39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_1158 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007204  Psyc_1083  hypothetical protein  89.74 
 
 
414 aa  760    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.456212 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1378  hypothetical protein  89.98 
 
 
414 aa  762    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.896074  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1158  hypothetical protein  100 
 
 
419 aa  833    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0924  hypothetical protein  45.16 
 
 
415 aa  349  4e-95  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0116902  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06021  hypothetical protein  44.25 
 
 
448 aa  344  2e-93  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3828  hypothetical protein  43.37 
 
 
415 aa  343  2.9999999999999997e-93  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0774  hypothetical protein  43.37 
 
 
415 aa  342  9e-93  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3164  hypothetical protein  43.37 
 
 
415 aa  341  1e-92  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0802  hypothetical protein  43.37 
 
 
415 aa  341  1e-92  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0727  hypothetical protein  44.53 
 
 
415 aa  342  1e-92  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.534382  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07490  hypothetical protein  46.32 
 
 
419 aa  341  2e-92  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3122  hypothetical protein  44.8 
 
 
422 aa  340  2e-92  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0808  hypothetical protein  44.42 
 
 
415 aa  340  4e-92  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3451  hypothetical protein  43.03 
 
 
417 aa  339  5.9999999999999996e-92  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3732  hypothetical protein  44.78 
 
 
415 aa  339  7e-92  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0702  hypothetical protein  44.28 
 
 
415 aa  338  1.9999999999999998e-91  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2562  hypothetical protein  44 
 
 
412 aa  337  2.9999999999999997e-91  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.198807 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3541  protein of unknown function DUF819  44.28 
 
 
415 aa  337  2.9999999999999997e-91  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00004318 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3609  hypothetical protein  44.28 
 
 
415 aa  337  2.9999999999999997e-91  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3675  hypothetical protein  43.27 
 
 
417 aa  336  5.999999999999999e-91  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.206706  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2905  hypothetical protein  44.67 
 
 
425 aa  334  2e-90  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.9097 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3548  hypothetical protein  42.31 
 
 
420 aa  313  2.9999999999999996e-84  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0015  protein of unknown function DUF819  43.36 
 
 
430 aa  313  4.999999999999999e-84  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.193687 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2688  protein of unknown function DUF819  40.59 
 
 
415 aa  302  8.000000000000001e-81  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.540746  normal  0.317958 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2989  protein of unknown function DUF819  43.89 
 
 
416 aa  296  4e-79  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0559265 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0472  hypothetical protein  41.94 
 
 
422 aa  288  1e-76  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0361578  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1092  protein of unknown function DUF819  38.89 
 
 
414 aa  277  3e-73  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3158  protein of unknown function DUF819  40.27 
 
 
397 aa  262  1e-68  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.548354  normal  0.649523 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2589  hypothetical protein  34.96 
 
 
410 aa  258  1e-67  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0732  protein of unknown function DUF819  33.96 
 
 
387 aa  180  4e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2418  protein of unknown function DUF819  33.95 
 
 
386 aa  177  3e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.150847  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1799  protein of unknown function DUF819  33.33 
 
 
386 aa  176  9.999999999999999e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0833074 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0813  hypothetical protein  30.19 
 
 
408 aa  170  5e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3170  protein of unknown function DUF819  27.18 
 
 
387 aa  162  7e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4172  hypothetical protein  27.07 
 
 
388 aa  146  7.0000000000000006e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000960733  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03940  predicted integral membrane protein  31.22 
 
 
383 aa  143  4e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1788  hypothetical protein  28 
 
 
376 aa  124  3e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4083  protein of unknown function DUF819  23.18 
 
 
398 aa  61.2  0.00000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1701  protein of unknown function DUF819  26.37 
 
 
383 aa  60.5  0.00000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.479008 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>