36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_2549 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_2549  hypothetical protein  100 
 
 
157 aa  311  1.9999999999999998e-84  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.763476  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0702  hypothetical protein  55.56 
 
 
134 aa  124  5e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3039  hypothetical protein  58.25 
 
 
147 aa  107  6e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000824128 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28410  hypothetical protein  48.41 
 
 
136 aa  104  4e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.723045 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2577  hypothetical protein  43.38 
 
 
167 aa  103  7e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000171223 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0648  hypothetical protein  50.46 
 
 
129 aa  103  8e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.672224  normal  0.428961 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2870  hypothetical protein  41.91 
 
 
170 aa  103  1e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0855535  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16480  hypothetical protein  42.75 
 
 
182 aa  94.4  6e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.671549  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11372  hypothetical protein  34.43 
 
 
120 aa  81.3  0.000000000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.352268 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0753  hypothetical protein  45.76 
 
 
127 aa  78.6  0.00000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0998951  normal  0.0100681 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2362  hypothetical protein  35.9 
 
 
114 aa  73.6  0.0000000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.10199  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1974  hypothetical protein  34.43 
 
 
116 aa  72.4  0.000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.955707  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4284  hypothetical protein  33.33 
 
 
114 aa  70.9  0.000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.523579  normal  0.303611 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3578  hypothetical protein  44.64 
 
 
111 aa  70.1  0.00000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1301  hypothetical protein  35.45 
 
 
125 aa  68.6  0.00000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.322737  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0829  hypothetical protein  43 
 
 
105 aa  68.9  0.00000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.45042 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3957  hypothetical protein  46.94 
 
 
111 aa  67.8  0.00000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00169792  normal  0.0939077 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1531  hypothetical protein  37.04 
 
 
105 aa  67.8  0.00000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00883847  normal  0.0165491 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3536  hypothetical protein  37.06 
 
 
142 aa  67.4  0.00000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000435682  hitchhiker  0.00283491 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0165  hypothetical protein  35.77 
 
 
141 aa  67  0.0000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.769455  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5399  hypothetical protein  38.02 
 
 
135 aa  66.2  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4327  hypothetical protein  36.09 
 
 
140 aa  64.7  0.0000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.31741  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3827  hypothetical protein  32.54 
 
 
119 aa  63.9  0.0000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.146373  normal  0.27226 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3915  hypothetical protein  32.54 
 
 
119 aa  63.9  0.0000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.214464  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3841  hypothetical protein  32.54 
 
 
119 aa  63.9  0.0000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0616324  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08790  hypothetical protein  33.6 
 
 
133 aa  63.2  0.000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.707108  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3347  hypothetical protein  35.48 
 
 
123 aa  62.8  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3073  hypothetical protein  36.7 
 
 
143 aa  60.5  0.000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.116175 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0054  hypothetical protein  41.24 
 
 
145 aa  59.7  0.00000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.152097  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07670  hypothetical protein  36.11 
 
 
127 aa  58.2  0.00000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.10496  normal  0.422177 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0282  hypothetical protein  32.06 
 
 
142 aa  58.2  0.00000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1816  hypothetical protein  33.98 
 
 
102 aa  57.8  0.00000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000551329  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0013  hypothetical protein  32.38 
 
 
115 aa  53.9  0.0000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24650  hypothetical protein  37.62 
 
 
114 aa  52.8  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.757383  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4023  hypothetical protein  35.96 
 
 
116 aa  50.8  0.000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.653706  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5661  hypothetical protein  37.5 
 
 
100 aa  45.4  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>