23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0567 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_0567  hypothetical protein  100 
 
 		 380 aa  737    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.764386  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1697  hypothetical protein  37.67 
 
 		 376 aa  214  2.9999999999999995e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.634833  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1819  hypothetical protein  36.41 
 
 		 393 aa  210  4e-53  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.729925 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4083  protein of unknown function DUF819  31.97 
 
 		 398 aa  177  3e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37056  predicted protein  35.45 
 
 		 415 aa  171  2e-41  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0190175  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_10800  predicted protein  33.52 
 
 		 371 aa  157  2e-37  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.929663  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1701  protein of unknown function DUF819  30.12 
 
 		 383 aa  106  6e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.479008 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_15699  predicted protein  31.99 
 
 		 488 aa  87  5e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43807  predicted protein  28.22 
 
 		 413 aa  85.9  0.000000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.710493  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4172  hypothetical protein  28.97 
 
 		 388 aa  80.5  0.00000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000960733  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42521  predicted protein  25.94 
 
 		 492 aa  68.2  0.0000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3170  protein of unknown function DUF819  21.49 
 
 		 387 aa  63.2  0.000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_28192  predicted protein  26.84 
 
 		 301 aa  60.8  0.00000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06021  hypothetical protein  26.02 
 
 		 448 aa  57.8  0.0000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03940  predicted integral membrane protein  25.94 
 
 		 383 aa  54.7  0.000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1788  hypothetical protein  23.36 
 
 		 376 aa  54.7  0.000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3158  protein of unknown function DUF819  24.1 
 
 		 397 aa  48.5  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.548354  normal  0.649523 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1378  hypothetical protein  23.25 
 
 		 414 aa  48.1  0.0003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.896074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3451  hypothetical protein  25.12 
 
 		 417 aa  44.3  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0924  hypothetical protein  24.16 
 
 		 415 aa  44.7  0.003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0116902  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1083  hypothetical protein  22.5 
 
 		 414 aa  44.3  0.004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.456212 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2905  hypothetical protein  24.56 
 
 		 425 aa  43.1  0.008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.9097 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2562  hypothetical protein  24.4 
 
 		 412 aa  43.1  0.008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.198807 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>