44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_1531 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_1531  hypothetical protein  100 
 
 		 105 aa  211  3.9999999999999995e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00883847  normal  0.0165491 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0829  hypothetical protein  56.44 
 
 		 105 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.45042 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24650  hypothetical protein  54.44 
 
 		 114 aa  100  1e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.757383  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3578  hypothetical protein  48.57 
 
 		 111 aa  86.3  1e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3347  hypothetical protein  42.11 
 
 		 123 aa  81.6  0.000000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3957  hypothetical protein  46.67 
 
 		 111 aa  80.9  0.000000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00169792  normal  0.0939077 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4327  hypothetical protein  48 
 
 		 140 aa  77.8  0.00000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.31741  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0702  hypothetical protein  38.1 
 
 		 134 aa  77.4  0.00000000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5661  hypothetical protein  48.96 
 
 		 100 aa  77.4  0.00000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07670  hypothetical protein  38.54 
 
 		 127 aa  76.6  0.0000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.10496  normal  0.422177 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1816  hypothetical protein  43.43 
 
 		 102 aa  74.7  0.0000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000551329  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3915  hypothetical protein  39.18 
 
 		 119 aa  73.6  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.214464  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3827  hypothetical protein  39.18 
 
 		 119 aa  73.6  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.146373  normal  0.27226 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3841  hypothetical protein  39.18 
 
 		 119 aa  73.6  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0616324  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11372  hypothetical protein  36.36 
 
 		 120 aa  72.4  0.000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.352268 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4023  hypothetical protein  46.39 
 
 		 116 aa  72.4  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.653706  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08790  hypothetical protein  36.28 
 
 		 133 aa  72  0.000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.707108  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0282  hypothetical protein  47.25 
 
 		 142 aa  70.9  0.000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1974  hypothetical protein  38.78 
 
 		 116 aa  69.7  0.00000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.955707  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2577  hypothetical protein  35.88 
 
 		 167 aa  68.9  0.00000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000171223 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2362  hypothetical protein  37.11 
 
 		 114 aa  69.3  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.10199  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0648  hypothetical protein  35.87 
 
 		 129 aa  68.9  0.00000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.672224  normal  0.428961 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2549  hypothetical protein  38.18 
 
 		 157 aa  68.2  0.00000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.763476  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3536  hypothetical protein  40.43 
 
 		 142 aa  68.6  0.00000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000435682  hitchhiker  0.00283491 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0753  hypothetical protein  38.68 
 
 		 127 aa  65.5  0.0000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0998951  normal  0.0100681 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2870  hypothetical protein  32.06 
 
 		 170 aa  64.7  0.0000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0855535  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4284  hypothetical protein  32.99 
 
 		 114 aa  64.3  0.0000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.523579  normal  0.303611 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3073  hypothetical protein  35.64 
 
 		 143 aa  60.8  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.116175 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0013  hypothetical protein  38.1 
 
 		 115 aa  60.5  0.000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1301  hypothetical protein  31.68 
 
 		 125 aa  60.5  0.000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.322737  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28410  hypothetical protein  40.66 
 
 		 136 aa  58.5  0.00000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.723045 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16480  hypothetical protein  31.54 
 
 		 182 aa  57.8  0.00000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.671549  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5399  hypothetical protein  31.97 
 
 		 135 aa  56.2  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0165  hypothetical protein  30.77 
 
 		 141 aa  55.8  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.769455  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5792  hypothetical protein  32.22 
 
 		 101 aa  53.5  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3776  hypothetical protein  26.73 
 
 		 108 aa  50.4  0.000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000562489  hitchhiker  0.00860307 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0054  hypothetical protein  35.87 
 
 		 145 aa  48.1  0.00004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.152097  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4140  hypothetical protein  29.58 
 
 		 103 aa  46.6  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.193534  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3039  hypothetical protein  31.48 
 
 		 147 aa  45.1  0.0004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000824128 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3918  hypothetical protein  27.91 
 
 		 96 aa  42.7  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4949  putative transmembrane protein  36.23 
 
 		 107 aa  42.7  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.640095  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2549  hypothetical protein  24.18 
 
 		 103 aa  42  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1333  hypothetical protein  27.66 
 
 		 156 aa  41.6  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00349105  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3889  hypothetical protein  30.3 
 
 		 107 aa  40.4  0.009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.993431  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>