More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_3298 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003910  CPS_1707  putative protein kinase  57.87 
 
 
611 aa  728    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0579  serine/threonine protein kinase, putative  93.19 
 
 
602 aa  1170    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3729  serine/threonine protein kinase  94.19 
 
 
602 aa  1188    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3786  protein kinase  94.02 
 
 
602 aa  1186    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0539  protein kinase  78.96 
 
 
600 aa  999    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0586  serine/threonine protein kinase  81.3 
 
 
609 aa  1034    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2040  serine/threonine protein kinase  55.15 
 
 
616 aa  677    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.529884  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3912  protein kinase  94.19 
 
 
602 aa  1189    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0579  serine/threonine protein kinase  93.52 
 
 
602 aa  1174    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3451  serine/threonine protein kinase  94.19 
 
 
602 aa  1181    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3500  serine/threonine protein kinase  79.4 
 
 
610 aa  1020    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0578  serine/threonine protein kinase  94.02 
 
 
602 aa  1179    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4155  serine/threonine protein kinase  78.32 
 
 
623 aa  990    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.922757  normal  0.593825 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0541  serine/threonine protein kinase, putative  80.47 
 
 
606 aa  1009    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.89559  decreased coverage  0.00419942 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1379  protein kinase  56.6 
 
 
613 aa  714    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.688474  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0539  protein kinase  94.35 
 
 
602 aa  1191    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3263  serine/threonine protein kinase  79.83 
 
 
611 aa  1014    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.507481  hitchhiker  0.00561071 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4012  serine/threonine protein kinase  77.85 
 
 
606 aa  987    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  unclonable  0.000000000249675 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3298  protein kinase  100 
 
 
602 aa  1248    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01958  Serine/threonine protein kinase  51.14 
 
 
624 aa  654    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000150408  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3788  serine/threonine protein kinase  32.57 
 
 
505 aa  81.6  0.00000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.987521  normal  0.0424994 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0764  serine/threonine kinase protein  27.56 
 
 
662 aa  79.7  0.0000000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000395129 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0236  serine/threonine protein kinase  34.46 
 
 
357 aa  74.3  0.000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2948  serine/threonine protein kinase  28.9 
 
 
638 aa  73.6  0.00000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1077  serine/threonine protein kinase  27.4 
 
 
503 aa  72.4  0.00000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000527598  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2278  serine/threonine protein kinase  31.74 
 
 
752 aa  71.6  0.00000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0612166  hitchhiker  0.00000196574 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1714  protein kinase  26.48 
 
 
621 aa  72  0.00000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3340  serine/threonine protein kinase  29.73 
 
 
490 aa  71.6  0.00000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1588  protein kinase  28.79 
 
 
604 aa  71.2  0.00000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0336  serine/threonine protein kinase  27.72 
 
 
777 aa  70.9  0.00000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1519  protein kinase  31.78 
 
 
762 aa  71.2  0.00000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.171741  hitchhiker  0.00214244 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5305  serine/threonine protein kinase  26.91 
 
 
645 aa  70.5  0.00000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.704424  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3893  protein kinase  28.38 
 
 
502 aa  69.7  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4550  serine/threonine protein kinase with pentapeptide repeats  31.32 
 
 
526 aa  70.5  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.154716  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0991  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  25 
 
 
551 aa  69.3  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1100  serine/threonine protein kinase  28.04 
 
 
1415 aa  69.7  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3946  serine/threonine protein kinase  30.73 
 
 
587 aa  68.9  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0106209  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0600  serine/threonine protein kinase  29.6 
 
 
510 aa  68.9  0.0000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0109114  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4235  serine/threonine protein kinase  27.86 
 
 
381 aa  68.6  0.0000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0789  serine/threonine kinase protein  22.95 
 
 
614 aa  68.2  0.0000000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.350319  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4709  serine/threonine protein kinase  27.82 
 
 
557 aa  67.8  0.0000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0899  serine/threonine protein kinase  26.47 
 
 
499 aa  67.4  0.0000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000818625  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0780  serine/threonine protein kinase  30.08 
 
 
457 aa  67  0.000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.113085 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1529  protein kinase  30.7 
 
 
774 aa  66.6  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0353  serine/threonine kinase protein  28.57 
 
 
427 aa  65.9  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.638448  normal  0.179862 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4391  Serine/threonine protein kinase  29.22 
 
 
546 aa  66.2  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000198345 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3083  serine/threonine protein kinase  27.07 
 
 
461 aa  65.9  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2578  serine/threonine protein kinase  26.33 
 
 
985 aa  65.9  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.790371  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1991  protein kinase  22.79 
 
 
692 aa  65.9  0.000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09960  protein kinase  24.44 
 
 
638 aa  66.2  0.000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3570  serine/threonine protein kinase  31.21 
 
 
1479 aa  65.9  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0837409 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3543  serine/threonine protein kinase  26.53 
 
 
537 aa  65.5  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0435506  normal  0.170453 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3276  serine/threonine kinase protein  27.8 
 
