44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_3158 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_3158  protein of unknown function DUF819  100 
 
 
397 aa  766    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.548354  normal  0.649523 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0808  hypothetical protein  49.61 
 
 
415 aa  339  5e-92  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0702  hypothetical protein  47.55 
 
 
415 aa  339  5.9999999999999996e-92  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3541  protein of unknown function DUF819  47.55 
 
 
415 aa  338  9e-92  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00004318 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3609  hypothetical protein  47.55 
 
 
415 aa  338  9e-92  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0727  hypothetical protein  47.06 
 
 
415 aa  338  9e-92  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.534382  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3732  hypothetical protein  49.87 
 
 
415 aa  337  1.9999999999999998e-91  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3828  hypothetical protein  48.56 
 
 
415 aa  336  3.9999999999999995e-91  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3164  hypothetical protein  48.82 
 
 
415 aa  334  2e-90  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0802  hypothetical protein  48.82 
 
 
415 aa  334  2e-90  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0774  hypothetical protein  48.82 
 
 
415 aa  334  2e-90  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3675  hypothetical protein  48.2 
 
 
417 aa  333  4e-90  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.206706  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3122  hypothetical protein  48.69 
 
 
422 aa  330  2e-89  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0924  hypothetical protein  47.64 
 
 
415 aa  329  5.0000000000000004e-89  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0116902  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3451  hypothetical protein  46.63 
 
 
417 aa  327  2.0000000000000001e-88  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2905  hypothetical protein  47.29 
 
 
425 aa  325  1e-87  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.9097 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2562  hypothetical protein  46.8 
 
 
412 aa  322  6e-87  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.198807 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06021  hypothetical protein  45.3 
 
 
448 aa  322  9.999999999999999e-87  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07490  hypothetical protein  45.81 
 
 
419 aa  305  1.0000000000000001e-81  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3548  hypothetical protein  44.36 
 
 
420 aa  298  9e-80  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0472  hypothetical protein  44.27 
 
 
422 aa  293  4e-78  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0361578  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1378  hypothetical protein  38.73 
 
 
414 aa  286  4e-76  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.896074  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1083  hypothetical protein  38.23 
 
 
414 aa  284  2.0000000000000002e-75  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.456212 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1158  hypothetical protein  39.24 
 
 
419 aa  280  3e-74  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0015  protein of unknown function DUF819  40.64 
 
 
430 aa  268  1e-70  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.193687 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2688  protein of unknown function DUF819  39.42 
 
 
415 aa  264  2e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.540746  normal  0.317958 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2989  protein of unknown function DUF819  43.59 
 
 
416 aa  259  5.0000000000000005e-68  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0559265 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1092  protein of unknown function DUF819  42.28 
 
 
414 aa  245  8e-64  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2589  hypothetical protein  33.25 
 
 
410 aa  230  4e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2418  protein of unknown function DUF819  38.58 
 
 
386 aa  224  2e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.150847  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0732  protein of unknown function DUF819  37.76 
 
 
387 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1799  protein of unknown function DUF819  37.66 
 
 
386 aa  219  5e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0833074 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3170  protein of unknown function DUF819  29.87 
 
 
387 aa  176  5e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0813  hypothetical protein  33.33 
 
 
408 aa  169  8e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4172  hypothetical protein  30.21 
 
 
388 aa  156  7e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000960733  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03940  predicted integral membrane protein  28.46 
 
 
383 aa  137  4e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1788  hypothetical protein  28.46 
 
 
376 aa  127  4.0000000000000003e-28  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4083  protein of unknown function DUF819  24.45 
 
 
398 aa  85.9  0.000000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_10800  predicted protein  28.49 
 
 
371 aa  69.3  0.0000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.929663  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1701  protein of unknown function DUF819  26.53 
 
 
383 aa  68.9  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.479008 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37056  predicted protein  26.1 
 
 
415 aa  57  0.0000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0190175  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42521  predicted protein  26.3 
 
 
492 aa  45.8  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1819  hypothetical protein  25.45 
 
 
393 aa  44.7  0.003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.729925 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1697  hypothetical protein  32.38 
 
 
376 aa  43.9  0.006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.634833  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>