41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal195_3732 on replicon NC_009997
Organism: Shewanella baltica OS195



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004347  SO_3828  hypothetical protein  92.27 
 
 
415 aa  756    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3541  protein of unknown function DUF819  98.31 
 
 
415 aa  816    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00004318 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3675  hypothetical protein  86.09 
 
 
417 aa  714    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.206706  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3732  hypothetical protein  100 
 
 
415 aa  825    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3122  hypothetical protein  86.02 
 
 
422 aa  706    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3451  hypothetical protein  85.58 
 
 
417 aa  707    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3609  hypothetical protein  98.31 
 
 
415 aa  816    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0808  hypothetical protein  95.66 
 
 
415 aa  779    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2905  hypothetical protein  86.47 
 
 
425 aa  708    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.9097 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0702  hypothetical protein  98.31 
 
 
415 aa  815    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2562  hypothetical protein  83.05 
 
 
412 aa  683    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.198807 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0774  hypothetical protein  94.44 
 
 
415 aa  768    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0727  hypothetical protein  91.3 
 
 
415 aa  750    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.534382  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0802  hypothetical protein  94.2 
 
 
415 aa  766    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3164  hypothetical protein  94.2 
 
 
415 aa  766    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0924  hypothetical protein  88.43 
 
 
415 aa  728    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0116902  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3548  hypothetical protein  63.41 
 
 
420 aa  507  9.999999999999999e-143  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06021  hypothetical protein  61.17 
 
 
448 aa  491  1e-137  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07490  hypothetical protein  55.13 
 
 
419 aa  453  1.0000000000000001e-126  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0472  hypothetical protein  57.29 
 
 
422 aa  435  1e-121  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0361578  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0015  protein of unknown function DUF819  51.7 
 
 
430 aa  421  1e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.193687 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2589  hypothetical protein  48.2 
 
 
410 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1092  protein of unknown function DUF819  50.6 
 
 
414 aa  388  1e-107  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2989  protein of unknown function DUF819  49.88 
 
 
416 aa  377  1e-103  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0559265 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1083  hypothetical protein  44.28 
 
 
414 aa  363  4e-99  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.456212 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1378  hypothetical protein  44.28 
 
 
414 aa  362  5.0000000000000005e-99  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.896074  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1158  hypothetical protein  44.78 
 
 
419 aa  355  7.999999999999999e-97  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2688  protein of unknown function DUF819  45.5 
 
 
415 aa  347  2e-94  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.540746  normal  0.317958 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3158  protein of unknown function DUF819  49.87 
 
 
397 aa  336  3.9999999999999995e-91  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.548354  normal  0.649523 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0813  hypothetical protein  37.56 
 
 
408 aa  261  2e-68  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0732  protein of unknown function DUF819  37.34 
 
 
387 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2418  protein of unknown function DUF819  35.94 
 
 
386 aa  190  4e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.150847  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1799  protein of unknown function DUF819  35.29 
 
 
386 aa  187  4e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0833074 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3170  protein of unknown function DUF819  30.47 
 
 
387 aa  174  3.9999999999999995e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4172  hypothetical protein  31.22 
 
 
388 aa  159  1e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000960733  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03940  predicted integral membrane protein  30.65 
 
 
383 aa  152  1e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1788  hypothetical protein  29.14 
 
 
376 aa  134  3e-30  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4083  protein of unknown function DUF819  24.45 
 
 
398 aa  88.2  2e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1701  protein of unknown function DUF819  28.41 
 
 
383 aa  71.6  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.479008 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_10800  predicted protein  23.38 
 
 
371 aa  60.5  0.00000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.929663  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1819  hypothetical protein  24.8 
 
 
393 aa  46.2  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.729925 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>