More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal_0539 on replicon NC_009052
Organism: Shewanella baltica OS155



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003910  CPS_1707  putative protein kinase  56.89 
 
 
611 aa  709    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0579  serine/threonine protein kinase, putative  93.69 
 
 
602 aa  1181    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3786  protein kinase  99.67 
 
 
602 aa  1246    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0539  protein kinase  79.47 
 
 
600 aa  999    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3912  protein kinase  99.83 
 
 
602 aa  1248    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2040  serine/threonine protein kinase  54.65 
 
 
616 aa  673    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.529884  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0579  serine/threonine protein kinase  94.02 
 
 
602 aa  1184    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3451  serine/threonine protein kinase  94.68 
 
 
602 aa  1192    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3500  serine/threonine protein kinase  79.57 
 
 
610 aa  1025    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4155  serine/threonine protein kinase  78.49 
 
 
623 aa  988    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.922757  normal  0.593825 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0578  serine/threonine protein kinase  94.52 
 
 
602 aa  1189    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0541  serine/threonine protein kinase, putative  80.3 
 
 
606 aa  1012    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.89559  decreased coverage  0.00419942 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4012  serine/threonine protein kinase  78.02 
 
 
606 aa  989    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  unclonable  0.000000000249675 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1379  protein kinase  56.11 
 
 
613 aa  710    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.688474  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0586  serine/threonine protein kinase  81.64 
 
 
609 aa  1031    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0539  protein kinase  100 
 
 
602 aa  1249    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01958  Serine/threonine protein kinase  51.3 
 
 
624 aa  654    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000150408  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3263  serine/threonine protein kinase  80.83 
 
 
611 aa  1019    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.507481  hitchhiker  0.00561071 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3729  serine/threonine protein kinase  99.83 
 
 
602 aa  1248    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3298  protein kinase  94.35 
 
 
602 aa  1191    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3788  serine/threonine protein kinase  27.99 
 
 
505 aa  80.9  0.00000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.987521  normal  0.0424994 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0236  serine/threonine protein kinase  35.14 
 
 
357 aa  77.8  0.0000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0764  serine/threonine kinase protein  26.55 
 
 
662 aa  77  0.000000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000395129 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5305  serine/threonine protein kinase  26 
 
 
645 aa  71.2  0.00000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.704424  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1714  protein kinase  26.03 
 
 
621 aa  70.5  0.00000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2948  serine/threonine protein kinase  28.52 
 
 
638 aa  70.5  0.00000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1519  protein kinase  30.84 
 
 
762 aa  70.1  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.171741  hitchhiker  0.00214244 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1588  protein kinase  28.28 
 
 
604 aa  70.1  0.0000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0780  serine/threonine protein kinase  32.78 
 
 
457 aa  68.9  0.0000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.113085 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2278  serine/threonine protein kinase  30.87 
 
 
752 aa  68.9  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0612166  hitchhiker  0.00000196574 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3083  serine/threonine protein kinase  28.2 
 
 
461 aa  68.6  0.0000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3340  serine/threonine protein kinase  27.15 
 
 
490 aa  67.8  0.0000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1100  serine/threonine protein kinase  28.5 
 
 
1415 aa  68.2  0.0000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1602  protein serine/threonine phosphatase  31.36 
 
 
556 aa  67.4  0.0000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.022391  hitchhiker  0.00581256 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4391  Serine/threonine protein kinase  30.14 
 
 
546 aa  67.4  0.0000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000198345 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2062  serine/threonine protein kinase  27.69 
 
 
617 aa  67  0.0000000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6388  serine/threonine protein kinase  28.97 
 
 
391 aa  66.6  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1529  protein kinase  30.37 
 
 
774 aa  66.6  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0336  serine/threonine protein kinase  27.02 
 
 
777 aa  66.6  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4235  serine/threonine protein kinase  27.14 
 
 
381 aa  67  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1991  protein kinase  25.46 
 
 
692 aa  66.6  0.000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3946  serine/threonine protein kinase  29.02 
 
 
587 aa  66.6  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0106209  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1077  serine/threonine protein kinase  26.48 
 
 
503 aa  65.9  0.000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000527598  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3893  protein kinase  24.21 
 
 
502 aa  65.9  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09960  protein kinase  25.19 
 
 
638 aa  65.9  0.000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1340  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  25.99 
 
 
662 aa  66.2  0.000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.458756 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0991  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  23.46 
 
 
551 aa  65.5  0.000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2578  serine/threonine protein kinase  25.58 
 
 
985 aa  65.5  0.000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.790371  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4550  serine/threonine protein kinase with pentapeptide repeats  29.65 
 
 
526 aa  65.1  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.154716  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0699  serine/threonine protein kinase  24.89 
 
 
866 aa  64.7  0.000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4390  serine/threonine protein kinase  27.23 
 
 
938 aa  64.3  0.000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.139237  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3751  serine/threonine protein kinase  29.24 
 
