23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_1697 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009511  Swit_1697  hypothetical protein  100 
 
 
376 aa  735    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.634833  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0567  hypothetical protein  37.57 
 
 
380 aa  217  2.9999999999999998e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.764386  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1819  hypothetical protein  33.07 
 
 
393 aa  179  5.999999999999999e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.729925 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37056  predicted protein  30.38 
 
 
415 aa  144  2e-33  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0190175  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4083  protein of unknown function DUF819  27.07 
 
 
398 aa  138  2e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_10800  predicted protein  29.05 
 
 
371 aa  119  9e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.929663  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1701  protein of unknown function DUF819  26.15 
 
 
383 aa  80.9  0.00000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.479008 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43807  predicted protein  25.86 
 
 
413 aa  77.4  0.0000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.710493  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03940  predicted integral membrane protein  27.41 
 
 
383 aa  67.8  0.0000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3170  protein of unknown function DUF819  24.44 
 
 
387 aa  67.4  0.0000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1788  hypothetical protein  23.53 
 
 
376 aa  66.2  0.0000000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4172  hypothetical protein  25 
 
 
388 aa  65.9  0.000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000960733  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_15699  predicted protein  26.84 
 
 
488 aa  62.8  0.000000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_28192  predicted protein  29.38 
 
 
301 aa  56.2  0.0000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3158  protein of unknown function DUF819  32.38 
 
 
397 aa  53.9  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.548354  normal  0.649523 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1378  hypothetical protein  22.67 
 
 
414 aa  50.1  0.00006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.896074  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06021  hypothetical protein  22.66 
 
 
448 aa  48.9  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42521  predicted protein  25.35 
 
 
492 aa  49.3  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2418  protein of unknown function DUF819  24.02 
 
 
386 aa  48.1  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.150847  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1158  hypothetical protein  21.81 
 
 
419 aa  47.8  0.0003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2688  protein of unknown function DUF819  23.85 
 
 
415 aa  46.6  0.0006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.540746  normal  0.317958 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2989  protein of unknown function DUF819  28.73 
 
 
416 aa  46.6  0.0008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0559265 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1083  hypothetical protein  22.13 
 
 
414 aa  45.8  0.001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.456212 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>