More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_3263 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_1707  putative protein kinase  55.94 
 
 		 611 aa  700    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0579  serine/threonine protein kinase, putative  79.17 
 
 		 602 aa  1003    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4155  serine/threonine protein kinase  82.23 
 
 		 623 aa  1049    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.922757  normal  0.593825 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3912  protein kinase  80.83 
 
 		 602 aa  1018    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4012  serine/threonine protein kinase  83.75 
 
 		 606 aa  1078    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000249675 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0586  serine/threonine protein kinase  84.03 
 
 		 609 aa  1076    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0539  protein kinase  77.55 
 
 		 600 aa  975    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3786  protein kinase  80.83 
 
 		 602 aa  1020    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2040  serine/threonine protein kinase  54.61 
 
 		 616 aa  677    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.529884  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01958  Serine/threonine protein kinase  52.85 
 
 		 624 aa  670    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000150408  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0579  serine/threonine protein kinase  80.13 
 
 		 602 aa  1011    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3451  serine/threonine protein kinase  79.83 
 
 		 602 aa  1010    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3500  serine/threonine protein kinase  77.5 
 
 		 610 aa  992    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0578  serine/threonine protein kinase  79.83 
 
 		 602 aa  1010    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0541  serine/threonine protein kinase, putative  77.78 
 
 		 606 aa  986    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.89559  decreased coverage  0.00419942 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1379  protein kinase  56.98 
 
 		 613 aa  718    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.688474  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3729  serine/threonine protein kinase  80.83 
 
 		 602 aa  1020    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0539  protein kinase  80.83 
 
 		 602 aa  1019    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3263  serine/threonine protein kinase  100 
 
 		 611 aa  1268    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.507481  hitchhiker  0.00561071 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3298  protein kinase  79.83 
 
 		 602 aa  1014    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3788  serine/threonine protein kinase  26.74 
 
 		 505 aa  79.3  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.987521  normal  0.0424994 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4391  Serine/threonine protein kinase  29.68 
 
 		 546 aa  75.9  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000198345 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4532  serine/threonine protein kinase  28.76 
 
 		 642 aa  75.9  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000271647  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0764  serine/threonine kinase protein  26.09 
 
 		 662 aa  74.7  0.000000000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000395129 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0236  serine/threonine protein kinase  32.45 
 
 		 357 aa  74.3  0.000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1519  protein kinase  31.16 
 
 		 762 aa  73.9  0.000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.171741  hitchhiker  0.00214244 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1100  serine/threonine protein kinase  28.04 
 
 		 1415 aa  73.9  0.000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1602  protein serine/threonine phosphatase  33.48 
 
 		 556 aa  72.8  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.022391  hitchhiker  0.00581256 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0336  serine/threonine protein kinase  28.42 
 
 		 777 aa  71.2  0.00000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5305  serine/threonine protein kinase  26.75 
 
 		 645 aa  70.9  0.00000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.704424  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2578  serine/threonine protein kinase  26.94 
 
 		 985 aa  70.1  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.790371  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2278  serine/threonine protein kinase  30.87 
 
 		 752 aa  70.1  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0612166  hitchhiker  0.00000196574 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1991  protein kinase  25.18 
 
 		 692 aa  69.3  0.0000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2091  serine/threonine-protein kinase, putative  33.03 
 
 		 556 aa  68.6  0.0000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0473599 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0600  serine/threonine protein kinase  25.95 
 
 		 510 aa  68.9  0.0000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0109114  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1709  serine/threonine protein kinase  25.55 
 
 		 691 aa  68.9  0.0000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0789  serine/threonine kinase protein  24 
 
 		 614 aa  68.2  0.0000000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.350319  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3543  serine/threonine protein kinase  28.44 
 
 		 537 aa  68.2  0.0000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0435506  normal  0.170453 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2948  serine/threonine protein kinase  30 
 
 		 638 aa  67.8  0.0000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0990  serine/threonine protein kinase  25.19 
 
 		 486 aa  67.4  0.0000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000407261  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2393  serine/threonine protein kinase  25.69 
 
 		 457 aa  67.4  0.0000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.380399  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3649  protein kinase  33.03 
 
 		 556 aa  67.4  0.0000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0234168  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3942  serine/threonine protein kinase with Chase2 sensor  24.81 
 
 		 907 aa  67  0.0000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0699  serine/threonine protein kinase  24.77 
 
 		 866 aa  65.9  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1225  serine/threonine protein kinase with FHA domain protein  25.29 
 
 		 403 aa  66.2  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.553503 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4531  serine/threonine protein kinase  27.84 
 
 		 646 aa  65.9  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.114343  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4235  serine/threonine protein kinase  25.72 
 
 		 381 aa  66.2  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1529  protein kinase  29.77 
 
 		 774 aa  65.9  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1099  serine/threonine protein kinase  33.55 
 
 		 267 aa  65.1  0.000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000152305  hitchhiker  0.0000000000000203974 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1549  protein kinase  25 
 
 		 784 aa  65.5  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0320573 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3751  serine/threonine protein kinase  37.14 
 
