More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_2307 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_2217  D-alanyl-alanine synthetase A  95.83 
 
 		 336 aa  675    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2294  D-alanyl-alanine synthetase A  92.26 
 
 		 337 aa  652    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.153469  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2090  D-alanyl-alanine synthetase A  92.56 
 
 		 337 aa  652    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4569  D-alanyl-alanine synthetase A  92.26 
 
 		 337 aa  649    Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2043  D-alanyl-alanine synthetase A  92.56 
 
 		 337 aa  653    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2129  D-alanyl-alanine synthetase A  98.81 
 
 		 336 aa  691    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00010873  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2205  D-alanyl-alanine synthetase A  97.62 
 
 		 336 aa  684    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00465427  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1801  D-alanyl-alanine synthetase A  90.48 
 
 		 337 aa  647    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2307  D-alanyl-alanine synthetase A  100 
 
 		 336 aa  701    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0685707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2283  D-alanyl-alanine synthetase A  92.26 
 
 		 337 aa  649    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2354  D-alanyl-alanine synthetase A  79.04 
 
 		 335 aa  564  1e-160  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.702714  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2550  D-alanyl-alanine synthetase A  79.88 
 
 		 336 aa  549  1e-155  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.281568  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1920  D-alanyl-alanine synthetase A  74.17 
 
 		 333 aa  498  1e-140  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.029445  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2133  D-alanyl-alanine synthetase A  74.47 
 
 		 334 aa  498  1e-140  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2674  D-alanyl-alanine synthetase A  71.34 
 
 		 359 aa  489  1e-137  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.819496  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2422  D-alanyl-alanine synthetase A  70.75 
 
 		 334 aa  482  1e-135  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1903  D-alanyl-alanine synthetase A  66.37 
 
 		 336 aa  477  1e-133  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05785  D-alanyl-alanine synthetase A  54.91 
 
 		 329 aa  366  1e-100  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000154  D-alanine--D-alanine ligase  53.68 
 
 		 329 aa  364  1e-99  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.965415  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0515  D-alanyl-alanine synthetase A  52.76 
 
 		 329 aa  364  1e-99  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.48928  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0639  D-alanyl-alanine synthetase A  48.62 
 
 		 343 aa  337  9.999999999999999e-92  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.107317  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1603  D-alanine/D-alanine ligase  34.45 
 
 		 362 aa  189  4e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0422  D-alanyl-alanine synthetase A  33.05 
 
 		 364 aa  186  4e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.947692  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0434  D-alanyl-alanine synthetase A  33.05 
 
 		 364 aa  186  4e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0552987  normal  0.545444 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0416  D-alanyl-alanine synthetase A  33.05 
 
 		 364 aa  186  4e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.532787  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0415  D-alanyl-alanine synthetase A  33.05 
 
 		 364 aa  185  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.335332  normal  0.0242928 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0476  D-alanyl-alanine synthetase A  33.05 
 
 		 364 aa  185  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1233  D-ala D-ala ligase N-terminal domain protein  33.25 
 
 		 380 aa  184  2.0000000000000003e-45  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000148623 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0387  D-alanyl-alanine synthetase A  35.09 
 
 		 367 aa  184  2.0000000000000003e-45  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.067468  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0298  D-alanyl-alanine synthetase A  33.33 
 
 		 364 aa  179  4e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00328  D-alanylalanine synthetase  33.33 
 
 		 364 aa  179  4.999999999999999e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3227  D-alanine/D-alanine ligase  33.33 
 
 		 364 aa  179  4.999999999999999e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0410  D-alanyl-alanine synthetase A  33.33 
 
 		 364 aa  179  4.999999999999999e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0406  D-alanyl-alanine synthetase A  33.33 
 
 		 364 aa  179  4.999999999999999e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3251  D-alanyl-alanine synthetase A  33.33 
 
 		 364 aa  179  4.999999999999999e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.10036 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0447  D-alanyl-alanine synthetase A  33.33 
 
 		 364 aa  179  4.999999999999999e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0453  D-alanyl-alanine synthetase A  33.33 
 
 		 364 aa  179  4.999999999999999e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4182  D-alanine--D-alanine ligase  32.38 
 
 		 363 aa  176  3e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.512251  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1544  D-alanyl-alanine synthetase A  34.87 
 
 		 348 aa  177  3e-43  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0610  D-alanyl-alanine synthetase A  32 
 
 		 359 aa  176  6e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0850  D-alanyl-alanine synthetase A  32.48 
 
 		 366 aa  176  6e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.237365 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0767  D-alanyl-alanine synthetase A  35.1 
 
 		 348 aa  175  9.999999999999999e-43  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2101  D-alanyl-alanine synthetase A  33.43 
 
 		 357 aa  172  5.999999999999999e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0423676 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2158  D-alanyl-alanine synthetase A  31.7 
 
 		 356 aa  171  1e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2120  D-alanyl-alanine synthetase A  31.7 
 
 		 356 aa  171  1e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.183623  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2342  D-alanyl-alanine synthetase A  32.29 
 
 		 358 aa  170  4e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.958781 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1232  D-alanyl-alanine synthetase A  31.43 
 
 		 366 aa  170  4e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0514331  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1690  D-alanyl-alanine synthetase A  33.05 
 
 		 357 aa  168  1e-40  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.820491  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1271  D-alanyl-alanine synthetase A  30.77 
 
 		 353 aa  168  1e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.537127  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1680  D-alanine/D-alanine ligase  31.75 
 
