41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_2905 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_3828  hypothetical protein  84.54 
 
 		 415 aa  695    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3541  protein of unknown function DUF819  86.23 
 
 		 415 aa  706    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00004318 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3675  hypothetical protein  89.66 
 
 		 417 aa  744    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.206706  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3732  hypothetical protein  86.47 
 
 		 415 aa  708    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3122  hypothetical protein  87.06 
 
 		 422 aa  730    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3451  hypothetical protein  90.12 
 
 		 417 aa  743    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3609  hypothetical protein  86.23 
 
 		 415 aa  706    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0808  hypothetical protein  85.96 
 
 		 415 aa  705    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2905  hypothetical protein  100 
 
 		 425 aa  848    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.9097 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0702  hypothetical protein  86.47 
 
 		 415 aa  707    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2562  hypothetical protein  77.8 
 
 		 412 aa  635    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.198807 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0774  hypothetical protein  85.51 
 
 		 415 aa  702    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0727  hypothetical protein  83.29 
 
 		 415 aa  687    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.534382  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0802  hypothetical protein  85.51 
 
 		 415 aa  702    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3164  hypothetical protein  85.51 
 
 		 415 aa  702    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0924  hypothetical protein  83.5 
 
 		 415 aa  678    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0116902  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3548  hypothetical protein  62.38 
 
 		 420 aa  490  1e-137  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06021  hypothetical protein  61.35 
 
 		 448 aa  483  1e-135  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07490  hypothetical protein  56.19 
 
 		 419 aa  445  1.0000000000000001e-124  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0472  hypothetical protein  58.25 
 
 		 422 aa  439  9.999999999999999e-123  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0361578  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0015  protein of unknown function DUF819  51.96 
 
 		 430 aa  404  1e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.193687 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2589  hypothetical protein  46.29 
 
 		 410 aa  380  1e-104  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2989  protein of unknown function DUF819  50.24 
 
 		 416 aa  371  1e-101  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0559265 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1092  protein of unknown function DUF819  48.92 
 
 		 414 aa  369  1e-101  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1378  hypothetical protein  43.67 
 
 		 414 aa  352  5e-96  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.896074  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1083  hypothetical protein  43.67 
 
 		 414 aa  353  5e-96  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.456212 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1158  hypothetical protein  44.67 
 
 		 419 aa  350  3e-95  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2688  protein of unknown function DUF819  45.17 
 
 		 415 aa  343  2e-93  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.540746  normal  0.317958 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3158  protein of unknown function DUF819  47.53 
 
 		 397 aa  322  6e-87  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.548354  normal  0.649523 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0813  hypothetical protein  37.22 
 
 		 408 aa  250  4e-65  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0732  protein of unknown function DUF819  36.62 
 
 		 387 aa  191  2e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2418  protein of unknown function DUF819  34.37 
 
 		 386 aa  172  6.999999999999999e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.150847  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1799  protein of unknown function DUF819  32.93 
 
 		 386 aa  167  2.9999999999999998e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0833074 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3170  protein of unknown function DUF819  28.12 
 
 		 387 aa  161  2e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03940  predicted integral membrane protein  29.2 
 
 		 383 aa  143  6e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4172  hypothetical protein  28.02 
 
 		 388 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000960733  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1788  hypothetical protein  28.08 
 
 		 376 aa  130  5.0000000000000004e-29  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4083  protein of unknown function DUF819  23.48 
 
 		 398 aa  85.1  0.000000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1701  protein of unknown function DUF819  27.51 
 
 		 383 aa  76.6  0.0000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.479008 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_10800  predicted protein  24.09 
 
 		 371 aa  63.2  0.000000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.929663  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1819  hypothetical protein  25.35 
 
 		 393 aa  46.2  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.729925 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>