43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_3170 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012793  GWCH70_3170  protein of unknown function DUF819  100 
 
 
387 aa  772    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4172  hypothetical protein  46.88 
 
 
388 aa  344  1e-93  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000960733  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03940  predicted integral membrane protein  46.96 
 
 
383 aa  328  1.0000000000000001e-88  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1788  hypothetical protein  39.04 
 
 
376 aa  265  1e-69  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0732  protein of unknown function DUF819  35.44 
 
 
387 aa  204  2e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2418  protein of unknown function DUF819  31.61 
 
 
386 aa  188  1e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.150847  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1799  protein of unknown function DUF819  31.35 
 
 
386 aa  186  6e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0833074 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06021  hypothetical protein  29.38 
 
 
448 aa  173  5e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07490  hypothetical protein  30.24 
 
 
419 aa  171  2e-41  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2562  hypothetical protein  30.81 
 
 
412 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.198807 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1083  hypothetical protein  27.59 
 
 
414 aa  166  6.9999999999999995e-40  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.456212 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1378  hypothetical protein  27.06 
 
 
414 aa  164  3e-39  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.896074  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3828  hypothetical protein  29.9 
 
 
415 aa  163  6e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1158  hypothetical protein  27.18 
 
 
419 aa  162  6e-39  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3548  hypothetical protein  26.89 
 
 
420 aa  162  7e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3541  protein of unknown function DUF819  30.83 
 
 
415 aa  162  9e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00004318 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3609  hypothetical protein  30.83 
 
 
415 aa  162  9e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0702  hypothetical protein  30.99 
 
 
415 aa  161  2e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3164  hypothetical protein  29.27 
 
 
415 aa  160  5e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0802  hypothetical protein  29.27 
 
 
415 aa  160  5e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0774  hypothetical protein  29.27 
 
 
415 aa  159  7e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0727  hypothetical protein  29.47 
 
 
415 aa  159  7e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.534382  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3732  hypothetical protein  30.47 
 
 
415 aa  157  2e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0808  hypothetical protein  28.89 
 
 
415 aa  157  4e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0924  hypothetical protein  29.72 
 
 
415 aa  156  5.0000000000000005e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0116902  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3158  protein of unknown function DUF819  29.97 
 
 
397 aa  154  2e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.548354  normal  0.649523 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3675  hypothetical protein  28.47 
 
 
417 aa  152  8.999999999999999e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.206706  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3122  hypothetical protein  28.86 
 
 
422 aa  150  4e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3451  hypothetical protein  28.22 
 
 
417 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2905  hypothetical protein  28.12 
 
 
425 aa  145  8.000000000000001e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.9097 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1092  protein of unknown function DUF819  28.54 
 
 
414 aa  143  5e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2589  hypothetical protein  27.15 
 
 
410 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2688  protein of unknown function DUF819  27.74 
 
 
415 aa  140  4.999999999999999e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.540746  normal  0.317958 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2989  protein of unknown function DUF819  30.3 
 
 
416 aa  136  5e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0559265 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0472  hypothetical protein  28.09 
 
 
422 aa  132  9e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0361578  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0015  protein of unknown function DUF819  26.8 
 
 
430 aa  130  5.0000000000000004e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.193687 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0813  hypothetical protein  23.61 
 
 
408 aa  85.1  0.000000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4083  protein of unknown function DUF819  20.76 
 
 
398 aa  68.2  0.0000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1701  protein of unknown function DUF819  27.03 
 
 
383 aa  58.2  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.479008 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37056  predicted protein  24.32 
 
 
415 aa  56.6  0.0000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0190175  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_10800  predicted protein  21.83 
 
 
371 aa  52.4  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.929663  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1819  hypothetical protein  23.8 
 
 
393 aa  49.3  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.729925 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0567  hypothetical protein  21.49 
 
 
380 aa  47.4  0.0004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.764386  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>