43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_03940 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_03940  predicted integral membrane protein  100 
 
 		 383 aa  753    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3170  protein of unknown function DUF819  46.61 
 
 		 387 aa  355  5e-97  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4172  hypothetical protein  40.22 
 
 		 388 aa  290  3e-77  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000960733  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1788  hypothetical protein  35.12 
 
 		 376 aa  221  1.9999999999999999e-56  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2418  protein of unknown function DUF819  33 
 
 		 386 aa  185  9e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.150847  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0732  protein of unknown function DUF819  33.88 
 
 		 387 aa  182  6e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1799  protein of unknown function DUF819  33.33 
 
 		 386 aa  181  2e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0833074 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1083  hypothetical protein  32.92 
 
 		 414 aa  176  7e-43  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.456212 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1378  hypothetical protein  33.42 
 
 		 414 aa  175  9.999999999999999e-43  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.896074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06021  hypothetical protein  29.98 
 
 		 448 aa  164  2.0000000000000002e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1158  hypothetical protein  31.17 
 
 		 419 aa  160  5e-38  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3828  hypothetical protein  29.81 
 
 		 415 aa  159  1e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0774  hypothetical protein  30.02 
 
 		 415 aa  157  2e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2562  hypothetical protein  28.85 
 
 		 412 aa  156  5.0000000000000005e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.198807 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3164  hypothetical protein  29.78 
 
 		 415 aa  156  5.0000000000000005e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0802  hypothetical protein  29.78 
 
 		 415 aa  156  5.0000000000000005e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0702  hypothetical protein  29.81 
 
 		 415 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0808  hypothetical protein  29.57 
 
 		 415 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0924  hypothetical protein  29.41 
 
 		 415 aa  153  4e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0116902  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3541  protein of unknown function DUF819  30.02 
 
 		 415 aa  154  4e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00004318 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3609  hypothetical protein  30.02 
 
 		 415 aa  154  4e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3732  hypothetical protein  29.81 
 
 		 415 aa  153  5.9999999999999996e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3548  hypothetical protein  28.05 
 
 		 420 aa  151  2e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0727  hypothetical protein  29.2 
 
 		 415 aa  149  6e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.534382  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3451  hypothetical protein  27.68 
 
 		 417 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2905  hypothetical protein  29.97 
 
 		 425 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.9097 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3675  hypothetical protein  29.13 
 
 		 417 aa  140  3.9999999999999997e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.206706  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07490  hypothetical protein  30.29 
 
 		 419 aa  140  4.999999999999999e-32  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3122  hypothetical protein  29.27 
 
 		 422 aa  138  2e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0015  protein of unknown function DUF819  28.92 
 
 		 430 aa  137  4e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.193687 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2688  protein of unknown function DUF819  27.85 
 
 		 415 aa  132  1.0000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.540746  normal  0.317958 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1092  protein of unknown function DUF819  31.4 
 
 		 414 aa  131  2.0000000000000002e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3158  protein of unknown function DUF819  28.93 
 
 		 397 aa  129  1.0000000000000001e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.548354  normal  0.649523 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2589  hypothetical protein  25 
 
 		 410 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2989  protein of unknown function DUF819  30.32 
 
 		 416 aa  117  3e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0559265 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0472  hypothetical protein  27.14 
 
 		 422 aa  107  3e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0361578  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0813  hypothetical protein  27.62 
 
 		 408 aa  93.2  7e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37056  predicted protein  29.41 
 
 		 415 aa  87.4  4e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0190175  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4083  protein of unknown function DUF819  24.68 
 
 		 398 aa  71.6  0.00000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_10800  predicted protein  24.09 
 
 		 371 aa  56.2  0.0000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.929663  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1819  hypothetical protein  29.72 
 
 		 393 aa  56.2  0.000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.729925 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1697  hypothetical protein  25.99 
 
 		 376 aa  53.1  0.000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.634833  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1701  protein of unknown function DUF819  25.83 
 
 		 383 aa  49.3  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.479008 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>