 		 478 aa  65.5  0.000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000729349  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3340  serine/threonine protein kinase  27.03 
 
 		 490 aa  65.5  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3083  serine/threonine protein kinase  26.89 
 
 		 461 aa  65.1  0.000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1579  serine/threonine protein kinase  24.48 
 
 		 297 aa  65.5  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1714  protein kinase  22.94 
 
 		 621 aa  65.1  0.000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1077  serine/threonine protein kinase  25.11 
 
 		 503 aa  64.7  0.000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000527598  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0927  serine/threonine protein kinase  29.82 
 
 		 553 aa  65.1  0.000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0434  protein kinase  23.53 
 
 		 325 aa  64.7  0.000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.631753  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0729  serine/threonine protein kinase  28.24 
 
 		 464 aa  64.3  0.000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.44074  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3944  Serine/threonine protein kinase-like  24.42 
 
 		 700 aa  64.3  0.000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.147415  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2303  serine/threonine protein kinase, putative  27.3 
 
 		 529 aa  63.9  0.000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.42838  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6332  serine/threonine protein kinase  26.62 
 
 		 895 aa  64.3  0.000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.174056  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2487  serine/threonine protein kinase  25.84 
 
 		 377 aa  63.9  0.000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0000035224  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0087  serine/threonine protein kinase  26.73 
 
 		 700 aa  63.9  0.000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0207  kinase domain protein  28.17 
 
 		 637 aa  63.9  0.000000008  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3897  Serine/threonine protein kinase-related protein  26.51 
 
 		 477 aa  63.5  0.00000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4390  serine/threonine protein kinase  25.78 
 
 		 938 aa  63.5  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.139237  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0021  serine/threonine protein kinase  29.48 
 
 		 666 aa  63.5  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4975  serine/threonine protein kinase  25.2 
 
 		 580 aa  63.2  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.519124  normal  0.302776 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3893  protein kinase  26.58 
 
 		 502 aa  63.5  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35230  serine/threonine protein kinase  24.89 
 
 		 531 aa  63.2  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.812554  normal  0.572815 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1658  Sel1-like repeat-containing serine/threonine protein kinase  25.48 
 
 		 599 aa  62.4  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4550  serine/threonine protein kinase with pentapeptide repeats  28.43 
 
 		 526 aa  62.4  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.154716  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0353  serine/threonine kinase protein  29.41 
 
 		 427 aa  62.4  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.638448  normal  0.179862 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3364  serine/threonine protein kinase  26.27 
 
 		 370 aa  62.4  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.179058 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_41728  predicted protein  25.76 
 
 		 323 aa  62.4  0.00000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000183464  hitchhiker  0.00347686 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3670  protein kinase domain-containing protein  26.29 
 
 		 781 aa  62  0.00000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.353968  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4041  serine/threonine protein kinase  33.1 
 
 		 774 aa  62.4  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.224391  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0780  serine/threonine protein kinase  28.78 
 
 		 457 aa  62  0.00000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.113085 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1717  serine/threonine protein kinase  25.89 
 
 		 273 aa  62  0.00000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13097  serine/threonine-protein kinase transcriptional regulatory protein pknK  25.83 
 
 		 1110 aa  62  0.00000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1756  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase  26.89 
 
 		 608 aa  61.6  0.00000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6045  serine/threonine protein kinase  27.23 
 
 		 842 aa  61.6  0.00000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1588  protein kinase  26.51 
 
 		 604 aa  61.6  0.00000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_12118  predicted protein  31.62 
 
 		 137 aa  61.6  0.00000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3946  serine/threonine protein kinase  30.73 
 
 		 587 aa  61.2  0.00000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0106209  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2673  serine/threonine protein kinase  27.8 
 
 		 540 aa  60.8  0.00000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0573698  normal  0.794147 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0441  serine/threonine protein kinase  24.56 
 
 		 444 aa  60.8  0.00000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0406946  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1345  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  22.32 
 
 		 641 aa  60.8  0.00000007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.138962 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3163  serine/threonine protein kinase  23.49 
 
 		 761 aa  60.8  0.00000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.923539  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2288  serine/threonine protein kinase  27.8 
 
 		 771 aa  60.5  0.00000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000513908 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2845  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase  28.24 
 
 		 562 aa  60.5  0.00000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.985984  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3068  serine/threonine protein kinase  26.25 
 
 		 621 aa  60.5  0.00000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000268642  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0899  serine/threonine protein kinase  26.03 
 
 		 499 aa  60.5  0.00000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000818625  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0884  serine/threonine protein kinase with pentapeptide repeats  25.37 
 
 		 563 aa  60.5  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.741036  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0119  protein kinase  27.27 
 
 		 519 aa  60.5  0.00000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.251317  normal  0.292526 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4396  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  27.6 
 
 		 822 aa  59.7  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3730  serine/threonine protein kinase  30.14 
 
 		 687 aa  60.1  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00433941 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2867  serine/threonine protein kinase  29.88 
 
 		 615 aa  60.1  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.446  normal  0.384542 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0857  serine/threonine protein kinase with pentapeptide repeats  25.37 
 
 		 563 aa  60.5  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>