More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_0539 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_1707  putative protein kinase  55.41 
 
 		 611 aa  695    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0579  serine/threonine protein kinase, putative  79.63 
 
 		 602 aa  1008    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0539  protein kinase  100 
 
 		 600 aa  1254    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3912  protein kinase  79.3 
 
 		 602 aa  998    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2040  serine/threonine protein kinase  54.98 
 
 		 616 aa  681    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.529884  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3729  serine/threonine protein kinase  79.63 
 
 		 602 aa  1002    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01958  Serine/threonine protein kinase  51.8 
 
 		 624 aa  649    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000150408  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0579  serine/threonine protein kinase  79.63 
 
 		 602 aa  1004    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3451  serine/threonine protein kinase  79.47 
 
 		 602 aa  1005    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3500  serine/threonine protein kinase  79.26 
 
 		 610 aa  1007    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0578  serine/threonine protein kinase  79.63 
 
 		 602 aa  1006    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0541  serine/threonine protein kinase, putative  74.25 
 
 		 606 aa  937    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.89559  decreased coverage  0.00419942 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1379  protein kinase  55.78 
 
 		 613 aa  708    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.688474  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0539  protein kinase  79.47 
 
 		 602 aa  999    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3263  serine/threonine protein kinase  77.55 
 
 		 611 aa  975    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.507481  hitchhiker  0.00561071 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3786  protein kinase  79.47 
 
 		 602 aa  999    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4012  serine/threonine protein kinase  73.83 
 
 		 606 aa  937    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000249675 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4155  serine/threonine protein kinase  73.61 
 
 		 623 aa  933    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.922757  normal  0.593825 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3298  protein kinase  78.96 
 
 		 602 aa  999    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0586  serine/threonine protein kinase  74.67 
 
 		 609 aa  956    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1519  protein kinase  31.46 
 
 		 762 aa  82.8  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.171741  hitchhiker  0.00214244 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0236  serine/threonine protein kinase  34.46 
 
 		 357 aa  82  0.00000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3788  serine/threonine protein kinase  30.28 
 
 		 505 aa  81.3  0.00000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.987521  normal  0.0424994 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2278  serine/threonine protein kinase  30.36 
 
 		 752 aa  78.6  0.0000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0612166  hitchhiker  0.00000196574 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0764  serine/threonine kinase protein  27.15 
 
 		 662 aa  74.7  0.000000000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000395129 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2062  serine/threonine protein kinase  28.35 
 
 		 617 aa  73.6  0.00000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0789  serine/threonine kinase protein  26.55 
 
 		 614 aa  71.2  0.00000000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.350319  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1529  protein kinase  30.37 
 
 		 774 aa  71.2  0.00000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2578  serine/threonine protein kinase  26.67 
 
 		 985 aa  70.9  0.00000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.790371  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0336  serine/threonine protein kinase  29.11 
 
 		 777 aa  70.5  0.00000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0600  serine/threonine protein kinase  27.23 
 
 		 510 aa  70.5  0.00000000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0109114  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3340  serine/threonine protein kinase  27.6 
 
 		 490 aa  70.1  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6388  serine/threonine protein kinase  27.38 
 
 		 391 aa  69.7  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3942  serine/threonine protein kinase with Chase2 sensor  27.41 
 
 		 907 aa  68.9  0.0000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0780  serine/threonine protein kinase  29.13 
 
 		 457 aa  68.2  0.0000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.113085 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0353  serine/threonine kinase protein  35.51 
 
 		 427 aa  68.2  0.0000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.638448  normal  0.179862 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5305  serine/threonine protein kinase  23.9 
 
 		 645 aa  68.2  0.0000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.704424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3893  protein kinase  27.93 
 
 		 502 aa  67.8  0.0000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4391  Serine/threonine protein kinase  28.82 
 
 		 546 aa  67.4  0.0000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000198345 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0990  serine/threonine protein kinase  24.61 
 
 		 486 aa  66.2  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000407261  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2948  serine/threonine protein kinase  27.1 
 
 		 638 aa  67  0.000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4235  serine/threonine protein kinase  24.64 
 
 		 381 aa  65.9  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4041  serine/threonine protein kinase  31.4 
 
 		 774 aa  65.1  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.224391  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31690  protein kinase family protein  26.88 
 
 		 643 aa  65.1  0.000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6223  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  24.5 
 
 		 994 aa  64.7  0.000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3946  serine/threonine protein kinase  30.17 
 
 		 587 aa  65.1  0.000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0106209  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2867  serine/threonine protein kinase  29.88 
 
 		 615 aa  64.3  0.000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.446  normal  0.384542 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0699  serine/threonine protein kinase  24.78 
 
 		 866 aa  64.3  0.000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5416  serine/threonine protein kinase  41.96 
 
 		 583 aa  64.7  0.000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.281665  normal  0.125705 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1588  protein kinase  26.73 
 
 		 604 aa  63.9  0.000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1077  serine/threonine protein kinase  25.12 
 
