118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_1941 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_1941  periplasmic binding protein  100 
 
 		 349 aa  687    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.789164  normal  0.251316 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4372  periplasmic binding protein  32.83 
 
 		 362 aa  124  2e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.670262  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3307  periplasmic binding protein  33.46 
 
 		 357 aa  113  4.0000000000000004e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.182474  hitchhiker  0.00128182 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3879  periplasmic binding protein  31.85 
 
 		 379 aa  108  2e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.051517 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0075  periplasmic binding protein  31.77 
 
 		 335 aa  105  9e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2195  periplasmic binding protein  30.74 
 
 		 294 aa  100  4e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0123698  normal  0.456206 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3565  periplasmic binding protein  31.4 
 
 		 360 aa  99.4  8e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2167  periplasmic binding protein  33.47 
 
 		 276 aa  99.4  8e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.579619  normal  0.13229 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2759  periplasmic binding protein  29.35 
 
 		 380 aa  97.8  2e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.199201  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2873  periplasmic binding protein  29.5 
 
 		 364 aa  92.8  8e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2169  periplasmic binding protein  31.64 
 
 		 303 aa  90.1  5e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.000287241  normal  0.208584 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09830  ABC-type hemin transport system, periplasmic component  29.37 
 
 		 394 aa  88.6  2e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.423992  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2762  periplasmic binding protein  28.81 
 
 		 272 aa  87  4e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.599111  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0853  periplasmic binding protein  31.3 
 
 		 280 aa  86.3  7e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3803  hemin ABC transporter, periplasmic hemin-binding protein  31.28 
 
 		 279 aa  86.3  8e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.656087  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0648  hemin-binding periplasmic protein  31.28 
 
 		 279 aa  86.3  8e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.466649 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3891  periplasmic binding protein  31.28 
 
 		 279 aa  86.3  8e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.815625  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2460  periplasmic binding protein  29.34 
 
 		 272 aa  85.9  8e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2443  periplasmic binding protein  30.27 
 
 		 304 aa  85.5  0.000000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000000910512  normal  0.674129 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2386  binding-protein-dependent transport lipoprotein  29.63 
 
 		 355 aa  83.2  0.000000000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0371  periplasmic binding protein  27.37 
 
 		 380 aa  83.2  0.000000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0573  hemin-binding periplasmic protein hmuT  31.15 
 
 		 278 aa  75.9  0.000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.472949  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2134  periplasmic binding protein  31.2 
 
 		 296 aa  75.1  0.000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.342061  normal  0.620791 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7224  periplasmic binding protein  28.93 
 
 		 276 aa  75.1  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3620  periplasmic binding protein  30.17 
 
 		 297 aa  75.1  0.000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0166  periplasmic binding protein  27.24 
 
 		 323 aa  73.9  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0345  periplasmic binding protein  30.57 
 
 		 282 aa  73.6  0.000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1393  periplasmic binding protein  28.01 
 
 		 317 aa  73.2  0.000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.310826  normal  0.0475326 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1210  periplasmic binding protein  30.92 
 
 		 270 aa  72.8  0.000000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0324  hemin ABC transporter, periplasmic hemin-binding protein HutB  26.52 
 
 		 277 aa  72  0.00000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000295814  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2734  ABC transporter substrate binding protein (hemin)  29.17 
 
 		 312 aa  71.2  0.00000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.702992  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1739  periplasmic binding protein  27.53 
 
 		 273 aa  70.5  0.00000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.102964  normal  0.190946 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2411  periplasmic binding protein  27.45 
 
 		 323 aa  70.5  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4203  periplasmic binding protein  28.29 
 
 		 291 aa  68.9  0.0000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.564967  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05241  ABC-type hemin transport system periplasmic component  27.13 
 
 		 289 aa  68.9  0.0000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1605  periplasmic binding protein  28.11 
 
 		 279 aa  67.8  0.0000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000278278 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2339  periplasmic binding protein  27.6 
 
 		 316 aa  66.6  0.0000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1778  hemin ABC transporter, periplasmic hemin-binding protein  30.57 
 
 		 308 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0438  hemin ABC transporter, periplasmic hemin-binding protein  30.57 
 
 		 308 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2834  periplasmic binding protein  29.39 
 
 		 271 aa  65.5  0.000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0345  hemin ABC transporter, periplasmic hemin-binding protein  30.57 
 
 		 308 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3080  periplasmic binding protein  27.27 
 
 		 302 aa  64.7  0.000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.551347  normal  0.329322 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3336  periplasmic binding protein  31.22 
 
 		 304 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.383489  hitchhiker  0.00144742 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0124  periplasmic binding protein  27.87 
 
 		 295 aa  63.9  0.000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.00000158909  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1828  hemin ABC transporter, periplasmic hemin-binding protein  30.57 
 
 		 308 aa  63.2  0.000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0826  hemin ABC transporter, periplasmic hemin-binding protein  30.57 
 
 		 308 aa  63.2  0.000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.456896  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1118  hemin ABC transporter, periplasmic hemin-binding protein  30.57 
 
 		 308 aa  63.2  0.000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.403801  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2092  hemin ABC transporter, periplasmic hemin-binding protein  30.57 
 
 		 308 aa  63.2  0.000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1969  periplasmic binding protein  28.22 
 
 		 329 aa  62.4  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1754  heme transporter protein HuvB, putative periplasmic binding protein  23.04 
 
