41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_1092 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_1092  protein of unknown function DUF819  100 
 
 
414 aa  815    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2989  protein of unknown function DUF819  69.59 
 
 
416 aa  554  1e-156  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0559265 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3828  hypothetical protein  50.84 
 
 
415 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3541  protein of unknown function DUF819  50.84 
 
 
415 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00004318 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3732  hypothetical protein  50.6 
 
 
415 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3122  hypothetical protein  49.64 
 
 
422 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3609  hypothetical protein  50.84 
 
 
415 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0774  hypothetical protein  51.08 
 
 
415 aa  408  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0802  hypothetical protein  50.84 
 
 
415 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3164  hypothetical protein  50.84 
 
 
415 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3451  hypothetical protein  49.4 
 
 
417 aa  402  1e-111  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0702  hypothetical protein  50.6 
 
 
415 aa  404  1e-111  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0808  hypothetical protein  50.36 
 
 
415 aa  403  1e-111  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0727  hypothetical protein  49.4 
 
 
415 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.534382  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3675  hypothetical protein  48.92 
 
 
417 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.206706  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0924  hypothetical protein  49.4 
 
 
415 aa  398  1e-109  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0116902  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2562  hypothetical protein  51.7 
 
 
412 aa  395  1e-109  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.198807 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2905  hypothetical protein  48.92 
 
 
425 aa  387  1e-106  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.9097 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06021  hypothetical protein  47.69 
 
 
448 aa  385  1e-105  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07490  hypothetical protein  46.44 
 
 
419 aa  362  8e-99  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3548  hypothetical protein  46.44 
 
 
420 aa  354  1e-96  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0015  protein of unknown function DUF819  46.59 
 
 
430 aa  343  2.9999999999999997e-93  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.193687 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1083  hypothetical protein  39.42 
 
 
414 aa  314  1.9999999999999998e-84  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.456212 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1378  hypothetical protein  39.22 
 
 
414 aa  313  2.9999999999999996e-84  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.896074  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1158  hypothetical protein  38.89 
 
 
419 aa  310  2e-83  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0472  hypothetical protein  43.61 
 
 
422 aa  309  5e-83  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0361578  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2688  protein of unknown function DUF819  42.25 
 
 
415 aa  305  1.0000000000000001e-81  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.540746  normal  0.317958 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2589  hypothetical protein  38.14 
 
 
410 aa  278  1e-73  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3158  protein of unknown function DUF819  44.11 
 
 
397 aa  261  1e-68  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.548354  normal  0.649523 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0732  protein of unknown function DUF819  39.14 
 
 
387 aa  182  1e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0813  hypothetical protein  31.57 
 
 
408 aa  179  7e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3170  protein of unknown function DUF819  28.54 
 
 
387 aa  176  9.999999999999999e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1799  protein of unknown function DUF819  33.09 
 
 
386 aa  172  9e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0833074 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2418  protein of unknown function DUF819  34.24 
 
 
386 aa  171  2e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.150847  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03940  predicted integral membrane protein  31.4 
 
 
383 aa  153  5e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4172  hypothetical protein  31.06 
 
 
388 aa  151  2e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000960733  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1788  hypothetical protein  30.57 
 
 
376 aa  136  5e-31  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1701  protein of unknown function DUF819  28.15 
 
 
383 aa  73.2  0.000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.479008 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4083  protein of unknown function DUF819  25.36 
 
 
398 aa  70.1  0.00000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_10800  predicted protein  26.3 
 
 
371 aa  59.7  0.0000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.929663  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37056  predicted protein  27.03 
 
 
415 aa  44.7  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0190175  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>