40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_07490 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_07490  hypothetical protein  100 
 
 
419 aa  830    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0924  hypothetical protein  55.29 
 
 
415 aa  455  1e-127  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0116902  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0727  hypothetical protein  55.37 
 
 
415 aa  456  1e-127  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.534382  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3732  hypothetical protein  55.13 
 
 
415 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3451  hypothetical protein  55.85 
 
 
417 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3541  protein of unknown function DUF819  54.81 
 
 
415 aa  449  1e-125  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00004318 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3122  hypothetical protein  55.53 
 
 
422 aa  449  1e-125  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3609  hypothetical protein  54.81 
 
 
415 aa  449  1e-125  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0808  hypothetical protein  53.7 
 
 
415 aa  449  1e-125  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0702  hypothetical protein  54.42 
 
 
415 aa  450  1e-125  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06021  hypothetical protein  56.22 
 
 
448 aa  447  1.0000000000000001e-124  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3675  hypothetical protein  54.63 
 
 
417 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.206706  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2905  hypothetical protein  56.19 
 
 
425 aa  445  1.0000000000000001e-124  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.9097 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0774  hypothetical protein  53.85 
 
 
415 aa  444  1e-123  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3828  hypothetical protein  52.98 
 
 
415 aa  442  1e-123  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3164  hypothetical protein  53.61 
 
 
415 aa  443  1e-123  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0802  hypothetical protein  53.61 
 
 
415 aa  443  1e-123  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2562  hypothetical protein  53.96 
 
 
412 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.198807 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0472  hypothetical protein  56.02 
 
 
422 aa  417  9.999999999999999e-116  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0361578  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0015  protein of unknown function DUF819  52.7 
 
 
430 aa  411  1e-113  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.193687 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3548  hypothetical protein  53.98 
 
 
420 aa  401  1e-111  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1083  hypothetical protein  46.44 
 
 
414 aa  366  1e-100  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.456212 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1378  hypothetical protein  46.19 
 
 
414 aa  366  1e-100  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.896074  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1158  hypothetical protein  46.32 
 
 
419 aa  358  9.999999999999999e-98  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2688  protein of unknown function DUF819  45.06 
 
 
415 aa  353  4e-96  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.540746  normal  0.317958 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1092  protein of unknown function DUF819  46.44 
 
 
414 aa  342  5e-93  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2589  hypothetical protein  42.16 
 
 
410 aa  328  8e-89  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2989  protein of unknown function DUF819  46.15 
 
 
416 aa  315  9.999999999999999e-85  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0559265 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3158  protein of unknown function DUF819  45.81 
 
 
397 aa  303  3.0000000000000004e-81  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.548354  normal  0.649523 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0813  hypothetical protein  36.43 
 
 
408 aa  217  2.9999999999999998e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0732  protein of unknown function DUF819  36.91 
 
 
387 aa  207  2e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2418  protein of unknown function DUF819  34.39 
 
 
386 aa  189  8e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.150847  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3170  protein of unknown function DUF819  30.24 
 
 
387 aa  187  4e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1799  protein of unknown function DUF819  33.01 
 
 
386 aa  181  2.9999999999999997e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0833074 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4172  hypothetical protein  29.08 
 
 
388 aa  150  3e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000960733  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03940  predicted integral membrane protein  30.21 
 
 
383 aa  149  8e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1788  hypothetical protein  30.31 
 
 
376 aa  135  9.999999999999999e-31  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1701  protein of unknown function DUF819  27.2 
 
 
383 aa  70.5  0.00000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.479008 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4083  protein of unknown function DUF819  21.19 
 
 
398 aa  58.9  0.0000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_10800  predicted protein  26.5 
 
 
371 aa  54.3  0.000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.929663  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>