More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_0579 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_4012  serine/threonine protein kinase  78.26 
 
 		 606 aa  989    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000249675 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1707  putative protein kinase  57.21 
 
 		 611 aa  721    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0579  serine/threonine protein kinase, putative  97.51 
 
 		 602 aa  1226    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0586  serine/threonine protein kinase  80.3 
 
 		 609 aa  1022    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01958  Serine/threonine protein kinase  52.46 
 
 		 624 aa  668    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000150408  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0539  protein kinase  79.63 
 
 		 600 aa  1004    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2040  serine/threonine protein kinase  55.15 
 
 		 616 aa  687    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.529884  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3729  serine/threonine protein kinase  94.19 
 
 		 602 aa  1186    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0579  serine/threonine protein kinase  100 
 
 		 602 aa  1249    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3451  serine/threonine protein kinase  99.34 
 
 		 602 aa  1242    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3500  serine/threonine protein kinase  80.56 
 
 		 610 aa  1040    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3786  protein kinase  94.02 
 
 		 602 aa  1184    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0578  serine/threonine protein kinase  99.5 
 
 		 602 aa  1244    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0541  serine/threonine protein kinase, putative  81.3 
 
 		 606 aa  1023    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.89559  decreased coverage  0.00419942 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1379  protein kinase  56.93 
 
 		 613 aa  721    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.688474  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3912  protein kinase  93.85 
 
 		 602 aa  1182    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0539  protein kinase  94.02 
 
 		 602 aa  1184    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4155  serine/threonine protein kinase  78.66 
 
 		 623 aa  986    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.922757  normal  0.593825 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3263  serine/threonine protein kinase  80.13 
 
 		 611 aa  1011    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.507481  hitchhiker  0.00561071 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3298  protein kinase  93.52 
 
 		 602 aa  1174    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0236  serine/threonine protein kinase  31.72 
 
 		 357 aa  79.7  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0764  serine/threonine kinase protein  27.56 
 
 		 662 aa  77.4  0.0000000000007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000395129 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1588  protein kinase  29.8 
 
 		 604 aa  77  0.0000000000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3788  serine/threonine protein kinase  30.99 
 
 		 505 aa  76.3  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.987521  normal  0.0424994 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1714  protein kinase  26.94 
 
 		 621 aa  75.1  0.000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1519  protein kinase  30.99 
 
 		 762 aa  70.5  0.00000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.171741  hitchhiker  0.00214244 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5305  serine/threonine protein kinase  26.8 
 
 		 645 aa  70.5  0.00000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.704424  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4550  serine/threonine protein kinase with pentapeptide repeats  31.95 
 
 		 526 aa  69.7  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.154716  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0990  serine/threonine protein kinase  24.83 
 
 		 486 aa  69.7  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000407261  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3543  serine/threonine protein kinase  28.11 
 
 		 537 aa  69.3  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0435506  normal  0.170453 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0780  serine/threonine protein kinase  33.89 
 
 		 457 aa  68.9  0.0000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.113085 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3083  serine/threonine protein kinase  27.85 
 
 		 461 aa  68.2  0.0000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1079  serine/threonine protein kinase  29.28 
 
 		 422 aa  68.6  0.0000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.197837  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3893  protein kinase  27.17 
 
 		 502 aa  68.2  0.0000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4235  serine/threonine protein kinase  27.86 
 
 		 381 aa  67.8  0.0000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1529  protein kinase  31.31 
 
 		 774 aa  67.8  0.0000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5242  serine/threonine protein kinase  29.44 
 
 		 581 aa  67.4  0.0000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.151896  normal  0.314771 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3340  serine/threonine protein kinase  27.17 
 
 		 490 aa  67  0.0000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1077  serine/threonine protein kinase  26.94 
 
 		 503 aa  67.4  0.0000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000527598  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2578  serine/threonine protein kinase  26.6 
 
 		 985 aa  67  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.790371  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1991  protein kinase  23.68 
 
 		 692 aa  66.6  0.000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0353  serine/threonine kinase protein  28.74 
 
 		 427 aa  66.2  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.638448  normal  0.179862 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3369  serine/threonine protein kinase  27.14 
 
 		 455 aa  66.2  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3276  serine/threonine kinase protein  28.77 
 
 		 475 aa  65.5  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.162967  normal  0.186689 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3946  serine/threonine protein kinase  30.67 
 
 		 587 aa  65.5  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0106209  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0336  serine/threonine protein kinase  27.37 
 
 		 777 aa  65.5  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2278  serine/threonine protein kinase  30 
 
 		 752 aa  65.1  0.000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0612166  hitchhiker  0.00000196574 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6388  serine/threonine protein kinase  29.09 
 
 		 391 aa  64.7  0.000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4390  serine/threonine protein kinase  28 
 
 		 938 aa  64.3  0.000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.139237  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1709  serine/threonine protein kinase  23.16 
 
 		 691 aa  63.9  0.000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0995  protein kinase  30.46 
 
