More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_4155 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_1707  putative protein kinase  56.01 
 
 		 611 aa  695    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0579  serine/threonine protein kinase, putative  78.99 
 
 		 602 aa  991    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01958  Serine/threonine protein kinase  51.8 
 
 		 624 aa  650    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000150408  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3729  serine/threonine protein kinase  78.49 
 
 		 602 aa  988    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0586  serine/threonine protein kinase  81.29 
 
 		 609 aa  1044    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3912  protein kinase  78.49 
 
 		 602 aa  987    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3786  protein kinase  78.32 
 
 		 602 aa  986    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4012  serine/threonine protein kinase  87.77 
 
 		 606 aa  1123    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000249675 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0539  protein kinase  73.61 
 
 		 600 aa  933    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2040  serine/threonine protein kinase  52.57 
 
 		 616 aa  652    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.529884  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0579  serine/threonine protein kinase  78.66 
 
 		 602 aa  986    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3451  serine/threonine protein kinase  78.82 
 
 		 602 aa  989    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3500  serine/threonine protein kinase  75.67 
 
 		 610 aa  968    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0578  serine/threonine protein kinase  78.82 
 
 		 602 aa  989    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0541  serine/threonine protein kinase, putative  74.79 
 
 		 606 aa  944    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.89559  decreased coverage  0.00419942 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1379  protein kinase  54.05 
 
 		 613 aa  685    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.688474  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0539  protein kinase  78.49 
 
 		 602 aa  988    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3263  serine/threonine protein kinase  82.23 
 
 		 611 aa  1049    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.507481  hitchhiker  0.00561071 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4155  serine/threonine protein kinase  100 
 
 		 623 aa  1297    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.922757  normal  0.593825 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3298  protein kinase  78.32 
 
 		 602 aa  990    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3788  serine/threonine protein kinase  27.04 
 
 		 505 aa  82  0.00000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.987521  normal  0.0424994 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0990  serine/threonine protein kinase  27.55 
 
 		 486 aa  75.5  0.000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000407261  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2278  serine/threonine protein kinase  31.3 
 
 		 752 aa  72.4  0.00000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0612166  hitchhiker  0.00000196574 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4235  serine/threonine protein kinase  27.14 
 
 		 381 aa  71.6  0.00000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0236  serine/threonine protein kinase  32.45 
 
 		 357 aa  71.2  0.00000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0764  serine/threonine kinase protein  24.89 
 
 		 662 aa  70.9  0.00000000007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000395129 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1519  protein kinase  29.91 
 
 		 762 aa  70.1  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.171741  hitchhiker  0.00214244 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3942  serine/threonine protein kinase with Chase2 sensor  24.41 
 
 		 907 aa  70.1  0.0000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0434  protein kinase  30.46 
 
 		 325 aa  68.9  0.0000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.631753  normal  1 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_12118  predicted protein  34.31 
 
 		 137 aa  68.6  0.0000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1714  protein kinase  25.68 
 
 		 621 aa  68.6  0.0000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0729  serine/threonine protein kinase  28.8 
 
 		 464 aa  68.2  0.0000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.44074  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4041  serine/threonine protein kinase  35.17 
 
 		 774 aa  67.8  0.0000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.224391  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1077  serine/threonine protein kinase  26.89 
 
 		 503 aa  68.2  0.0000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000527598  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1991  protein kinase  24.77 
 
 		 692 aa  67.4  0.0000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2578  serine/threonine protein kinase  28.63 
 
 		 985 aa  67  0.0000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.790371  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1588  protein kinase  26.2 
 
 		 604 aa  66.6  0.000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3751  serine/threonine protein kinase  35.24 
 
 		 478 aa  65.9  0.000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000729349  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0600  serine/threonine protein kinase  27.35 
 
 		 510 aa  65.9  0.000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0109114  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3944  Serine/threonine protein kinase-like  25.7 
 
 		 700 aa  65.9  0.000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.147415  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1235  serine/threonine protein kinase  27.37 
 
 		 628 aa  65.9  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2531  Serine/threonine protein kinase-like protein  26.98 
 
 		 511 aa  65.9  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.600049  normal  0.466461 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1709  serine/threonine protein kinase  24.77 
 
 		 691 aa  65.9  0.000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3543  serine/threonine protein kinase  28.31 
 
 		 537 aa  65.9  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0435506  normal  0.170453 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3946  serine/threonine protein kinase  27.93 
 
 		 587 aa  65.9  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0106209  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1100  serine/threonine protein kinase  26.64 
 
 		 1415 aa  65.1  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4550  serine/threonine protein kinase with pentapeptide repeats  30.37 
 
 		 526 aa  65.5  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.154716  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1274  serine/threonine protein kinase  23.29 
 
 		 378 aa  65.1  0.000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.456781  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3340  serine/threonine protein kinase  30.06 
 
 		 490 aa  65.5  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4351  serine/threonine protein kinase  24.54 
 