 		 290 aa  62.4  0.00000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0122472  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2752  periplasmic binding protein  27.66 
 
 		 275 aa  60.8  0.00000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5376  hemin-binding periplasmic protein HmuT  28.06 
 
 		 283 aa  60.5  0.00000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00368111  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2350  periplasmic binding protein  23.2 
 
 		 323 aa  60.1  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.048634  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1488  periplasmic binding protein  28.51 
 
 		 310 aa  60.5  0.00000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.80443  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4192  periplasmic binding protein  28.16 
 
 		 320 aa  60.1  0.00000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0568253  normal  0.138797 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3804  periplasmic-binding protein  27.88 
 
 		 304 aa  60.1  0.00000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.118967 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4861  periplasmic-binding protein  27.88 
 
 		 284 aa  59.7  0.00000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.478364 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1508  periplasmic binding protein  23.87 
 
 		 268 aa  59.7  0.00000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4774  periplasmic binding protein  29.17 
 
 		 302 aa  59.3  0.00000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.206831  normal  0.996632 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1566  periplasmic binding protein  23.28 
 
 		 289 aa  59.3  0.00000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.447578  normal  0.39643 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1442  periplasmic binding protein  26.61 
 
 		 321 aa  58.9  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.181866  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1931  periplasmic binding protein  26.92 
 
 		 302 aa  58.9  0.0000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1151  hypothetical protein  28.02 
 
 		 333 aa  58.5  0.0000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0182  periplasmic binding protein  27.78 
 
 		 296 aa  57.8  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0861033 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001352  periplasmic hemin-binding protein  21.76 
 
 		 289 aa  57.8  0.0000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00152627  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3331  periplasmic binding protein  23.72 
 
 		 312 aa  57  0.0000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5317  periplasmic binding protein  28.65 
 
 		 290 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2141  hemin ABC transporter, periplasmic hemin-binding protein  28.5 
 
 		 308 aa  56.6  0.0000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4553  periplasmic binding protein  24.89 
 
 		 294 aa  56.6  0.0000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.697431  hitchhiker  0.000000125812 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3342  periplasmic binding protein  23.47 
 
 		 343 aa  56.2  0.0000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0029736  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4689  periplasmic binding protein  24.89 
 
 		 294 aa  56.2  0.0000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000220473 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3654  periplasmic binding protein  28.03 
 
 		 329 aa  56.2  0.0000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.841476  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0993  periplasmic binding protein  26.51 
 
 		 299 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00265339  hitchhiker  0.0000000000789145 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4687  periplasmic binding protein  25.32 
 
 		 294 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0140247  hitchhiker  0.000000000756756 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3535  periplasmic binding protein  24.36 
 
 		 276 aa  55.1  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.862472 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1050  periplasmic binding protein  23.13 
 
 		 343 aa  54.7  0.000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0219  ABC cobalamin/Fe3+-siderophore transporter, periplasmic ligand binding protein  29.69 
 
 		 305 aa  53.9  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1017  periplasmic binding protein  24.02 
 
 		 331 aa  52.8  0.000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.951283  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2124  periplasmic binding protein  27.57 
 
 		 346 aa  52.8  0.000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.355272  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4836  periplasmic binding protein  29.69 
 
 		 305 aa  52.8  0.000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5429  periplasmic binding protein  29.69 
 
 		 305 aa  52.4  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5433  periplasmic binding protein  29.69 
 
 		 305 aa  52.4  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0579041  normal  0.78876 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0457  hemin ABC transporter, periplasmic hemin-binding protein  25.11 
 
 		 303 aa  52.4  0.00001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.251804  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0948  periplasmic binding protein  23.62 
 
 		 308 aa  52.4  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.971026  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06810  Periplasmic binding protein  29.81 
 
 		 282 aa  52  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.251258  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3673  hemin ABC transporter, periplasmic hemin-binding protein  22.82 
 
 		 317 aa  50.8  0.00003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0786  periplasmic binding protein  26.03 
 
 		 327 aa  50.8  0.00003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.683071  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4008  periplasmic binding protein  24.11 
 
 		 304 aa  51.2  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.756364 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4648  periplasmic binding protein  31.61 
 
 		 353 aa  50.4  0.00004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.76116  hitchhiker  0.000482562 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5058  periplasmic binding protein  28.78 
 
 		 331 aa  50.1  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.22765  normal  0.328912 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1218  periplasmic binding protein  23.47 
 
 		 358 aa  50.4  0.00005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0017043  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1374  MoxR-like ATPases-like  24.62 
 
 		 331 aa  50.1  0.00006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.896938  hitchhiker  0.000595014 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2732  periplasmic binding protein  23.36 
 
 		 338 aa  50.1  0.00006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1421  periplasmic binding protein  30.05 
 
 		 379 aa  49.7  0.00007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3239  periplasmic binding protein  22.66 
 
 		 306 aa  48.9  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.720856  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0547  periplasmic binding protein  22.58 
 
 		 359 aa  48.1  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0417  periplasmic binding protein  27.78 
 
 		 346 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0407983 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2734  periplasmic binding protein  25.35 
 
 		 363 aa  47.8  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.148787  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0148  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  29.27 
 
 		 349 aa  47  0.0004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0440522  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0745  periplasmic binding protein  23.21 
 
 		 294 aa  47.4  0.0004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.124358  hitchhiker  0.00000000011582 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>