More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_1397 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013515  Smon_1397  ABC transporter related protein  100 
 
 		 515 aa  991    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1885  ABC transporter related protein  28.6 
 
 		 618 aa  149  1.0000000000000001e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3519  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  32.3 
 
 		 1019 aa  145  1e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12850  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  25.76 
 
 		 608 aa  141  3e-32  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.813218  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3379  ABC transporter transmembrane region  25.82 
 
 		 646 aa  139  8.999999999999999e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1653  bacteriocin/lantibiotic ABC transporter  28.64 
 
 		 722 aa  139  2e-31  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.521591  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0757  ABC transporter related  28.11 
 
 		 586 aa  137  4e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000135449  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2857  cyclic nucleotide-binding protein  36.1 
 
 		 1038 aa  137  5e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.590453  hitchhiker  0.00593059 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3264  cyclic nucleotide-binding protein  36.1 
 
 		 1038 aa  137  5e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0719  bacteriocin ABC transporter, ATP-binding/permease protein, putative  31.75 
 
 		 717 aa  135  1.9999999999999998e-30  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00348631  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4067  ABC transporter related  26.38 
 
 		 596 aa  134  3e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00142757  normal  0.169154 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0084  bacteriocin-processing peptidase  27.32 
 
 		 715 aa  134  3.9999999999999996e-30  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2306  ABC transporter related  29.69 
 
 		 610 aa  134  5e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.306403 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0343  ABC transporter related  31.44 
 
 		 544 aa  134  5e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0501517  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0417  ABC transporter related  27.42 
 
 		 597 aa  134  5e-30  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0787  lipid export ABC transport protein  28.19 
 
 		 572 aa  133  6e-30  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.113646  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0313  ABC transporter, ATP-binding/membrane-spanning protein  29.89 
 
 		 590 aa  133  7.999999999999999e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0018  ABC transporter related  24.72 
 
 		 573 aa  133  9e-30  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09021  ABC transporter  28.12 
 
 		 548 aa  133  9e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0942  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  29.02 
 
 		 586 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.785069  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4432  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  28.85 
 
 		 548 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000325117  normal  0.0473884 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0421  ABC transporter related  25.68 
 
 		 600 aa  132  1.0000000000000001e-29  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0167  ABC-type bacteriocin transporter family protein  34.04 
 
 		 739 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0758  multidrug ABC transporter, ATP-binding protein and permease  29.02 
 
 		 586 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0945  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  29.02 
 
 		 586 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.580157 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0495  uncharacterized ABC transporter, ATPase component  26.12 
 
 		 618 aa  132  2.0000000000000002e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1213  type I secretion system ATPase  30.21 
 
 		 738 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.466678  n/a   
 
 
-
 
NC_008503  LACR_A02  bacteriocin-processing peptidase  38.15 
 
 		 716 aa  132  2.0000000000000002e-29  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0906  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  29.02 
 
 		 586 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000129836  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1033  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  29.02 
 
 		 586 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000502591  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0751  multidrug ABC transporter, ATP-binding protein and permease  29.25 
 
 		 586 aa  131  3e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4342  ABC transporter, transmembrane region  26.5 
 
 		 626 aa  131  3e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.441734  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0339  ABC transporter-like protein  26.75 
 
 		 695 aa  131  3e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2015  ABC transporter related  23.83 
 
 		 631 aa  131  4.0000000000000003e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.945643  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2816  ABC transporter ATPase  24.29 
 
 		 588 aa  130  5.0000000000000004e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.372787  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1097  bacteriocin-processing peptidase  28.81 
 
 		 1042 aa  130  5.0000000000000004e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.610594  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3062  type I secretion system ATPase  29.69 
 
 		 767 aa  130  6e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0809  ABC transporter ATP-binding/permease  28.8 
 
 		 586 aa  130  6e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00766142  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0852  ABC transporter permease/ATP-binding protein  28.8 
 
 		 586 aa  130  6e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2460  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  27.1 
 
 		 598 aa  130  7.000000000000001e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2276  ABC transporter ATP-binding/permease  27.1 
 
 		 598 aa  130  7.000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.406907  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0584  ABC transporter transmembrane region  26.03 
 
 		 582 aa  130  7.000000000000001e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.321607  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2444  ABC transporter permease/ATP-binding protein  27.1 
 
 		 598 aa  130  7.000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.290529  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0507  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  25.88 
 
 		 618 aa  130  7.000000000000001e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2236  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  27.1 
 
 		 598 aa  130  8.000000000000001e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0563945  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0591  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  30.51 
 
 		 564 aa  129  9.000000000000001e-29  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.234027  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2193  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  27.1 
 
 		 598 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0325354  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0351  ABC transporter related protein  29.14 
 
 		 526 aa  128  2.0000000000000002e-28  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1304  ABC transporter related  27.61 
 
 		 602 aa  128  2.0000000000000002e-28  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1339  ABC transporter related  29.79 
 