 		 503 aa  63.9  0.000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000527598  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2182  Serine/threonine protein kinase-related protein  30.29 
 
 		 1060 aa  63.9  0.000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1714  protein kinase  24.66 
 
 		 621 aa  63.9  0.000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0995  protein kinase  30.29 
 
 		 586 aa  63.9  0.000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.396652  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3670  protein kinase domain-containing protein  23.13 
 
 		 781 aa  63.2  0.00000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.353968  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4550  serine/threonine protein kinase with pentapeptide repeats  29.09 
 
 		 526 aa  63.2  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.154716  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4709  serine/threonine protein kinase  27.07 
 
 		 557 aa  63.5  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3751  serine/threonine protein kinase  38.1 
 
 		 478 aa  63.5  0.00000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000729349  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1099  serine/threonine protein kinase  29.57 
 
 		 267 aa  63.2  0.00000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000152305  hitchhiker  0.0000000000000203974 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2288  serine/threonine protein kinase  28.25 
 
 		 771 aa  63.2  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000513908 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1100  serine/threonine protein kinase  26.17 
 
 		 1415 aa  63.2  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2393  serine/threonine protein kinase  27.98 
 
 		 457 aa  63.2  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.380399  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1225  serine/threonine protein kinase with FHA domain protein  28.57 
 
 		 403 aa  62.8  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.553503 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1235  serine/threonine protein kinase  30.67 
 
 		 628 aa  62.8  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3543  serine/threonine protein kinase  28.81 
 
 		 537 aa  62.4  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0435506  normal  0.170453 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3757  serine/threonine protein kinase  29.8 
 
 		 466 aa  62.4  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1658  Sel1-like repeat-containing serine/threonine protein kinase  25.57 
 
 		 599 aa  62  0.00000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0422  serine/threonine protein kinase  26.91 
 
 		 600 aa  62  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.709913  normal  0.835899 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0899  serine/threonine protein kinase  24.6 
 
 		 499 aa  61.6  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000818625  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4023  serine/threonine protein kinase  28.74 
 
 		 414 aa  61.2  0.00000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2164  serine/threonine protein kinase  35.85 
 
 		 652 aa  61.2  0.00000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.563698  hitchhiker  0.00000786383 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0434  protein kinase  24.07 
 
 		 325 aa  61.2  0.00000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.631753  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0927  serine/threonine protein kinase  29.09 
 
 		 553 aa  61.2  0.00000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0119  protein kinase  23.57 
 
 		 519 aa  61.2  0.00000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.251317  normal  0.292526 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3840  serine/threonine protein kinase  29.61 
 
 		 466 aa  61.2  0.00000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0136838  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0087  serine/threonine protein kinase  26.72 
 
 		 700 aa  60.8  0.00000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0069  putative serine/threonine protein kinase  24.79 
 
 		 360 aa  60.8  0.00000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.446321 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2960  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  28.49 
 
 		 602 aa  60.8  0.00000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.602152  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4532  serine/threonine protein kinase  26.07 
 
 		 642 aa  60.8  0.00000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000271647  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1450  diguanylate cyclase  24.12 
 
 		 1774 aa  60.5  0.00000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3066  serine/threonine protein kinase  25.5 
 
 		 1311 aa  60.5  0.00000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.454085  normal  0.0824446 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1079  serine/threonine protein kinase  28.25 
 
 		 422 aa  60.5  0.00000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.197837  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_12118  predicted protein  28.47 
 
 		 137 aa  60.5  0.0000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1052  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  26.32 
 
 		 798 aa  59.7  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.687735 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0235  serine/threonine protein kinase  27.6 
 
 		 415 aa  59.7  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3163  serine/threonine protein kinase  29.41 
 
 		 761 aa  59.7  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.923539  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1921  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  25.46 
 
 		 642 aa  60.1  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0364982  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3570  serine/threonine protein kinase  23.77 
 
 		 1479 aa  59.7  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0837409 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3083  serine/threonine protein kinase  26.82 
 
 		 461 aa  59.3  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1116  Serine/threonine protein kinase-like  25.23 
 
 		 820 aa  59.3  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1340  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  24 
 
 		 662 aa  58.9  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.458756 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4320  serine/threonine protein kinase  32.77 
 
 		 590 aa  59.7  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0909086  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42880  serine-threonine kinase Stk1  28.19 
 
 		 329 aa  59.7  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.576441 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5242  serine/threonine protein kinase  27.03 
 
 		 581 aa  58.9  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.151896  normal  0.314771 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0067  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  28.38 
 
 		 622 aa  58.5  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2237  serine/threonine protein kinase  25.85 
 
 		 512 aa  58.5  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3068  serine/threonine protein kinase  26.36 
 
 		 621 aa  58.9  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000268642  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2291  serine/threonine protein kinase  25.85 
 
 		 512 aa  58.5  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.76151  normal  0.0202903 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1465  protein kinase  34.91 
 
 		 653 aa  58.5  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.355835  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2631  protein kinase  26.55 
 
 		 593 aa  58.9  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>