42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_3548 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_3548  hypothetical protein  100 
 
 		 420 aa  833    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3828  hypothetical protein  62.71 
 
 		 415 aa  538  9.999999999999999e-153  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3675  hypothetical protein  64.75 
 
 		 417 aa  535  1e-151  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.206706  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0727  hypothetical protein  62.95 
 
 		 415 aa  535  1e-151  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.534382  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0808  hypothetical protein  63.9 
 
 		 415 aa  536  1e-151  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0924  hypothetical protein  63.13 
 
 		 415 aa  533  1e-150  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0116902  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3732  hypothetical protein  63.41 
 
 		 415 aa  532  1e-150  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3451  hypothetical protein  64.75 
 
 		 417 aa  534  1e-150  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3164  hypothetical protein  62.95 
 
 		 415 aa  533  1e-150  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0802  hypothetical protein  62.95 
 
 		 415 aa  533  1e-150  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0702  hypothetical protein  63.41 
 
 		 415 aa  532  1e-150  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0774  hypothetical protein  63.2 
 
 		 415 aa  533  1e-150  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2562  hypothetical protein  63.29 
 
 		 412 aa  532  1e-150  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.198807 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3609  hypothetical protein  63.41 
 
 		 415 aa  530  1e-149  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3541  protein of unknown function DUF819  63.41 
 
 		 415 aa  530  1e-149  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00004318 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3122  hypothetical protein  62.56 
 
 		 422 aa  525  1e-148  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2905  hypothetical protein  62.38 
 
 		 425 aa  514  1e-144  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.9097 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06021  hypothetical protein  52.39 
 
 		 448 aa  432  1e-120  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07490  hypothetical protein  53.98 
 
 		 419 aa  426  1e-118  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0472  hypothetical protein  56.25 
 
 		 422 aa  417  9.999999999999999e-116  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0361578  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0015  protein of unknown function DUF819  48.29 
 
 		 430 aa  383  1e-105  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.193687 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2589  hypothetical protein  45.1 
 
 		 410 aa  372  1e-102  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1092  protein of unknown function DUF819  46.44 
 
 		 414 aa  356  5.999999999999999e-97  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1378  hypothetical protein  42.64 
 
 		 414 aa  346  4e-94  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.896074  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1083  hypothetical protein  42.17 
 
 		 414 aa  345  8e-94  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.456212 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1158  hypothetical protein  41.01 
 
 		 419 aa  340  2.9999999999999998e-92  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2989  protein of unknown function DUF819  45.7 
 
 		 416 aa  337  1.9999999999999998e-91  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0559265 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2688  protein of unknown function DUF819  41.4 
 
 		 415 aa  319  5e-86  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.540746  normal  0.317958 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3158  protein of unknown function DUF819  44.36 
 
 		 397 aa  303  5.000000000000001e-81  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.548354  normal  0.649523 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0813  hypothetical protein  35.42 
 
 		 408 aa  244  3e-63  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0732  protein of unknown function DUF819  37.08 
 
 		 387 aa  200  5e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2418  protein of unknown function DUF819  33.74 
 
 		 386 aa  182  9.000000000000001e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.150847  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1799  protein of unknown function DUF819  33.33 
 
 		 386 aa  178  2e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0833074 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3170  protein of unknown function DUF819  27.15 
 
 		 387 aa  167  2.9999999999999998e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4172  hypothetical protein  27.62 
 
 		 388 aa  144  2e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000960733  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03940  predicted integral membrane protein  28.97 
 
 		 383 aa  141  1.9999999999999998e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1788  hypothetical protein  26.96 
 
 		 376 aa  125  2e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1701  protein of unknown function DUF819  25.36 
 
 		 383 aa  83.2  0.000000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.479008 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4083  protein of unknown function DUF819  25.27 
 
 		 398 aa  83.2  0.000000000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_10800  predicted protein  22.92 
 
 		 371 aa  56.6  0.0000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.929663  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37056  predicted protein  22.41 
 
 		 415 aa  43.5  0.007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0190175  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1819  hypothetical protein  24.8 
 
 		 393 aa  43.5  0.007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.729925 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>