48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_1701 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_1701  protein of unknown function DUF819  100 
 
 		 383 aa  754    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.479008 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4083  protein of unknown function DUF819  30.85 
 
 		 398 aa  134  3e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1819  hypothetical protein  32.61 
 
 		 393 aa  108  2e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.729925 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37056  predicted protein  29.05 
 
 		 415 aa  95.1  2e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0190175  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3548  hypothetical protein  25.34 
 
 		 420 aa  83.6  0.000000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0567  hypothetical protein  28.45 
 
 		 380 aa  82.8  0.000000000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.764386  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3164  hypothetical protein  30.17 
 
 		 415 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0802  hypothetical protein  30.17 
 
 		 415 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0774  hypothetical protein  30.17 
 
 		 415 aa  80.9  0.00000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3828  hypothetical protein  27.97 
 
 		 415 aa  80.5  0.00000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3122  hypothetical protein  27.97 
 
 		 422 aa  80.5  0.00000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_10800  predicted protein  28.2 
 
 		 371 aa  80.1  0.00000000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.929663  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3675  hypothetical protein  28.25 
 
 		 417 aa  79.7  0.00000000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.206706  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2562  hypothetical protein  28.45 
 
 		 412 aa  79.7  0.00000000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.198807 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2905  hypothetical protein  27.51 
 
 		 425 aa  79  0.0000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.9097 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2688  protein of unknown function DUF819  27.3 
 
 		 415 aa  78.6  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.540746  normal  0.317958 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3451  hypothetical protein  27.92 
 
 		 417 aa  77.8  0.0000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3541  protein of unknown function DUF819  29.18 
 
 		 415 aa  77.4  0.0000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00004318 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3609  hypothetical protein  29.18 
 
 		 415 aa  77.4  0.0000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0924  hypothetical protein  28.41 
 
 		 415 aa  76.3  0.000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0116902  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0702  hypothetical protein  28.98 
 
 		 415 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1378  hypothetical protein  24.15 
 
 		 414 aa  74.3  0.000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.896074  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0727  hypothetical protein  29.26 
 
 		 415 aa  74.7  0.000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.534382  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3732  hypothetical protein  28.41 
 
 		 415 aa  72.8  0.000000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0808  hypothetical protein  28.12 
 
 		 415 aa  72  0.00000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07490  hypothetical protein  27.2 
 
 		 419 aa  71.6  0.00000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1697  hypothetical protein  25.47 
 
 		 376 aa  71.6  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.634833  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0732  protein of unknown function DUF819  26.52 
 
 		 387 aa  70.9  0.00000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1083  hypothetical protein  24.65 
 
 		 414 aa  70.5  0.00000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.456212 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3158  protein of unknown function DUF819  27.35 
 
 		 397 aa  70.5  0.00000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.548354  normal  0.649523 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2418  protein of unknown function DUF819  27.41 
 
 		 386 aa  68.9  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.150847  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2589  hypothetical protein  26.04 
 
 		 410 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1158  hypothetical protein  25.43 
 
 		 419 aa  68.6  0.0000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0015  protein of unknown function DUF819  26.68 
 
 		 430 aa  68.2  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.193687 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1092  protein of unknown function DUF819  27.88 
 
 		 414 aa  66.2  0.0000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06021  hypothetical protein  25.98 
 
 		 448 aa  65.5  0.000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3170  protein of unknown function DUF819  27.03 
 
 		 387 aa  65.1  0.000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1799  protein of unknown function DUF819  27.09 
 
 		 386 aa  60.8  0.00000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0833074 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1788  hypothetical protein  24.24 
 
 		 376 aa  57  0.0000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0472  hypothetical protein  26.92 
 
 		 422 aa  56.6  0.0000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0361578  normal  1 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_15699  predicted protein  25.74 
 
 		 488 aa  55.5  0.000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4172  hypothetical protein  25.4 
 
 		 388 aa  55.5  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000960733  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2989  protein of unknown function DUF819  24.39 
 
 		 416 aa  51.2  0.00003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0559265 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03940  predicted integral membrane protein  23.41 
 
 		 383 aa  47.8  0.0003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43807  predicted protein  25.08 
 
 		 413 aa  47.4  0.0004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.710493  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0813  hypothetical protein  27.7 
 
 		 408 aa  47  0.0006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42521  predicted protein  25.24 
 
 		 492 aa  46.2  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_28192  predicted protein  29.45 
 
 		 301 aa  43.5  0.006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>