83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_2660 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_2660  signal-transduction protein  100 
 
 		 295 aa  599  1e-170  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.761511  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0677  signal transduction protein  28.38 
 
 		 399 aa  58.9  0.0000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0338  signal-transduction protein  27.52 
 
 		 145 aa  57.8  0.0000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3006  PAS  23.7 
 
 		 1560 aa  56.6  0.0000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.755684 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1760  CBS domain-containing protein  24.09 
 
 		 279 aa  54.7  0.000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000000218135  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0446  putative signal transduction protein with CBS domains  29.46 
 
 		 136 aa  52  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0212406  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1394  signal-transduction protein  28.1 
 
 		 135 aa  52  0.00001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.136388 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1332  signal-transduction protein  29.41 
 
 		 139 aa  51.6  0.00002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.660277  normal  0.443449 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0253  signal-transduction protein  30.25 
 
 		 140 aa  50.8  0.00003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  decreased coverage  0.00276555  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1618  CBS domain-containing protein  29.2 
 
 		 138 aa  50.4  0.00004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.182055 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0214  putative signal transduction protein with CBS domains  31.73 
 
 		 207 aa  50.1  0.00004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1866  cyclic nucleotide-binding protein  27.41 
 
 		 615 aa  50.4  0.00004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.450839  normal  0.446941 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0576  putative signal transduction protein with CBS domains  25.17 
 
 		 152 aa  49.7  0.00007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.134096  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0967  hypothetical protein  21.38 
 
 		 281 aa  49.3  0.00008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0364  signal-transduction protein  30.43 
 
 		 139 aa  49.3  0.00009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.612757 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1635  cyclic nucleotide-binding/CBS/putative nucleotidyltransferase  28.57 
 
 		 646 aa  49.3  0.00009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.5663  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1234  CBS domain containing membrane protein  25.73 
 
 		 380 aa  48.9  0.00009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1725  signal-transduction protein  28.95 
 
 		 155 aa  49.3  0.00009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.467768 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2156  CBS domain containing membrane protein  29.09 
 
 		 385 aa  48.5  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1198  CBS  29.91 
 
 		 139 aa  48.5  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1488  signal-transduction protein  29.57 
 
 		 142 aa  48.9  0.0001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.661715 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2675  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  28.69 
 
 		 840 aa  47.8  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0500157  hitchhiker  7.41843e-16 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4929  CBS domain containing protein  23.78 
 
 		 153 aa  47.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.076883 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2009  CBS domain-containing protein  30.63 
 
 		 143 aa  48.1  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.416479  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2688  CBS domain-containing protein  31.82 
 
 		 151 aa  47.4  0.0003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1824  CBS  26.9 
 
 		 154 aa  47.4  0.0003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.539518 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1809  putative signal-transduction protein with CBS domains  28.33 
 
 		 478 aa  47  0.0004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1889  signal transduction protein  23.78 
 
 		 152 aa  47  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.617772 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4395  CBS  26.45 
 
 		 164 aa  47  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0203487  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1420  CBS domain containing protein  28.33 
 
 		 144 aa  47  0.0004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.384654  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0917  CBS domain-containing protein  27.33 
 
 		 162 aa  46.6  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0848141 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1425  signal-transduction protein  26.96 
 
 		 144 aa  46.6  0.0005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.316039 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5960  CBS domain-containing protein  33.02 
 
 		 617 aa  46.6  0.0005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4239  CBS domain-containing protein  28.12 
 
 		 143 aa  46.6  0.0005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.716364  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1762  signal-transduction protein  28.43 
 
 		 139 aa  46.6  0.0005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1107  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  25.19 
 
 		 503 aa  46.6  0.0005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.714847  normal  0.939326 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2355  signal-transduction protein  34.62 
 
 		 145 aa  46.2  0.0006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.302795  normal  0.112681 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0805  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  26.92 
 
 		 488 aa  46.6  0.0006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1639  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  29.36 
 
 		 488 aa  46.2  0.0006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0762082  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0634  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  25.7 
 
 		 604 aa  46.6  0.0006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0507059  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4088  nucleotidyl transferase  25.25 
 
 		 351 aa  45.4  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1321  hypothetical protein  25.81 
 
 		 142 aa  45.4  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2812  CBS domain containing membrane protein  32.91 
 