 
475 aa  64.7  0.000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.162967  normal  0.186689 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0990  serine/threonine protein kinase  24.48 
 
 
486 aa  64.7  0.000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000407261  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3936  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  28.97 
 
 
746 aa  64.7  0.000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0699  serine/threonine protein kinase  25.78 
 
 
866 aa  64.7  0.000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3944  Serine/threonine protein kinase-like  26.17 
 
 
700 aa  63.9  0.000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.147415  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1709  serine/threonine protein kinase  22.79 
 
 
691 aa  63.9  0.000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6388  serine/threonine protein kinase  30.84 
 
 
391 aa  63.9  0.000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0434  protein kinase  23.43 
 
 
325 aa  63.5  0.00000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.631753  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1067  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  26.03 
 
 
653 aa  63.2  0.00000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1602  protein serine/threonine phosphatase  30.91 
 
 
556 aa  63.2  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.022391  hitchhiker  0.00581256 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0995  protein kinase  26.88 
 
 
586 aa  63.5  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.396652  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2288  serine/threonine protein kinase  29.15 
 
 
771 aa  62.4  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000513908 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1099  serine/threonine protein kinase  32.47 
 
 
267 aa  62.8  0.00000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000152305  hitchhiker  0.0000000000000203974 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4041  serine/threonine protein kinase  35.62 
 
 
774 aa  62.4  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.224391  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0087  serine/threonine protein kinase  26.94 
 
 
700 aa  62.4  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1235  serine/threonine protein kinase  30.97 
 
 
628 aa  62.8  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2867  serine/threonine protein kinase  32.12 
 
 
615 aa  62.8  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.446  normal  0.384542 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0857  serine/threonine protein kinase with pentapeptide repeats  28.81 
 
 
563 aa  63.2  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0701  serine/threonine kinase protein  27.91 
 
 
500 aa  62.8  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000041573  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3751  serine/threonine protein kinase  29.82 
 
 
478 aa  63.2  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000729349  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2336  protein kinase  33.88 
 
 
684 aa  62.8  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1450  diguanylate cyclase  25.18 
 
 
1774 aa  63.2  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0884  serine/threonine protein kinase with pentapeptide repeats  28.81 
 
 
563 aa  62.8  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.741036  normal 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_12118  predicted protein  31.62 
 
 
137 aa  62  0.00000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31690  protein kinase family protein  27.76 
 
 
643 aa  62  0.00000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0067  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  30.17 
 
 
622 aa  62  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_41728  predicted protein  26.77 
 
 
323 aa  62  0.00000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000183464  hitchhiker  0.00347686 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0205  serine/threonine protein kinase with pentapeptide repeats  28.65 
 
 
537 aa  62.4  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.47043 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2673  serine/threonine protein kinase  28.46 
 
 
540 aa  61.6  0.00000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0573698  normal  0.794147 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3068  serine/threonine protein kinase  27.41 
 
 
621 aa  61.6  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000268642  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40725  predicted protein  25.58 
 
 
293 aa  61.6  0.00000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.316803  normal  0.0251732 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2393  serine/threonine protein kinase  25.09 
 
 
457 aa  61.2  0.00000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.380399  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2990  Serine/threonine protein kinase  26.47 
 
 
442 aa  61.2  0.00000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.0000000000108087  normal  0.539453 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3757  serine/threonine protein kinase  29.19 
 
 
466 aa  61.2  0.00000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4390  serine/threonine protein kinase  27.03 
 
 
938 aa  61.2  0.00000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.139237  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0928  serine/threonine protein kinase  26.33 
 
 
761 aa  61.2  0.00000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000612403  hitchhiker  1.21149e-16 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3670  protein kinase domain-containing protein  27.36 
 
 
781 aa  60.8  0.00000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.353968  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2673  serine/threonine protein kinase  32.03 
 
 
533 aa  60.8  0.00000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2091  serine/threonine-protein kinase, putative  30.45 
 
 
556 aa  60.8  0.00000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0473599 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1079  serine/threonine protein kinase  27.46 
 
 
422 aa  60.8  0.00000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.197837  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4681  Serine/threonine protein kinase  35.56 
 
 
161 aa  60.8  0.00000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5416  serine/threonine protein kinase  38.74 
 
 
583 aa  60.8  0.00000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.281665  normal  0.125705 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0111  serine/threonine protein kinase  23.08 
 
 
526 aa  60.8  0.00000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.380254  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4320  serine/threonine protein kinase  40 
 
 
590 aa  60.5  0.00000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0909086  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1844  protein kinase  26.81 
 
 
485 aa  60.8  0.00000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1340  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  24.75 
 
 
662 aa  60.5  0.00000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.458756 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3659  protein kinase  25.76 
 
 
599 aa  59.7  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.340098  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0621  serine/threonine kinase protein  26.18 
 
 
407 aa  59.7  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.109473  hitchhiker  0.00845056 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>