43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_1799 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_1799  protein of unknown function DUF819  100 
 
 		 386 aa  744    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0833074 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2418  protein of unknown function DUF819  94.83 
 
 		 386 aa  657    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.150847  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0732  protein of unknown function DUF819  70.28 
 
 		 387 aa  476  1e-133  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3158  protein of unknown function DUF819  37.66 
 
 		 397 aa  225  1e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.548354  normal  0.649523 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2562  hypothetical protein  35.22 
 
 		 412 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.198807 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1083  hypothetical protein  33.6 
 
 		 414 aa  215  9e-55  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.456212 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3828  hypothetical protein  34.56 
 
 		 415 aa  213  3.9999999999999995e-54  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1378  hypothetical protein  33.6 
 
 		 414 aa  213  3.9999999999999995e-54  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.896074  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0727  hypothetical protein  35.78 
 
 		 415 aa  213  5.999999999999999e-54  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.534382  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3451  hypothetical protein  35.75 
 
 		 417 aa  213  5.999999999999999e-54  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06021  hypothetical protein  32.67 
 
 		 448 aa  212  1e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3170  protein of unknown function DUF819  31.35 
 
 		 387 aa  211  1e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3732  hypothetical protein  35.54 
 
 		 415 aa  211  2e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0808  hypothetical protein  34.8 
 
 		 415 aa  211  2e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3541  protein of unknown function DUF819  35.22 
 
 		 415 aa  210  3e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00004318 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0702  hypothetical protein  35.05 
 
 		 415 aa  210  3e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3609  hypothetical protein  35.22 
 
 		 415 aa  210  3e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07490  hypothetical protein  34.23 
 
 		 419 aa  209  7e-53  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0774  hypothetical protein  34.98 
 
 		 415 aa  208  1e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3164  hypothetical protein  34.98 
 
 		 415 aa  208  2e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0802  hypothetical protein  34.98 
 
 		 415 aa  208  2e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3675  hypothetical protein  34.97 
 
 		 417 aa  207  3e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.206706  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3122  hypothetical protein  34.8 
 
 		 422 aa  204  2e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0924  hypothetical protein  34.48 
 
 		 415 aa  203  3e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0116902  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1158  hypothetical protein  33.33 
 
 		 419 aa  202  6e-51  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3548  hypothetical protein  33.07 
 
 		 420 aa  200  3e-50  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2688  protein of unknown function DUF819  33.09 
 
 		 415 aa  197  2.0000000000000003e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.540746  normal  0.317958 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2905  hypothetical protein  33.94 
 
 		 425 aa  193  5e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.9097 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0015  protein of unknown function DUF819  34.07 
 
 		 430 aa  191  2e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.193687 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03940  predicted integral membrane protein  33.51 
 
 		 383 aa  186  4e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4172  hypothetical protein  31.23 
 
 		 388 aa  179  1e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000960733  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1092  protein of unknown function DUF819  34.32 
 
 		 414 aa  177  3e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1788  hypothetical protein  32.66 
 
 		 376 aa  173  5e-42  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0472  hypothetical protein  31.31 
 
 		 422 aa  169  5e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0361578  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2989  protein of unknown function DUF819  32.65 
 
 		 416 aa  161  2e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0559265 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2589  hypothetical protein  29.74 
 
 		 410 aa  161  2e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0813  hypothetical protein  28.09 
 
 		 408 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4083  protein of unknown function DUF819  25.77 
 
 		 398 aa  88.6  2e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1701  protein of unknown function DUF819  27.59 
 
 		 383 aa  86.7  7e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.479008 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1819  hypothetical protein  25.66 
 
 		 393 aa  77.4  0.0000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.729925 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37056  predicted protein  28.27 
 
 		 415 aa  70.1  0.00000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0190175  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_10800  predicted protein  28.03 
 
 		 371 aa  69.7  0.00000000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.929663  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1697  hypothetical protein  24.16 
 
 		 376 aa  48.9  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.634833  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>