41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_2589 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_2589  hypothetical protein  100 
 
 		 410 aa  830    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3541  protein of unknown function DUF819  47.55 
 
 		 415 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00004318 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3609  hypothetical protein  47.55 
 
 		 415 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0924  hypothetical protein  47.79 
 
 		 415 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0116902  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0702  hypothetical protein  47.78 
 
 		 415 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3732  hypothetical protein  47.78 
 
 		 415 aa  403  1e-111  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0808  hypothetical protein  47.54 
 
 		 415 aa  403  1e-111  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0727  hypothetical protein  48.28 
 
 		 415 aa  404  1e-111  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.534382  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3828  hypothetical protein  47.29 
 
 		 415 aa  396  1e-109  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0774  hypothetical protein  46.32 
 
 		 415 aa  396  1e-109  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0802  hypothetical protein  46.32 
 
 		 415 aa  397  1e-109  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3164  hypothetical protein  46.32 
 
 		 415 aa  397  1e-109  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2562  hypothetical protein  47.78 
 
 		 412 aa  394  1e-108  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.198807 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3122  hypothetical protein  47.93 
 
 		 422 aa  394  1e-108  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3451  hypothetical protein  48.04 
 
 		 417 aa  389  1e-107  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3675  hypothetical protein  47.55 
 
 		 417 aa  385  1e-106  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.206706  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2905  hypothetical protein  46.21 
 
 		 425 aa  377  1e-103  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.9097 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3548  hypothetical protein  44.22 
 
 		 420 aa  337  1.9999999999999998e-91  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06021  hypothetical protein  43.66 
 
 		 448 aa  335  9e-91  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07490  hypothetical protein  42.16 
 
 		 419 aa  323  3e-87  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0015  protein of unknown function DUF819  40.69 
 
 		 430 aa  313  2.9999999999999996e-84  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.193687 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0472  hypothetical protein  38.36 
 
 		 422 aa  278  9e-74  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0361578  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0813  hypothetical protein  39.23 
 
 		 408 aa  277  3e-73  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1083  hypothetical protein  35.21 
 
 		 414 aa  269  7e-71  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.456212 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1158  hypothetical protein  34.73 
 
 		 419 aa  267  2.9999999999999995e-70  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1378  hypothetical protein  34.72 
 
 		 414 aa  266  5e-70  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.896074  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1092  protein of unknown function DUF819  38.14 
 
 		 414 aa  263  4e-69  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2989  protein of unknown function DUF819  38.08 
 
 		 416 aa  256  4e-67  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0559265 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2688  protein of unknown function DUF819  35.37 
 
 		 415 aa  241  1e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.540746  normal  0.317958 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3158  protein of unknown function DUF819  34.04 
 
 		 397 aa  211  1e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.548354  normal  0.649523 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0732  protein of unknown function DUF819  32.46 
 
 		 387 aa  156  8e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3170  protein of unknown function DUF819  27.07 
 
 		 387 aa  144  3e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2418  protein of unknown function DUF819  30 
 
 		 386 aa  127  3e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.150847  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1799  protein of unknown function DUF819  28.76 
 
 		 386 aa  123  5e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0833074 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03940  predicted integral membrane protein  25 
 
 		 383 aa  110  6e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4172  hypothetical protein  24.2 
 
 		 388 aa  109  7.000000000000001e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000960733  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1788  hypothetical protein  24.52 
 
 		 376 aa  98.6  2e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1701  protein of unknown function DUF819  26.04 
 
 		 383 aa  60.8  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.479008 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4083  protein of unknown function DUF819  22.06 
 
 		 398 aa  54.3  0.000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_10800  predicted protein  26.77 
 
 		 371 aa  51.2  0.00003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.929663  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37056  predicted protein  20.61 
 
 		 415 aa  43.5  0.006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0190175  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>