More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal_4569 on replicon NC_009035
Organism: Shewanella baltica OS155



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_2217  D-alanyl-alanine synthetase A  91.37 
 
 		 336 aa  649    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2294  D-alanyl-alanine synthetase A  99.11 
 
 		 337 aa  697    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.153469  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2090  D-alanyl-alanine synthetase A  99.7 
 
 		 337 aa  701    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2129  D-alanyl-alanine synthetase A  92.86 
 
 		 336 aa  656    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00010873  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2205  D-alanyl-alanine synthetase A  92.26 
 
 		 336 aa  651    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00465427  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1801  D-alanyl-alanine synthetase A  91.37 
 
 		 337 aa  654    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2043  D-alanyl-alanine synthetase A  99.41 
 
 		 337 aa  698    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2307  D-alanyl-alanine synthetase A  92.26 
 
 		 336 aa  649    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0685707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4569  D-alanyl-alanine synthetase A  100 
 
 		 337 aa  704    Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2283  D-alanyl-alanine synthetase A  100 
 
 		 337 aa  704    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2354  D-alanyl-alanine synthetase A  79.88 
 
 		 335 aa  564  1e-160  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.702714  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2550  D-alanyl-alanine synthetase A  78.98 
 
 		 336 aa  536  1e-151  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.281568  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2133  D-alanyl-alanine synthetase A  74.47 
 
 		 334 aa  501  1e-141  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1920  D-alanyl-alanine synthetase A  74.47 
 
 		 333 aa  499  1e-140  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.029445  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2674  D-alanyl-alanine synthetase A  72.24 
 
 		 359 aa  494  9.999999999999999e-139  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.819496  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2422  D-alanyl-alanine synthetase A  70.94 
 
 		 334 aa  489  1e-137  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1903  D-alanyl-alanine synthetase A  66.37 
 
 		 336 aa  477  1e-133  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0515  D-alanyl-alanine synthetase A  52.58 
 
 		 329 aa  373  1e-102  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.48928  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05785  D-alanyl-alanine synthetase A  54.05 
 
 		 329 aa  368  1e-101  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000154  D-alanine--D-alanine ligase  53.21 
 
 		 329 aa  363  2e-99  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.965415  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0639  D-alanyl-alanine synthetase A  48.92 
 
 		 343 aa  341  9e-93  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.107317  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0416  D-alanyl-alanine synthetase A  34.18 
 
 		 364 aa  186  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.532787  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0422  D-alanyl-alanine synthetase A  34.18 
 
 		 364 aa  186  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.947692  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0434  D-alanyl-alanine synthetase A  34.18 
 
 		 364 aa  186  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0552987  normal  0.545444 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0447  D-alanyl-alanine synthetase A  33.9 
 
 		 364 aa  186  4e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00328  D-alanylalanine synthetase  33.9 
 
 		 364 aa  186  4e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3227  D-alanine/D-alanine ligase  33.9 
 
 		 364 aa  186  4e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0410  D-alanyl-alanine synthetase A  33.9 
 
 		 364 aa  186  4e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0453  D-alanyl-alanine synthetase A  33.9 
 
 		 364 aa  186  4e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0298  D-alanyl-alanine synthetase A  33.9 
 
 		 364 aa  186  4e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3251  D-alanyl-alanine synthetase A  33.9 
 
 		 364 aa  186  4e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.10036 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0406  D-alanyl-alanine synthetase A  33.9 
 
 		 364 aa  186  4e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0387  D-alanyl-alanine synthetase A  35.36 
 
 		 367 aa  186  6e-46  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.067468  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1603  D-alanine/D-alanine ligase  34.28 
 
 		 362 aa  183  3e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0415  D-alanyl-alanine synthetase A  33.9 
 
 		 364 aa  183  3e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.335332  normal  0.0242928 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0476  D-alanyl-alanine synthetase A  33.9 
 
 		 364 aa  183  3e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0850  D-alanyl-alanine synthetase A  33.43 
 
 		 366 aa  178  1e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.237365 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0610  D-alanyl-alanine synthetase A  32.57 
 
 		 359 aa  177  2e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1233  D-ala D-ala ligase N-terminal domain protein  33.51 
 
 		 380 aa  176  4e-43  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000148623 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0173  D-alanyl-alanine synthetase A  32.1 
 
 		 364 aa  176  5e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0767  D-alanyl-alanine synthetase A  34.59 
 
 		 348 aa  173  2.9999999999999996e-42  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1367  D-alanine--D-alanine ligase  31.91 
 
 		 367 aa  171  1e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4182  D-alanine--D-alanine ligase  32.38 
 
 		 363 aa  171  1e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.512251  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1544  D-alanyl-alanine synthetase A  34 
 
 		 348 aa  171  2e-41  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1690  D-alanyl-alanine synthetase A  31.79 
 
 		 357 aa  170  4e-41  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.820491  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3506  D-alanine--D-alanine ligase  32.31 
 
 		 361 aa  170  4e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.109153  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2120  D-alanyl-alanine synthetase A  31.2 
 
 		 356 aa  169  6e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.183623  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2158  D-alanyl-alanine synthetase A  31.2 
 
 		 356 aa  169  6e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2039  D-alanyl-alanine synthetase A  30.59 
 
 		 364 aa  167  2e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000143922  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1680  D-alanine/D-alanine ligase  31.28 
 
 		 389 aa  166  6.9999999999999995e-40  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.344983  hitchhiker  0.00583012 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1480  D-alanyl-alanine synthetase A  32.49 
 
