43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_0732 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_0732  protein of unknown function DUF819  100 
 
 
387 aa  748    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2418  protein of unknown function DUF819  70.73 
 
 
386 aa  486  1e-136  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.150847  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1799  protein of unknown function DUF819  70.47 
 
 
386 aa  473  1e-132  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0833074 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3170  protein of unknown function DUF819  34.97 
 
 
387 aa  229  7e-59  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3158  protein of unknown function DUF819  37.76 
 
 
397 aa  228  2e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.548354  normal  0.649523 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07490  hypothetical protein  36.91 
 
 
419 aa  223  4.9999999999999996e-57  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3828  hypothetical protein  37.86 
 
 
415 aa  218  1e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0808  hypothetical protein  37.6 
 
 
415 aa  218  2e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2562  hypothetical protein  38.22 
 
 
412 aa  217  2.9999999999999998e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.198807 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06021  hypothetical protein  36.3 
 
 
448 aa  217  2.9999999999999998e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3451  hypothetical protein  37.14 
 
 
417 aa  216  5.9999999999999996e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0802  hypothetical protein  37.7 
 
 
415 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3164  hypothetical protein  37.7 
 
 
415 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0774  hypothetical protein  37.7 
 
 
415 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3541  protein of unknown function DUF819  37.43 
 
 
415 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00004318 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0702  hypothetical protein  37.34 
 
 
415 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3609  hypothetical protein  37.43 
 
 
415 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3732  hypothetical protein  37.34 
 
 
415 aa  213  3.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3548  hypothetical protein  36.88 
 
 
420 aa  211  1e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3122  hypothetical protein  37.3 
 
 
422 aa  211  1e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3675  hypothetical protein  36.1 
 
 
417 aa  210  4e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.206706  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1083  hypothetical protein  33.5 
 
 
414 aa  209  8e-53  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.456212 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0727  hypothetical protein  37.08 
 
 
415 aa  208  1e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.534382  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1378  hypothetical protein  33.5 
 
 
414 aa  207  2e-52  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.896074  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2905  hypothetical protein  36.62 
 
 
425 aa  207  3e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.9097 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2688  protein of unknown function DUF819  34.63 
 
 
415 aa  206  5e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.540746  normal  0.317958 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0924  hypothetical protein  37.08 
 
 
415 aa  206  8e-52  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0116902  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1158  hypothetical protein  33.96 
 
 
419 aa  204  2e-51  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0015  protein of unknown function DUF819  33.91 
 
 
430 aa  204  3e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.193687 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03940  predicted integral membrane protein  33.97 
 
 
383 aa  198  2.0000000000000003e-49  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0472  hypothetical protein  36.61 
 
 
422 aa  185  1.0000000000000001e-45  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0361578  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4172  hypothetical protein  34.83 
 
 
388 aa  182  7e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000960733  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2589  hypothetical protein  32.46 
 
 
410 aa  179  7e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1092  protein of unknown function DUF819  39.14 
 
 
414 aa  177  2e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2989  protein of unknown function DUF819  36.73 
 
 
416 aa  168  1e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0559265 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1788  hypothetical protein  30.11 
 
 
376 aa  144  3e-33  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0813  hypothetical protein  28.38 
 
 
408 aa  110  3e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1701  protein of unknown function DUF819  28.15 
 
 
383 aa  80.5  0.00000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.479008 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4083  protein of unknown function DUF819  22.62 
 
 
398 aa  77.8  0.0000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1819  hypothetical protein  25.75 
 
 
393 aa  58.5  0.0000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.729925 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_10800  predicted protein  30.08 
 
 
371 aa  52.4  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.929663  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37056  predicted protein  30.4 
 
 
415 aa  50.4  0.00005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0190175  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1697  hypothetical protein  24.36 
 
 
376 aa  45.1  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.634833  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>