More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_4012 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_1707  putative protein kinase  54.52 
 
 		 611 aa  680    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0579  serine/threonine protein kinase, putative  78.36 
 
 		 602 aa  989    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0586  serine/threonine protein kinase  85.12 
 
 		 609 aa  1075    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3729  serine/threonine protein kinase  78.02 
 
 		 602 aa  988    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3912  protein kinase  78.02 
 
 		 602 aa  988    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0539  protein kinase  73.83 
 
 		 600 aa  937    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2040  serine/threonine protein kinase  53.55 
 
 		 616 aa  659    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.529884  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0579  serine/threonine protein kinase  78.26 
 
 		 602 aa  989    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3451  serine/threonine protein kinase  78.52 
 
 		 602 aa  994    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3500  serine/threonine protein kinase  75.04 
 
 		 610 aa  962    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3786  protein kinase  77.85 
 
 		 602 aa  986    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0578  serine/threonine protein kinase  78.52 
 
 		 602 aa  994    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4012  serine/threonine protein kinase  100 
 
 		 606 aa  1262    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000249675 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0541  serine/threonine protein kinase, putative  75.17 
 
 		 606 aa  960    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.89559  decreased coverage  0.00419942 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1379  protein kinase  55.21 
 
 		 613 aa  694    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.688474  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4155  serine/threonine protein kinase  87.77 
 
 		 623 aa  1123    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.922757  normal  0.593825 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0539  protein kinase  78.02 
 
 		 602 aa  989    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3263  serine/threonine protein kinase  83.75 
 
 		 611 aa  1078    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.507481  hitchhiker  0.00561071 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01958  Serine/threonine protein kinase  52.78 
 
 		 624 aa  655    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000150408  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3298  protein kinase  77.85 
 
 		 602 aa  987    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0764  serine/threonine kinase protein  25.78 
 
 		 662 aa  81.6  0.00000000000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000395129 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0236  serine/threonine protein kinase  34.44 
 
 		 357 aa  76.6  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3788  serine/threonine protein kinase  25.72 
 
 		 505 aa  76.3  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.987521  normal  0.0424994 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1077  serine/threonine protein kinase  28.31 
 
 		 503 aa  74.3  0.000000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000527598  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0789  serine/threonine kinase protein  27.39 
 
 		 614 aa  74.3  0.000000000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.350319  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0990  serine/threonine protein kinase  27.92 
 
 		 486 aa  74.3  0.000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000407261  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1529  protein kinase  31.31 
 
 		 774 aa  73.6  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4550  serine/threonine protein kinase with pentapeptide repeats  31.87 
 
 		 526 aa  72.4  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.154716  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1274  serine/threonine protein kinase  23.76 
 
 		 378 aa  72  0.00000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.456781  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0600  serine/threonine protein kinase  29.31 
 
 		 510 aa  72  0.00000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0109114  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1519  protein kinase  29.77 
 
 		 762 aa  72  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.171741  hitchhiker  0.00214244 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0884  serine/threonine protein kinase with pentapeptide repeats  32.14 
 
 		 563 aa  72  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.741036  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0857  serine/threonine protein kinase with pentapeptide repeats  32.14 
 
 		 563 aa  72  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4351  serine/threonine protein kinase  25.51 
 
 		 882 aa  72.4  0.00000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0207  kinase domain protein  29.36 
 
 		 637 aa  71.6  0.00000000004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0699  serine/threonine protein kinase  27.35 
 
 		 866 aa  71.6  0.00000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1100  serine/threonine protein kinase  26.94 
 
 		 1415 aa  71.2  0.00000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2278  serine/threonine protein kinase  30 
 
 		 752 aa  70.9  0.00000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0612166  hitchhiker  0.00000196574 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_12118  predicted protein  34.53 
 
 		 137 aa  70.5  0.00000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3942  serine/threonine protein kinase with Chase2 sensor  24.74 
 
 		 907 aa  70.5  0.0000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1714  protein kinase  26.2 
 
 		 621 aa  70.5  0.0000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1782  protein serine/threonine phosphatase  27.91 
 
 		 556 aa  69.7  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4235  serine/threonine protein kinase  25.26 
 
 		 381 aa  69.3  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2182  Serine/threonine protein kinase-related protein  31.02 
 
 		 1060 aa  69.3  0.0000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09960  protein kinase  26.2 
 
 		 638 aa  69.7  0.0000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1602  protein serine/threonine phosphatase  30.73 
 
 		 556 aa  68.6  0.0000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.022391  hitchhiker  0.00581256 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1991  protein kinase  24.43 
 
 		 692 aa  68.6  0.0000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3670  protein kinase domain-containing protein  24.89 
 
 		 781 aa  68.2  0.0000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.353968  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3685  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  24.68 
 
 		 657 aa  68.2  0.0000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.210183  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4531  serine/threonine protein kinase  26.87 
 
 		 646 aa  68.2  0.0000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.114343  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1116  Serine/threonine protein kinase-like  25.54 
 