 		 360 aa  164  2.0000000000000002e-39  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.351068 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3919  D-alanyl-alanine synthetase A  32.66 
 
 		 363 aa  163  3e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.27971  normal  0.219568 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0223  D-alanyl-alanine synthetase A  32.39 
 
 		 362 aa  163  3e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1427  D-alanyl-alanine synthetase A  34.41 
 
 		 373 aa  163  4.0000000000000004e-39  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0283  D-alanyl-alanine synthetase A  30.94 
 
 		 376 aa  162  7e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0108652  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1090  D-alanine--D-alanine ligase  30.22 
 
 		 371 aa  162  8.000000000000001e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3791  D-alanine--D-alanine ligase  30.49 
 
 		 370 aa  161  2e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.100262  normal  0.807199 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0633  D-alanyl-alanine synthetase A  30.35 
 
 		 371 aa  160  3e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0232  D-alanyl-alanine synthetase A  31.44 
 
 		 362 aa  160  3e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1232  D-alanyl-alanine synthetase A  30.51 
 
 		 366 aa  160  4e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0514331  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0661  D-alanine/D-alanine ligase  32.36 
 
 		 324 aa  160  4e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.435945  normal  0.336706 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1490  D-alanyl-alanine synthetase A  34.12 
 
 		 372 aa  159  5e-38  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0203  D-alanyl-alanine synthetase A  30.4 
 
 		 364 aa  159  9e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0388  D-ala D-ala ligase  31.53 
 
 		 375 aa  158  1e-37  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.822373  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2342  D-alanyl-alanine synthetase A  30.77 
 
 		 358 aa  158  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.958781 
 
 
-
 
NC_004310  BR1271  D-alanyl-alanine synthetase A  30.66 
 
 		 353 aa  157  2e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.537127  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0922  D-alanyl-alanine synthetase A  31.36 
 
 		 382 aa  157  2e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.160134 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0337  D-alanine/D-alanine ligase  32.73 
 
 		 322 aa  157  2e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2285  D-alanine/D-alanine ligase  30.83 
 
 		 377 aa  158  2e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.249142  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1938  D-alanyl-alanine synthetase A  31.71 
 
 		 376 aa  157  2e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00320777  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5988  D-alanyl-alanine synthetase A  32.48 
 
 		 355 aa  157  3e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3345  D-alanine/D-alanine ligase  30.68 
 
 		 366 aa  157  3e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08980  D-alanine--D-alanine ligase  32.66 
 
 		 343 aa  157  3e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3354  D-alanyl-alanine synthetase A  32.97 
 
 		 351 aa  156  4e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2101  D-alanyl-alanine synthetase A  30.88 
 
 		 357 aa  156  4e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0423676 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2763  D-alanyl-alanine synthetase A  32.02 
 
 		 351 aa  156  5.0000000000000005e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.118485  hitchhiker  0.00665374 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1112  D-alanyl-alanine synthetase A  36.03 
 
 		 395 aa  156  6e-37  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1586  D-alanine--D-alanine ligase  29.09 
 
 		 377 aa  154  2e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0347832 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2385  D-alanyl-alanine synthetase A  31.36 
 
 		 368 aa  153  4e-36  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0265  D-alanyl-alanine synthetase A  30.77 
 
 		 361 aa  152  8e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1909  D-alanyl-alanine synthetase A  32.78 
 
 		 371 aa  152  8e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.667964  normal  0.68001 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0279  D-alanyl-alanine synthetase A  30.77 
 
 		 361 aa  152  8e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0219  D-alanyl-alanine synthetase A  30.77 
 
 		 361 aa  152  8.999999999999999e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0217  D-alanyl-alanine synthetase A  30.77 
 
 		 361 aa  152  1e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0272  D-alanine/D-alanine ligase  31.14 
 
 		 351 aa  152  1e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.472493  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0257  D-alanyl-alanine synthetase A  30.77 
 
 		 361 aa  152  1e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5065  D-alanyl-alanine synthetase A  31.23 
 
 		 361 aa  151  2e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.250957  normal  0.846892 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08790  D-alanine--D-alanine ligase  31.3 
 
 		 379 aa  150  2e-35  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0347411  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2665  D-alanyl-alanine synthetase A  31.43 
 
 		 364 aa  150  3e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2535  D-alanyl-alanine synthetase A  31.43 
 
 		 364 aa  150  3e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1631  D-alanyl-alanine synthetase A  31.25 
 
 		 360 aa  150  3e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0260  D-alanyl-alanine synthetase A  31.23 
 
 		 361 aa  150  4e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.649407  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12996  D-alanyl-alanine synthetase A  33.24 
 
 		 373 aa  150  4e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00428062  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0107  D-alanyl-alanine synthetase A  30.62 
 
 		 375 aa  150  4e-35  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0129798  hitchhiker  0.000000000349499 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09160  D-alanyl-alanine synthetase A  30.08 
 
 		 365 aa  149  5e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.616014 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1929  D-alanyl-alanine synthetase A  32.23 
 
 		 371 aa  149  5e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1975  D-alanyl-alanine synthetase A  32.23 
 
 		 371 aa  149  5e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.916646  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1004  D-alanyl-alanine synthetase A  32.31 
 
 		 360 aa  149  5e-35  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0714352 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2721  D-alanyl-alanine synthetase A  30.11 
 
 		 361 aa  149  6e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0289964  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0672  D-alanyl-alanine synthetase A  29.68 
 
 		 377 aa  149  6e-35  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00380934  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>