48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_1743 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_1743  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 402 aa  820    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1213  transcriptional regulator, XRE family  40.38 
 
 		 394 aa  281  1e-74  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00829806  decreased coverage  0.0000499416 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1881  transcriptional regulator  28.05 
 
 		 259 aa  86.7  8e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0431466  hitchhiker  0.00212922 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0655  putative phage repressor  25.9 
 
 		 277 aa  79  0.0000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.119193  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6868  transcriptional regulator, XRE family  41.1 
 
 		 250 aa  67.8  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.815043  normal  0.198687 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1912  helix-turn-helix domain protein  26.53 
 
 		 258 aa  65.1  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.978099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1968  XRE family transcriptional regulator  27.16 
 
 		 257 aa  63.9  0.000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.749676  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2342  transcriptional regulator, XRE family  37.23 
 
 		 279 aa  57  0.0000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000474992  normal  1 
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_13  putative peptidase, S24-like  38.71 
 
 		 205 aa  52  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.568691  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2028  transcriptional regulator, XRE family  24.36 
 
 		 273 aa  51.6  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1666  transcriptional regulator, XRE family  29.9 
 
 		 205 aa  49.3  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.130033  hitchhiker  0.00224482 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0278  XRE family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 128 aa  48.9  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000672654  normal  0.646275 
 
 
-
 
NC_008265  CPR_C0038  Helix-turn-helix domain protein  41.67 
 
 		 120 aa  48.5  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000109438  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1479  putative prophage repressor  33.9 
 
 		 206 aa  47.8  0.0003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.734418  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0082  DNA-binding protein  40 
 
 		 67 aa  47  0.0005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.815457  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0428  prophage lambdaba04, DNA-binding protein  41.82 
 
 		 114 aa  46.6  0.0008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.663163  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0416  prophage LambdaBa04, DNA-binding protein  41.82 
 
 		 114 aa  46.6  0.0008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3135  transcriptional regulator, XRE family  32.05 
 
 		 137 aa  45.8  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.317529  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25650  predicted transcriptional regulator  29.69 
 
 		 194 aa  45.8  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5234  DNA-binding protein  38.18 
 
 		 67 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000302998 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_67  hypothetical protein  40.35 
 
 		 72 aa  45.8  0.001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0122  XRE family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 91 aa  46.2  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.347741  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2559  transcriptional regulator, XRE family  35.59 
 
 		 71 aa  46.2  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2593  transcriptional regulator  33.9 
 
 		 116 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0299  XRE family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 71 aa  45.1  0.002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000289962  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23690  predicted transcriptional regulator  32.26 
 
 		 338 aa  45.1  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000476892  normal  0.626882 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3618  XRE family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 123 aa  45.4  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0101  XRE family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 71 aa  45.1  0.002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000391644  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0730  XRE family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 85 aa  45.4  0.002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000239544  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1604  DNA-binding protein  28.92 
 
 		 114 aa  45.4  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00115974  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1254  transcriptional regulator, XRE family  29.41 
 
 		 364 aa  44.3  0.003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0511  DNA-binding protein  35.94 
 
 		 210 aa  44.7  0.003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00239636 
 
 
-
 
NC_002936  DET1555  DNA-binding protein  38.6 
 
 		 72 aa  44.3  0.003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00000236293  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0070  XRE family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 67 aa  43.9  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3288  transcriptional regulator, XRE family  29.11 
 
 		 135 aa  43.9  0.005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0073  DNA-binding protein  36.36 
 
 		 67 aa  43.5  0.007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0083  DNA-binding protein  36.36 
 
 		 67 aa  43.5  0.007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000440854 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0086  DNA-binding protein  36.36 
 
 		 67 aa  43.5  0.007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.786766  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4110  XRE family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 212 aa  43.5  0.007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.595211  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0074  DNA-binding protein  36.36 
 
 		 67 aa  43.5  0.007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0070  transcriptional regulator  36.36 
 
 		 67 aa  43.5  0.007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0070  transcriptional regulator  36.36 
 
 		 67 aa  43.5  0.007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0074  DNA-binding protein  36.36 
 
 		 67 aa  43.5  0.007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3495  putative phage repressor  31.67 
 
 		 229 aa  43.1  0.008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000058003  unclonable  0.00000889639 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3371  putative phage repressor  31.67 
 
 		 229 aa  43.1  0.008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000119805  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0514  DNA-binding protein  27.69 
 
 		 328 aa  43.1  0.008  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00329657 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3248  transcriptional regulator, XRE family  31.94 
 
 		 110 aa  43.1  0.009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0002  type II restriction-modification system activator, putative  28.57 
 
 		 75 aa  43.1  0.009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00243501  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>