45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_4083 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013517  Sterm_4083  protein of unknown function DUF819  100 
 
 
398 aa  781    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37056  predicted protein  33.5 
 
 
415 aa  176  5e-43  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0190175  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_10800  predicted protein  31.12 
 
 
371 aa  154  2.9999999999999998e-36  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.929663  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1819  hypothetical protein  29.43 
 
 
393 aa  153  5e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.729925 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0567  hypothetical protein  31.77 
 
 
380 aa  145  1e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.764386  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1701  protein of unknown function DUF819  30.85 
 
 
383 aa  127  2.0000000000000002e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.479008 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1697  hypothetical protein  26.38 
 
 
376 aa  113  5e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.634833  normal 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_15699  predicted protein  29.47 
 
 
488 aa  108  2e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43807  predicted protein  25.74 
 
 
413 aa  96.3  9e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.710493  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3828  hypothetical protein  25.27 
 
 
415 aa  84  0.000000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3732  hypothetical protein  24.45 
 
 
415 aa  81.3  0.00000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0808  hypothetical protein  25 
 
 
415 aa  81.3  0.00000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0802  hypothetical protein  25.55 
 
 
415 aa  80.9  0.00000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3164  hypothetical protein  25.55 
 
 
415 aa  80.9  0.00000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0774  hypothetical protein  25.55 
 
 
415 aa  80.9  0.00000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0702  hypothetical protein  24.73 
 
 
415 aa  80.1  0.00000000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3609  hypothetical protein  24.73 
 
 
415 aa  80.1  0.00000000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3541  protein of unknown function DUF819  24.73 
 
 
415 aa  80.1  0.00000000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00004318 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2562  hypothetical protein  24.93 
 
 
412 aa  80.1  0.00000000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.198807 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3158  protein of unknown function DUF819  24.45 
 
 
397 aa  78.6  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.548354  normal  0.649523 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2905  hypothetical protein  23.48 
 
 
425 aa  77.4  0.0000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.9097 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3675  hypothetical protein  23.84 
 
 
417 aa  77  0.0000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.206706  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3122  hypothetical protein  24.93 
 
 
422 aa  76.6  0.0000000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42521  predicted protein  23.67 
 
 
492 aa  75.1  0.000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3451  hypothetical protein  23.48 
 
 
417 aa  73.9  0.000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3548  hypothetical protein  24.73 
 
 
420 aa  72.8  0.00000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06021  hypothetical protein  23.62 
 
 
448 aa  70.5  0.00000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4172  hypothetical protein  25.54 
 
 
388 aa  70.1  0.00000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000960733  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0727  hypothetical protein  23.84 
 
 
415 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.534382  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3170  protein of unknown function DUF819  20.76 
 
 
387 aa  68.2  0.0000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0924  hypothetical protein  22.83 
 
 
415 aa  67.4  0.0000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0116902  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1788  hypothetical protein  22.76 
 
 
376 aa  65.9  0.000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1083  hypothetical protein  20.9 
 
 
414 aa  65.1  0.000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.456212 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1378  hypothetical protein  21.53 
 
 
414 aa  65.1  0.000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.896074  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2418  protein of unknown function DUF819  25.82 
 
 
386 aa  62.4  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.150847  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03940  predicted integral membrane protein  25.22 
 
 
383 aa  61.2  0.00000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1158  hypothetical protein  23.18 
 
 
419 aa  61.2  0.00000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0732  protein of unknown function DUF819  22.69 
 
 
387 aa  59.7  0.00000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0472  hypothetical protein  22.26 
 
 
422 aa  57.4  0.0000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0361578  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1799  protein of unknown function DUF819  24.93 
 
 
386 aa  55.5  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0833074 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_28192  predicted protein  24.84 
 
 
301 aa  55.5  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2589  hypothetical protein  22.06 
 
 
410 aa  54.3  0.000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07490  hypothetical protein  21.41 
 
 
419 aa  52.4  0.00001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1092  protein of unknown function DUF819  25 
 
 
414 aa  51.2  0.00003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2989  protein of unknown function DUF819  22.8 
 
 
416 aa  45.4  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0559265 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>