44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_4172 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_4172  hypothetical protein  100 
 
 		 388 aa  766    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000960733  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3170  protein of unknown function DUF819  46.51 
 
 		 387 aa  352  5.9999999999999994e-96  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1788  hypothetical protein  43.01 
 
 		 376 aa  285  7e-76  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03940  predicted integral membrane protein  40.56 
 
 		 383 aa  270  2e-71  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1799  protein of unknown function DUF819  31.95 
 
 		 386 aa  167  2.9999999999999998e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0833074 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2418  protein of unknown function DUF819  31.58 
 
 		 386 aa  166  5e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.150847  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0732  protein of unknown function DUF819  34.75 
 
 		 387 aa  162  7e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1158  hypothetical protein  27.91 
 
 		 419 aa  152  7e-36  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1083  hypothetical protein  27.22 
 
 		 414 aa  151  2e-35  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.456212 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1378  hypothetical protein  27.49 
 
 		 414 aa  151  2e-35  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.896074  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2562  hypothetical protein  30.37 
 
 		 412 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.198807 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0015  protein of unknown function DUF819  28.12 
 
 		 430 aa  147  4.0000000000000006e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.193687 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3732  hypothetical protein  31.23 
 
 		 415 aa  147  4.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0924  hypothetical protein  29.61 
 
 		 415 aa  147  4.0000000000000006e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0116902  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3541  protein of unknown function DUF819  31.23 
 
 		 415 aa  146  5e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00004318 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3609  hypothetical protein  31.23 
 
 		 415 aa  146  5e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0702  hypothetical protein  31.38 
 
 		 415 aa  146  7.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0808  hypothetical protein  30.55 
 
 		 415 aa  146  8.000000000000001e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0727  hypothetical protein  31.12 
 
 		 415 aa  145  2e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.534382  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06021  hypothetical protein  29.88 
 
 		 448 aa  145  2e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07490  hypothetical protein  29.82 
 
 		 419 aa  144  3e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3828  hypothetical protein  31.25 
 
 		 415 aa  144  4e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3548  hypothetical protein  27.25 
 
 		 420 aa  142  8e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3158  protein of unknown function DUF819  29.41 
 
 		 397 aa  141  1.9999999999999998e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.548354  normal  0.649523 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0774  hypothetical protein  30.26 
 
 		 415 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3164  hypothetical protein  30.26 
 
 		 415 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0802  hypothetical protein  30.26 
 
 		 415 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2989  protein of unknown function DUF819  29.95 
 
 		 416 aa  129  1.0000000000000001e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0559265 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1092  protein of unknown function DUF819  31.43 
 
 		 414 aa  126  6e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3122  hypothetical protein  28.42 
 
 		 422 aa  124  3e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2905  hypothetical protein  28.53 
 
 		 425 aa  124  3e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.9097 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3675  hypothetical protein  28.57 
 
 		 417 aa  124  3e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.206706  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2688  protein of unknown function DUF819  30.3 
 
 		 415 aa  124  4e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.540746  normal  0.317958 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3451  hypothetical protein  27.89 
 
 		 417 aa  123  7e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2589  hypothetical protein  24.2 
 
 		 410 aa  109  8.000000000000001e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0472  hypothetical protein  29.14 
 
 		 422 aa  107  4e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0361578  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0813  hypothetical protein  25.41 
 
 		 408 aa  85.9  0.000000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4083  protein of unknown function DUF819  26.1 
 
 		 398 aa  78.2  0.0000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0567  hypothetical protein  27.62 
 
 		 380 aa  64.7  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.764386  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1819  hypothetical protein  26.25 
 
 		 393 aa  62.4  0.00000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.729925 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_10800  predicted protein  24.05 
 
 		 371 aa  60.1  0.00000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.929663  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37056  predicted protein  25.46 
 
 		 415 aa  52.8  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0190175  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1701  protein of unknown function DUF819  26.16 
 
 		 383 aa  50.8  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.479008 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1697  hypothetical protein  24.06 
 
 		 376 aa  44.7  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.634833  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>