 		 572 aa  128  2.0000000000000002e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.491462  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0159  ABC transporter related  25 
 
 		 541 aa  128  3e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0856  ABC transporter related  25.93 
 
 		 626 aa  127  3e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0973  multidrug ABC transporter  28.97 
 
 		 568 aa  127  3e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3307  ABC transporter related  27.11 
 
 		 585 aa  127  3e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.233866  decreased coverage  0.00000537626 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1526  ABC transporter related  27.41 
 
 		 597 aa  127  4.0000000000000003e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00462588  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0649  ABC transporter transmembrane region  26.05 
 
 		 597 aa  127  5e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.564007  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0117  ABC transporter related  27.59 
 
 		 573 aa  127  5e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.00018995  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0685  ABC transporter-related protein  28.12 
 
 		 584 aa  127  6e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.234722  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0047  ABC transporter-like protein  27.65 
 
 		 586 aa  127  6e-28  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.99996 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2618  ABC transporter related  26.76 
 
 		 617 aa  127  6e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000100526  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3347  ABC-type bacteriocin transporter  30.71 
 
 		 721 aa  127  6e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0880292 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2932  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  27.31 
 
 		 598 aa  127  6e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00230756 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3423  ABC transporter-related protein  26.89 
 
 		 611 aa  127  7e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000173526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0624  ABC transporter, transmembrane region  26.05 
 
 		 597 aa  126  8.000000000000001e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3501  ABC transporter related  28.27 
 
 		 575 aa  126  9e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2475  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  26.88 
 
 		 598 aa  126  9e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00961334  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4763  ABC transporter related  26.85 
 
 		 591 aa  126  9e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.116722  normal  0.0159357 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02349  ABC transporter, ATP-binding protein  25.7 
 
 		 598 aa  125  1e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0135  ABC transporter-like  27.87 
 
 		 721 aa  126  1e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1495  ABC transporter-like protein protein  25.34 
 
 		 578 aa  126  1e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.155275  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1327  ATPase  28.84 
 
 		 604 aa  125  1e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.0000000155487  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1091  ABC transporter related  25.66 
 
 		 870 aa  125  1e-27  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3555  ABC transporter related  25.47 
 
 		 584 aa  125  1e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.530108  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0688  ABC transporter related  29.58 
 
 		 559 aa  126  1e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2401  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  27.1 
 
 		 598 aa  126  1e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1192  ABC transporter related  26.09 
 
 		 625 aa  125  1e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00890  fused cysteine transporter subunits of ABC superfamily: membrane component/ATP-binding component  25.23 
 
 		 573 aa  125  2e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.140695  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1141  lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  28.08 
 
 		 586 aa  125  2e-27  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4572  ABC transporter, transmembrane region  25.59 
 
 		 546 aa  125  2e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0990  cysteine/glutathione ABC transporter membrane/ATP-binding component  25.23 
 
 		 573 aa  125  2e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.034293  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4140  ABC transporter-related protein  30.8 
 
 		 726 aa  125  2e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00897  hypothetical protein  25.23 
 
 		 573 aa  125  2e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.17678  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2710  cysteine/glutathione ABC transporter membrane/ATP-binding component  25.23 
 
 		 573 aa  125  2e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00743956  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0534  bacteriocin-processing peptidase  27.02 
 
 		 727 aa  125  2e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0782715  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2235  cysteine/glutathione ABC transporter membrane/ATP-binding component  25.23 
 
 		 573 aa  124  3e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.228638  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_964  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  25.21 
 
 		 637 aa  124  3e-27  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.600764  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1446  leukotoxin translocation ATP-binding protein LktB  31.22 
 
 		 699 aa  124  3e-27  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0404979  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2250  ABC transporter related  27.31 
 
 		 598 aa  124  3e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0582239  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10431  ABC transporter  29.17 
 
 		 548 aa  124  3e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3808  ABC transporter related  24.46 
 
 		 567 aa  124  3e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0584709  normal  0.445528 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0672  ABC transporter related  27.39 
 
 		 578 aa  124  4e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2316  type I secretion system ATPase  30.27 
 
 		 724 aa  124  4e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4200  ABC transporter related  23.82 
 
 		 566 aa  124  4e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.737412  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2693  type I secretion system ATPase  30.27 
 
 		 724 aa  124  4e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0888  ABC transporter related  28.63 
 
 		 593 aa  124  4e-27  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.315462  hitchhiker  0.00000912514 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1494  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  28.93 
 
 		 630 aa  124  5e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.283216  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1695  ABC transporter related  25.92 
 
 		 593 aa  124  5e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.155149 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02525  hypothetical protein  35.44 
 
 		 592 aa  124  5e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4099  type I secretion system ATPase  29.5 
 
 		 725 aa  124  5e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0033  ABC transporter related protein  27.23 
 
 		 569 aa  124  5e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>