 		 882 aa  64.7  0.000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2948  serine/threonine protein kinase  28.14 
 
 		 638 aa  65.1  0.000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3670  protein kinase domain-containing protein  25.23 
 
 		 781 aa  64.7  0.000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.353968  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0336  serine/threonine protein kinase  25.5 
 
 		 777 aa  64.7  0.000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09960  protein kinase  24.62 
 
 		 638 aa  64.3  0.000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0207  kinase domain protein  29.68 
 
 		 637 aa  64.3  0.000000007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0857  serine/threonine protein kinase with pentapeptide repeats  32.03 
 
 		 563 aa  63.9  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0884  serine/threonine protein kinase with pentapeptide repeats  32.03 
 
 		 563 aa  63.9  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.741036  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3893  protein kinase  29.01 
 
 		 502 aa  63.5  0.000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1099  serine/threonine protein kinase  32.32 
 
 		 267 aa  63.5  0.00000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000152305  hitchhiker  0.0000000000000203974 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4320  serine/threonine protein kinase  35.45 
 
 		 590 aa  63.2  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0909086  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2062  serine/threonine protein kinase  26.34 
 
 		 617 aa  62.4  0.00000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3600  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  29.38 
 
 		 1072 aa  62.4  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0699  serine/threonine protein kinase  25.7 
 
 		 866 aa  62.4  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2501  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  26.21 
 
 		 1036 aa  62.8  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.120058  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3936  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  25 
 
 		 746 aa  62.8  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4531  serine/threonine protein kinase  26.87 
 
 		 646 aa  62.8  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.114343  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4975  serine/threonine protein kinase  25.2 
 
 		 580 aa  62  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.519124  normal  0.302776 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3532  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  29.38 
 
 		 1072 aa  62  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.397828  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1225  serine/threonine protein kinase with FHA domain protein  27.92 
 
 		 403 aa  62.4  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.553503 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2445  Serine/threonine protein kinase-related protein  24.44 
 
 		 896 aa  62  0.00000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.354619  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0789  serine/threonine kinase protein  22.73 
 
 		 614 aa  62  0.00000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.350319  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3066  serine/threonine protein kinase  26 
 
 		 1311 aa  62  0.00000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.454085  normal  0.0824446 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_68199  predicted protein  26.9 
 
 		 540 aa  62  0.00000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.220095 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0087  serine/threonine protein kinase  24.33 
 
 		 700 aa  62.4  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0353  serine/threonine kinase protein  30.84 
 
 		 427 aa  61.6  0.00000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.638448  normal  0.179862 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1529  protein kinase  29.46 
 
 		 774 aa  61.6  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2528  Serine/threonine protein kinase  22.31 
 
 		 376 aa  61.2  0.00000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2182  Serine/threonine protein kinase-related protein  28.83 
 
 		 1060 aa  61.6  0.00000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1658  Sel1-like repeat-containing serine/threonine protein kinase  25.87 
 
 		 599 aa  61.2  0.00000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3040  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  24.89 
 
 		 591 aa  60.8  0.00000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1602  protein kinase:GAF  31.06 
 
 		 790 aa  60.5  0.00000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.711215  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1116  Serine/threonine protein kinase-like  24.88 
 
 		 820 aa  60.5  0.00000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1311  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  25.22 
 
 		 584 aa  60.5  0.00000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.760538  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4390  serine/threonine protein kinase  26.67 
 
 		 938 aa  60.8  0.00000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.139237  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4023  serine/threonine protein kinase  27.54 
 
 		 414 aa  59.7  0.0000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0870  serine/threonine protein kinase  28.7 
 
 		 328 aa  60.1  0.0000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0995  protein kinase  27.6 
 
 		 586 aa  60.1  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.396652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0991  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  23.26 
 
 		 551 aa  60.1  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4391  Serine/threonine protein kinase  27.4 
 
 		 546 aa  60.5  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000198345 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3083  serine/threonine protein kinase  26.69 
 
 		 461 aa  60.1  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2631  protein kinase  24.15 
 
 		 593 aa  59.7  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3685  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  24.31 
 
 		 657 aa  60.5  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.210183  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1700  Serine/threonine protein kinase  25.37 
 
 		 425 aa  59.7  0.0000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1325  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  24.53 
 
 		 650 aa  59.7  0.0000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1079  serine/threonine protein kinase  26.92 
 
 		 422 aa  59.3  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.197837  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6045  serine/threonine protein kinase  25.35 
 
 		 842 aa  58.9  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0921  protein kinase  30.14 
 
 		 651 aa  59.3  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0130475  normal  0.23221 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1479  serine/threonine protein kinase  25.17 
 
 		 571 aa  59.7  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.336782 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0021  serine/threonine protein kinase  25.5 
 
 		 666 aa  59.7  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2960  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  30.77 
 
 		 602 aa  59.7  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.602152  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>