 
478 aa  64.3  0.000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000729349  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0990  serine/threonine protein kinase  24.22 
 
 
486 aa  64.7  0.000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000407261  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1709  serine/threonine protein kinase  26.48 
 
 
691 aa  64.3  0.000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2336  protein kinase  33.88 
 
 
684 aa  64.3  0.000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6223  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  25.6 
 
 
994 aa  63.9  0.000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3543  serine/threonine protein kinase  29.94 
 
 
537 aa  63.5  0.000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0435506  normal  0.170453 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3670  protein kinase domain-containing protein  27.23 
 
 
781 aa  63.5  0.00000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.353968  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0729  serine/threonine protein kinase  29.65 
 
 
464 aa  63.5  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.44074  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1067  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  25.33 
 
 
653 aa  63.2  0.00000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4709  serine/threonine protein kinase  25.94 
 
 
557 aa  63.5  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1099  serine/threonine protein kinase  32.9 
 
 
267 aa  63.2  0.00000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000152305  hitchhiker  0.0000000000000203974 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0995  protein kinase  27.19 
 
 
586 aa  63.2  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.396652  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3936  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  27.57 
 
 
746 aa  62.8  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0434  protein kinase  24.04 
 
 
325 aa  62.4  0.00000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.631753  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0789  serine/threonine kinase protein  21.99 
 
 
614 aa  62.8  0.00000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.350319  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1450  diguanylate cyclase  24.45 
 
 
1774 aa  61.6  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3369  serine/threonine protein kinase  26.02 
 
 
455 aa  62  0.00000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0928  serine/threonine protein kinase  24.15 
 
 
761 aa  62  0.00000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000612403  hitchhiker  1.21149e-16 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3659  protein kinase  25.42 
 
 
599 aa  62  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.340098  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2112  protein kinase  29.91 
 
 
477 aa  62  0.00000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0811991 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2091  serine/threonine-protein kinase, putative  30 
 
 
556 aa  61.6  0.00000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0473599 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0353  serine/threonine kinase protein  27.54 
 
 
427 aa  61.6  0.00000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.638448  normal  0.179862 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4681  Serine/threonine protein kinase  34.81 
 
 
161 aa  61.6  0.00000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1235  serine/threonine protein kinase  28.83 
 
 
628 aa  61.6  0.00000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40725  predicted protein  25.48 
 
 
293 aa  61.6  0.00000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.316803  normal  0.0251732 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0857  serine/threonine protein kinase with pentapeptide repeats  27.45 
 
 
563 aa  61.2  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3942  serine/threonine protein kinase with Chase2 sensor  25.5 
 
 
907 aa  61.2  0.00000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0884  serine/threonine protein kinase with pentapeptide repeats  28.25 
 
 
563 aa  61.2  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.741036  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3276  serine/threonine kinase protein  29.55 
 
 
475 aa  60.8  0.00000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.162967  normal  0.186689 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1079  serine/threonine protein kinase  26.32 
 
 
422 aa  60.8  0.00000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.197837  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2867  serine/threonine protein kinase  29.27 
 
 
615 aa  60.8  0.00000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.446  normal  0.384542 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8509  protein kinase  25.56 
 
 
377 aa  60.5  0.00000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.355272  normal  0.998614 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0263  serine/threonine protein kinase  28.12 
 
 
894 aa  60.5  0.00000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.925108  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35230  serine/threonine protein kinase  26.79 
 
 
531 aa  60.5  0.00000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.812554  normal  0.572815 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1169  protein kinase  23.79 
 
 
634 aa  60.5  0.00000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000304799  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42880  serine-threonine kinase Stk1  29.44 
 
 
329 aa  60.5  0.00000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.576441 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5242  serine/threonine protein kinase  28.57 
 
 
581 aa  60.5  0.00000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.151896  normal  0.314771 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0422  serine/threonine protein kinase  27.6 
 
 
600 aa  60.5  0.00000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.709913  normal  0.835899 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0899  serine/threonine protein kinase  26.79 
 
 
499 aa  60.5  0.00000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000818625  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2288  serine/threonine protein kinase  29.02 
 
 
771 aa  59.7  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000513908 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0087  serine/threonine protein kinase  25.91 
 
 
700 aa  60.1  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3757  serine/threonine protein kinase  30 
 
 
466 aa  59.7  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4118  serine/threonine protein kinase  29.1 
 
 
888 aa  60.1  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.116559  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0069  putative serine/threonine protein kinase  25.21 
 
 
360 aa  60.1  0.0000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.446321 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0119  protein kinase  27.27 
 
 
519 aa  59.3  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.251317  normal  0.292526 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2673  serine/threonine protein kinase  29.05 
 
 
540 aa  59.7  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0573698  normal  0.794147 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3897  Serine/threonine protein kinase-related protein  27.06 
 
 
477 aa  59.3  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1957  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  23.58 
 
 
668 aa  58.9  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_12118  predicted protein  31.62 
 
 
137 aa  59.3  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>