 		 586 aa  63.9  0.000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.396652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1100  serine/threonine protein kinase  27.4 
 
 		 1415 aa  63.5  0.000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0789  serine/threonine kinase protein  25.33 
 
 		 614 aa  63.9  0.000000009  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.350319  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3751  serine/threonine protein kinase  29.82 
 
 		 478 aa  63.5  0.000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000729349  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0884  serine/threonine protein kinase with pentapeptide repeats  25.96 
 
 		 563 aa  62.8  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.741036  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0699  serine/threonine protein kinase  25.78 
 
 		 866 aa  62.8  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4709  serine/threonine protein kinase  26.69 
 
 		 557 aa  62.4  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2948  serine/threonine protein kinase  28.19 
 
 		 638 aa  62.4  0.00000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1844  protein kinase  27.73 
 
 		 485 aa  62.4  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3936  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  25.86 
 
 		 746 aa  62.8  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0857  serine/threonine protein kinase with pentapeptide repeats  25.96 
 
 		 563 aa  62.8  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2336  protein kinase  33.88 
 
 		 684 aa  62.4  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3670  protein kinase domain-containing protein  27.23 
 
 		 781 aa  62  0.00000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.353968  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5416  serine/threonine protein kinase  32.1 
 
 		 583 aa  62  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.281665  normal  0.125705 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1340  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  24.89 
 
 		 662 aa  61.6  0.00000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.458756 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4041  serine/threonine protein kinase  33.79 
 
 		 774 aa  62.4  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.224391  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4320  serine/threonine protein kinase  31.85 
 
 		 590 aa  62  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0909086  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8509  protein kinase  25.91 
 
 		 377 aa  61.6  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.355272  normal  0.998614 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31690  protein kinase family protein  28.38 
 
 		 643 aa  61.6  0.00000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4396  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  27.27 
 
 		 822 aa  61.6  0.00000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4023  serine/threonine protein kinase  28.98 
 
 		 414 aa  61.6  0.00000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3570  serine/threonine protein kinase  31.03 
 
 		 1479 aa  61.2  0.00000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0837409 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1235  serine/threonine protein kinase  30.22 
 
 		 628 aa  61.2  0.00000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0263  serine/threonine protein kinase  30.13 
 
 		 894 aa  61.2  0.00000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.925108  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1052  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  26.24 
 
 		 798 aa  61.2  0.00000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.687735 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2112  protein kinase  29.82 
 
 		 477 aa  61.2  0.00000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0811991 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6592  serine/threonine protein kinase  25 
 
 		 468 aa  61.2  0.00000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.700225  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0087  serine/threonine protein kinase  26.01 
 
 		 700 aa  60.8  0.00000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1169  protein kinase  25.23 
 
 		 634 aa  61.2  0.00000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000304799  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0069  putative serine/threonine protein kinase  26.92 
 
 		 360 aa  60.8  0.00000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.446321 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2845  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase  28.64 
 
 		 562 aa  60.8  0.00000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.985984  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1527  serine/threonine protein kinase  27.41 
 
 		 1122 aa  60.8  0.00000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0928  serine/threonine protein kinase  27.95 
 
 		 761 aa  60.5  0.00000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000612403  hitchhiker  1.21149e-16 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4503  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  28.38 
 
 		 1797 aa  60.8  0.00000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.194827  normal  0.137244 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1099  serine/threonine protein kinase  30.72 
 
 		 267 aa  60.8  0.00000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000152305  hitchhiker  0.0000000000000203974 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0621  serine/threonine kinase protein  28.12 
 
 		 407 aa  60.5  0.00000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.109473  hitchhiker  0.00845056 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3423  serine/threonine protein kinase  25.48 
 
 		 509 aa  60.5  0.00000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.931236  normal  0.508878 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1067  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  25.57 
 
 		 653 aa  60.5  0.00000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1045  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  27.06 
 
 		 627 aa  60.5  0.00000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4391  Serine/threonine protein kinase  29.55 
 
 		 546 aa  60.5  0.00000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000198345 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0422  serine/threonine protein kinase  26.24 
 
 		 600 aa  59.7  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.709913  normal  0.835899 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3163  serine/threonine protein kinase  30.07 
 
 		 761 aa  60.1  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.923539  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6426  serine/threonine protein kinase  29.91 
 
 		 465 aa  59.7  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0899  serine/threonine protein kinase  30.69 
 
 		 499 aa  60.5  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000818625  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2082  serine/threonine protein kinase  25 
 
 		 625 aa  60.1  0.0000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0701  serine/threonine kinase protein  29.7 
 
 		 500 aa  60.1  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000041573  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09960  protein kinase  24.79 
 
 		 638 aa  60.1  0.0000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0205  serine/threonine protein kinase with pentapeptide repeats  27.46 
 
 		 537 aa  59.7  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.47043 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2288  serine/threonine protein kinase  29.46 
 
 		 771 aa  59.7  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000513908 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6223  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  24.89 
 
 		 994 aa  58.9  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>