 		 201 aa  44.3  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000718769  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4005  CBS domain containing protein  25.2 
 
 		 153 aa  44.3  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3960  CBS domain containing protein  25.2 
 
 		 153 aa  44.3  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0305  signal-transduction protein  29.75 
 
 		 185 aa  44.7  0.002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0743786  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3779  CBS domain-containing protein  27.33 
 
 		 162 aa  44.3  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.458118  normal  0.116222 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45046  predicted protein  25.83 
 
 		 148 aa  44.7  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.786213  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0415  signal-transduction protein  38.36 
 
 		 145 aa  44.3  0.002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.682078  normal  0.0782148 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0766  signal transduction protein  27.07 
 
 		 269 aa  43.9  0.003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.024671 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0806  hypothetical protein  27.73 
 
 		 144 aa  44.3  0.003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0777  hypothetical protein  27.73 
 
 		 144 aa  43.9  0.003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2153  signal-transduction protein  28.33 
 
 		 142 aa  44.3  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.268313  normal  0.0990163 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1695  CBS domain-containing protein  29.08 
 
 		 885 aa  44.3  0.003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3796  CBS domain-containing protein  30.23 
 
 		 143 aa  43.9  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.586823  normal  0.399094 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5465  CBS domain-containing protein  28.24 
 
 		 143 aa  43.5  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00381239 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03090  CBS domain-containing protein  30.25 
 
 		 144 aa  43.5  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.17742  hitchhiker  0.000000481482 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4261  CBS domain-containing protein  35.87 
 
 		 143 aa  43.5  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.808384  normal  0.229571 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2230  putative signal transduction protein with CBS domains  30.95 
 
 		 133 aa  43.5  0.005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.24818  normal  0.0199639 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0914  putative signal transduction protein with CBS domains  22.43 
 
 		 131 aa  43.5  0.005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.0000312526  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0947  CBS domain-containing protein  31.37 
 
 		 689 aa  43.1  0.005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1844  hypothetical protein  25.83 
 
 		 144 aa  43.5  0.005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2661  signal-transduction protein  28.7 
 
 		 177 aa  43.5  0.005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.63207  normal  0.665873 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0991  CBS domain-containing protein  28.15 
 
 		 196 aa  43.1  0.005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1294  CBS domain-containing protein  29.63 
 
 		 386 aa  43.1  0.006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0268357 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2240  signal transduction protein  21.68 
 
 		 153 aa  43.1  0.006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.525194 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3271  putative signal-transduction protein with CBS domains  28.33 
 
 		 143 aa  43.1  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00311988 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0072  CBS domain containing membrane protein  25.47 
 
 		 398 aa  43.1  0.006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7015  CBS domain-containing protein  28.12 
 
 		 143 aa  43.1  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1615  putative CBS domain and cyclic nucleotide- regulated nucleotidyltransferase  31.13 
 
 		 636 aa  43.1  0.006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1938  CBS domain-containing protein  26.36 
 
 		 143 aa  43.1  0.006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.704039  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0999  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  26.85 
 
 		 491 aa  43.1  0.006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000499041  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3809  putative signal transduction protein with CBS domains  27.34 
 
 		 407 aa  42.7  0.007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1511  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  28.69 
 
 		 517 aa  42.7  0.008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.316091 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6060  CBS domain-containing protein  30.51 
 
 		 143 aa  42.4  0.008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.613406  normal  0.175834 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1358  CBS domain-containing protein  30.51 
 
 		 143 aa  42.7  0.008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2478  putative CBS domain and cyclic nucleotide- regulated nucleotidyltransferase  29.63 
 
 		 642 aa  42.7  0.008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00776763 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6471  CBS domain-containing protein  30.51 
 
 		 143 aa  42.7  0.008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0745469  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0610  signal-transduction protein  27.5 
 
 		 348 aa  42.4  0.008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.909822  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2352  signal-transduction protein  27.5 
 
 		 142 aa  42.4  0.009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.103406  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1740  signal transduction protein  30 
 
 		 138 aa  42.4  0.009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.247067 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1483  CBS domain protein  31.33 
 
 		 125 aa  42.4  0.01  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0666376  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1909  signal transduction protein  27.01 
 
 		 138 aa  42.4  0.01  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.597362  normal  0.0569884 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>