 		 389 aa  168  1e-40  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.344983  hitchhiker  0.00583012 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3919  D-alanyl-alanine synthetase A  30.86 
 
 		 363 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.27971  normal  0.219568 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0173  D-alanyl-alanine synthetase A  30.51 
 
 		 364 aa  165  8e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1367  D-alanine--D-alanine ligase  31.34 
 
 		 367 aa  165  1.0000000000000001e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5988  D-alanyl-alanine synthetase A  31.83 
 
 		 355 aa  165  1.0000000000000001e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2039  D-alanyl-alanine synthetase A  30.59 
 
 		 364 aa  164  2.0000000000000002e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000143922  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1112  D-alanyl-alanine synthetase A  38.38 
 
 		 395 aa  163  3e-39  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1480  D-alanyl-alanine synthetase A  32.69 
 
 		 360 aa  162  5.0000000000000005e-39  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.351068 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3791  D-alanine--D-alanine ligase  30.58 
 
 		 370 aa  162  6e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.100262  normal  0.807199 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3506  D-alanine--D-alanine ligase  30.9 
 
 		 361 aa  162  7e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.109153  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1427  D-alanyl-alanine synthetase A  33.33 
 
 		 373 aa  162  8.000000000000001e-39  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1090  D-alanine--D-alanine ligase  29.4 
 
 		 371 aa  162  8.000000000000001e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0661  D-alanine/D-alanine ligase  32.15 
 
 		 324 aa  161  1e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.435945  normal  0.336706 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0922  D-alanyl-alanine synthetase A  31.95 
 
 		 382 aa  160  2e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.160134 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0633  D-alanyl-alanine synthetase A  29.68 
 
 		 371 aa  160  2e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0283  D-alanyl-alanine synthetase A  30.85 
 
 		 376 aa  161  2e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0108652  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3354  D-alanyl-alanine synthetase A  33.24 
 
 		 351 aa  159  5e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2763  D-alanyl-alanine synthetase A  32.59 
 
 		 351 aa  159  7e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.118485  hitchhiker  0.00665374 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1490  D-alanyl-alanine synthetase A  34.32 
 
 		 372 aa  159  8e-38  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1938  D-alanyl-alanine synthetase A  31.88 
 
 		 376 aa  158  1e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00320777  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2285  D-alanine/D-alanine ligase  31.32 
 
 		 377 aa  156  4e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.249142  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0223  D-alanyl-alanine synthetase A  31.36 
 
 		 362 aa  156  5.0000000000000005e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1586  D-alanine--D-alanine ligase  27.52 
 
 		 377 aa  155  8e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0347832 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3345  D-alanine/D-alanine ligase  29.75 
 
 		 366 aa  155  9e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1909  D-alanyl-alanine synthetase A  32.51 
 
 		 371 aa  155  1e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.667964  normal  0.68001 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1929  D-alanyl-alanine synthetase A  32.51 
 
 		 371 aa  155  1e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1595  D-alanyl-alanine synthetase A  30.14 
 
 		 372 aa  155  1e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0878073  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1975  D-alanyl-alanine synthetase A  32.51 
 
 		 371 aa  155  1e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.916646  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08980  D-alanine--D-alanine ligase  32.09 
 
 		 343 aa  154  2e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0337  D-alanine/D-alanine ligase  33.13 
 
 		 322 aa  154  2e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0388  D-ala D-ala ligase  31.53 
 
 		 375 aa  154  2e-36  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.822373  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08790  D-alanine--D-alanine ligase  30.94 
 
 		 379 aa  154  2e-36  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0347411  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0232  D-alanyl-alanine synthetase A  30.81 
 
 		 362 aa  153  4e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1162  D-alanine--D-alanine ligase  29.53 
 
 		 360 aa  153  5e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000524603 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2121  D-alanyl-alanine synthetase A  30.27 
 
 		 339 aa  152  8e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2385  D-alanyl-alanine synthetase A  30.73 
 
 		 368 aa  152  8.999999999999999e-36  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09160  D-alanyl-alanine synthetase A  31.3 
 
 		 365 aa  150  2e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.616014 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11160  D-alanine--D-alanine ligase  31.13 
 
 		 400 aa  151  2e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0940695  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0203  D-alanyl-alanine synthetase A  29.89 
 
 		 364 aa  151  2e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0107  D-alanyl-alanine synthetase A  29.48 
 
 		 375 aa  150  3e-35  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0129798  hitchhiker  0.000000000349499 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0477  D-alanyl-alanine synthetase A  29.26 
 
 		 378 aa  150  4e-35  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000107455  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12996  D-alanyl-alanine synthetase A  34.45 
 
 		 373 aa  150  4e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00428062  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3243  D-alanine/D-alanine ligase  29.34 
 
 		 366 aa  149  6e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8008  D-alanine--D-alanine ligase  29.72 
 
 		 369 aa  149  7e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3291  D-alanine--D-alanine ligase  29.86 
 
 		 373 aa  149  7e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.304475  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2665  D-alanyl-alanine synthetase A  30.66 
 
 		 364 aa  149  9e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2535  D-alanyl-alanine synthetase A  30.66 
 
 		 364 aa  149  9e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3609  D-alanyl-alanine synthetase A  30.13 
 
 		 383 aa  148  1.0000000000000001e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0272  D-alanine/D-alanine ligase  31.83 
 
 		 351 aa  147  2.0000000000000003e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.472493  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1529  D-alanyl-alanine synthetase A  32.13 
 
 		 363 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1084  D-alanyl-alanine synthetase A  28.61 
 
 		 367 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>