40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_1083 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007204  Psyc_1083  hypothetical protein  100 
 
 
414 aa  819    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.456212 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1378  hypothetical protein  98.07 
 
 
414 aa  808    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.896074  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1158  hypothetical protein  89.74 
 
 
419 aa  760    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0924  hypothetical protein  45.16 
 
 
415 aa  354  2e-96  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0116902  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3828  hypothetical protein  44.67 
 
 
415 aa  353  2.9999999999999997e-96  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06021  hypothetical protein  44.5 
 
 
448 aa  351  1e-95  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07490  hypothetical protein  46.44 
 
 
419 aa  350  2e-95  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0774  hypothetical protein  43.92 
 
 
415 aa  349  4e-95  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0808  hypothetical protein  44.67 
 
 
415 aa  349  6e-95  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0802  hypothetical protein  43.67 
 
 
415 aa  348  9e-95  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3164  hypothetical protein  43.67 
 
 
415 aa  348  9e-95  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3732  hypothetical protein  44.28 
 
 
415 aa  346  5e-94  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0702  hypothetical protein  43.78 
 
 
415 aa  345  8e-94  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0727  hypothetical protein  44.03 
 
 
415 aa  344  2e-93  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.534382  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3541  protein of unknown function DUF819  43.78 
 
 
415 aa  344  2e-93  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00004318 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3609  hypothetical protein  43.78 
 
 
415 aa  344  2e-93  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2562  hypothetical protein  43.39 
 
 
412 aa  342  9e-93  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.198807 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3122  hypothetical protein  43.56 
 
 
422 aa  340  2.9999999999999998e-92  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3451  hypothetical protein  43.42 
 
 
417 aa  339  4e-92  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3675  hypothetical protein  43.18 
 
 
417 aa  337  2.9999999999999997e-91  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.206706  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2905  hypothetical protein  43.67 
 
 
425 aa  336  5e-91  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.9097 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0015  protein of unknown function DUF819  43.41 
 
 
430 aa  323  4e-87  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.193687 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3548  hypothetical protein  42.56 
 
 
420 aa  318  9e-86  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2688  protein of unknown function DUF819  38.52 
 
 
415 aa  294  2e-78  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.540746  normal  0.317958 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0472  hypothetical protein  41.77 
 
 
422 aa  291  1e-77  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0361578  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2989  protein of unknown function DUF819  42.14 
 
 
416 aa  291  2e-77  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0559265 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1092  protein of unknown function DUF819  39.42 
 
 
414 aa  280  3e-74  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3158  protein of unknown function DUF819  39.47 
 
 
397 aa  266  4e-70  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.548354  normal  0.649523 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2589  hypothetical protein  35.46 
 
 
410 aa  260  3e-68  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1799  protein of unknown function DUF819  33.6 
 
 
386 aa  188  1e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0833074 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2418  protein of unknown function DUF819  33.24 
 
 
386 aa  187  4e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.150847  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0732  protein of unknown function DUF819  33.69 
 
 
387 aa  185  2.0000000000000003e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0813  hypothetical protein  30.25 
 
 
408 aa  171  2e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3170  protein of unknown function DUF819  27.59 
 
 
387 aa  166  8e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03940  predicted integral membrane protein  32.98 
 
 
383 aa  160  4e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4172  hypothetical protein  26.52 
 
 
388 aa  143  6e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000960733  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1788  hypothetical protein  27.5 
 
 
376 aa  124  5e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4083  protein of unknown function DUF819  20.9 
 
 
398 aa  65.1  0.000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1701  protein of unknown function DUF819  24.65 
 
 
383 aa  61.6  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.479008 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1819  hypothetical protein  21.66 
 
 
393 aa  43.1  0.01  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.729925 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>