 		 820 aa  68.6  0.0000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0995  protein kinase  29.68 
 
 		 586 aa  67.4  0.0000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.396652  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2578  serine/threonine protein kinase  24.32 
 
 		 985 aa  67.4  0.0000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.790371  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0336  serine/threonine protein kinase  27.06 
 
 		 777 aa  66.6  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1709  serine/threonine protein kinase  24.43 
 
 		 691 aa  67  0.000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2288  serine/threonine protein kinase  28.25 
 
 		 771 aa  66.6  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000513908 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2091  serine/threonine-protein kinase, putative  30.28 
 
 		 556 aa  66.2  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0473599 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3727  protein kinase  24.62 
 
 		 569 aa  66.2  0.000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000615107 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0434  protein kinase  22.41 
 
 		 325 aa  66.2  0.000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.631753  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1789  serine/threonine protein kinase with Chase2 sensor  22.54 
 
 		 666 aa  65.9  0.000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4605  serine/threonine protein kinase  26.74 
 
 		 618 aa  65.5  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000214735  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2445  Serine/threonine protein kinase-related protein  25.79 
 
 		 896 aa  65.5  0.000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.354619  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1700  Serine/threonine protein kinase  24.35 
 
 		 425 aa  65.5  0.000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0353  serine/threonine kinase protein  27.92 
 
 		 427 aa  65.5  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.638448  normal  0.179862 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2531  Serine/threonine protein kinase-like protein  26.82 
 
 		 511 aa  65.1  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.600049  normal  0.466461 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2155  serine/threonine protein kinase  29.65 
 
 		 783 aa  65.5  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3944  Serine/threonine protein kinase-like  24.77 
 
 		 700 aa  65.5  0.000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.147415  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35230  serine/threonine protein kinase  25.33 
 
 		 531 aa  65.5  0.000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.812554  normal  0.572815 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3904  serine/threonine protein kinase  25.64 
 
 		 657 aa  65.1  0.000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.331218  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3713  serine/threonine protein kinase  25.64 
 
 		 657 aa  64.7  0.000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.465838  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3603  serine/threonine protein kinase  25.64 
 
 		 657 aa  64.7  0.000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3621  serine/threonine protein kinase  25.64 
 
 		 657 aa  65.1  0.000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3543  serine/threonine protein kinase  27.65 
 
 		 537 aa  64.7  0.000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0435506  normal  0.170453 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4000  serine/threonine protein kinase  25.64 
 
 		 657 aa  64.7  0.000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3910  serine/threonine protein kinase  25.64 
 
 		 657 aa  64.7  0.000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00106725  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3876  serine/threonine protein kinase  25.64 
 
 		 657 aa  64.7  0.000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.95559e-22 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0205  serine/threonine protein kinase with pentapeptide repeats  32.04 
 
 		 537 aa  64.3  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.47043 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2528  Serine/threonine protein kinase  22.9 
 
 		 376 aa  64.3  0.000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4041  serine/threonine protein kinase  34.48 
 
 		 774 aa  64.7  0.000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.224391  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1340  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  25.1 
 
 		 662 aa  64.7  0.000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.458756 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3946  serine/threonine protein kinase  27.27 
 
 		 587 aa  64.7  0.000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0106209  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1479  serine/threonine protein kinase  25.61 
 
 		 571 aa  64.3  0.000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.336782 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0928  serine/threonine protein kinase  25.23 
 
 		 761 aa  64.3  0.000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000612403  hitchhiker  1.21149e-16 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2960  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  27.31 
 
 		 602 aa  64.3  0.000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.602152  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3961  serine/threonine protein kinase  25.64 
 
 		 657 aa  64.3  0.000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.95648  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1282  serine/threonine protein kinase  25.64 
 
 		 657 aa  64.3  0.000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00711344 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4320  serine/threonine protein kinase  36.36 
 
 		 590 aa  64.3  0.000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0909086  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0069  putative serine/threonine protein kinase  25.12 
 
 		 360 aa  63.9  0.000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.446321 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3893  protein kinase  24.35 
 
 		 502 aa  63.9  0.000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1235  serine/threonine protein kinase  28 
 
 		 628 aa  63.9  0.000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3532  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  29.17 
 
 		 1072 aa  63.9  0.000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.397828  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3681  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  22.94 
 
 		 664 aa  63.9  0.000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6388  serine/threonine protein kinase  27.71 
 
 		 391 aa  63.5  0.000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3558  protein kinase  28.44 
 
 		 1100 aa  63.2  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.911308  normal  0.0649803 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2631  protein kinase  24.58 
 
 		 593 aa  63.2  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6332  serine/threonine protein kinase  25.09 
 
 		 895 aa  63.5  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.174056  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4391  Serine/threonine protein kinase  27.85 
 
 		 546 aa  63.2  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000198345 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1169  protein kinase  25 
 
 		 634 aa  63.5  0.00000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000304799  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4390  serine/threonine protein kinase  27.11 
 
 		 938 aa  63.5  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.139237  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3600  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  29.17 
 
 		 1072 aa  63.2  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>