
 
99 aa  44.7  0.0004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.18491 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1596  hypothetical protein  34.09 
 
 
123 aa  43.1  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000114337 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0702  hypothetical protein  24.76 
 
 
134 aa  42.7  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5237  hypothetical protein  33.72 
 
 
188 aa  42  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.109087 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3073  hypothetical protein  23.33 
 
 
143 aa  41.2  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.116175 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17180  hypothetical protein  26.32 
 
 
153 aa  41.2  0.005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.185889  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>