40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_0808 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008345  Sfri_0727  hypothetical protein  90.1 
 
 
415 aa  742    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.534382  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3609  hypothetical protein  95.66 
 
 
415 aa  778    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0808  hypothetical protein  100 
 
 
415 aa  825    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2905  hypothetical protein  85.96 
 
 
425 aa  705    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.9097 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0702  hypothetical protein  95.65 
 
 
415 aa  778    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2562  hypothetical protein  83.29 
 
 
412 aa  684    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.198807 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0774  hypothetical protein  95.41 
 
 
415 aa  773    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3451  hypothetical protein  84.86 
 
 
417 aa  702    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0802  hypothetical protein  95.17 
 
 
415 aa  771    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3164  hypothetical protein  95.17 
 
 
415 aa  771    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3122  hypothetical protein  85.02 
 
 
422 aa  700    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3732  hypothetical protein  95.66 
 
 
415 aa  779    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0924  hypothetical protein  88.43 
 
 
415 aa  727    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0116902  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3675  hypothetical protein  85.61 
 
 
417 aa  711    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.206706  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3541  protein of unknown function DUF819  95.66 
 
 
415 aa  778    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00004318 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3828  hypothetical protein  94.69 
 
 
415 aa  766    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3548  hypothetical protein  63.9 
 
 
420 aa  511  1e-144  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06021  hypothetical protein  61.41 
 
 
448 aa  494  9.999999999999999e-139  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07490  hypothetical protein  53.7 
 
 
419 aa  450  1e-125  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0472  hypothetical protein  57.29 
 
 
422 aa  438  9.999999999999999e-123  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0361578  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0015  protein of unknown function DUF819  51.34 
 
 
430 aa  414  1e-114  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.193687 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2589  hypothetical protein  47.54 
 
 
410 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1092  protein of unknown function DUF819  50.36 
 
 
414 aa  385  1e-106  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2989  protein of unknown function DUF819  49.76 
 
 
416 aa  376  1e-103  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0559265 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1083  hypothetical protein  44.67 
 
 
414 aa  365  1e-100  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.456212 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1378  hypothetical protein  44.67 
 
 
414 aa  365  1e-100  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.896074  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1158  hypothetical protein  44.42 
 
 
419 aa  357  2.9999999999999997e-97  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2688  protein of unknown function DUF819  45.26 
 
 
415 aa  347  3e-94  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.540746  normal  0.317958 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3158  protein of unknown function DUF819  50.13 
 
 
397 aa  337  2.9999999999999997e-91  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.548354  normal  0.649523 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0813  hypothetical protein  37.09 
 
 
408 aa  256  7e-67  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0732  protein of unknown function DUF819  37.6 
 
 
387 aa  202  9.999999999999999e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2418  protein of unknown function DUF819  35.21 
 
 
386 aa  191  2.9999999999999997e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.150847  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1799  protein of unknown function DUF819  34.56 
 
 
386 aa  187  4e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0833074 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3170  protein of unknown function DUF819  29.82 
 
 
387 aa  172  7.999999999999999e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4172  hypothetical protein  30.68 
 
 
388 aa  158  2e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000960733  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03940  predicted integral membrane protein  30.39 
 
 
383 aa  154  2.9999999999999998e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1788  hypothetical protein  29 
 
 
376 aa  134  3e-30  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4083  protein of unknown function DUF819  25 
 
 
398 aa  89  1e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1701  protein of unknown function DUF819  28.12 
 
 
383 aa  70.5  0.00000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.479008 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_10800  predicted protein  23.38 
 
 
371 aa  62  0.00000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.929663  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>