42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_5441 on replicon NC_008061
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008543  Bcen2424_5421  hypothetical protein  100 
 
 
121 aa  241  3e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.226004  normal  0.0109981 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5441  hypothetical protein  100 
 
 
121 aa  241  3e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4848  hypothetical protein  99.02 
 
 
102 aa  200  5e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4762  hypothetical protein  95.1 
 
 
102 aa  195  2.0000000000000003e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0980147  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0231  hypothetical protein  94.12 
 
 
102 aa  194  3e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2198  membrane-associated protein  68.63 
 
 
102 aa  149  1e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1889  hypothetical protein  50 
 
 
112 aa  106  1e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.716507  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2016  hypothetical protein  39.13 
 
 
99 aa  69.7  0.00000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.18491 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3776  hypothetical protein  34 
 
 
108 aa  62.8  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000562489  hitchhiker  0.00860307 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0575  hypothetical protein  37.84 
 
 
104 aa  61.2  0.000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0214  hypothetical protein  33.33 
 
 
117 aa  57  0.00000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1261  hypothetical protein  26.67 
 
 
96 aa  53.1  0.000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.247211  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5792  hypothetical protein  28.72 
 
 
101 aa  53.1  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1237  hypothetical protein  35.14 
 
 
100 aa  52.4  0.000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000614631  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1353  hypothetical protein  30.23 
 
 
120 aa  52.4  0.000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.139683  normal  0.153644 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1502  hypothetical protein  30.3 
 
 
116 aa  52.4  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0282  hypothetical protein  30.84 
 
 
142 aa  52.4  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5576  hypothetical protein  34.18 
 
 
97 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5190  hypothetical protein  34.18 
 
 
97 aa  50.1  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5249  hypothetical protein  36 
 
 
97 aa  50.1  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1315  hypothetical protein  28.72 
 
 
113 aa  49.7  0.00001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5526  hypothetical protein  34.18 
 
 
97 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5647  hypothetical protein  36 
 
 
97 aa  50.1  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1106  hypothetical protein  28.72 
 
 
127 aa  49.7  0.00001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.076779 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3918  hypothetical protein  33.33 
 
 
96 aa  49.3  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1333  hypothetical protein  39.19 
 
 
156 aa  48.9  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00349105  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5520  hypothetical protein  34.18 
 
 
97 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5431  hypothetical protein  34.18 
 
 
96 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5492  hypothetical protein  34.67 
 
 
97 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5078  hypothetical protein  34.67 
 
 
97 aa  48.9  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000186097  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5095  hypothetical protein  34.67 
 
 
97 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.490527  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0276  hypothetical protein  26.32 
 
 
103 aa  48.5  0.00003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00194964  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2651  hypothetical protein  40 
 
 
101 aa  48.1  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.123559 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5078  hypothetical protein  32.97 
 
 
99 aa  48.5  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.322327 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3170  hypothetical protein  33.33 
 
 
99 aa  47.4  0.00006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.8741 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4327  hypothetical protein  26.6 
 
 
140 aa  46.6  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.31741  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4023  hypothetical protein  28.57 
 
 
116 aa  45.1  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.653706  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2549  hypothetical protein  27.63 
 
 
103 aa  45.1  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1650  hypothetical protein  35.37 
 
 
100 aa  44.7  0.0004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0214311  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3889  hypothetical protein  32.1 
 
 
107 aa  44.3  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.993431  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1951  inner membrane protein  32.04 
 
 
119 aa  44.3  0.0006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0518016  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4949  putative transmembrane protein  32.58 
 
 
107 aa  41.6  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.640095  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>