120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_2775 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_1550  hypothetical protein  79.6 
 
 		 451 aa  765    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2557  hypothetical protein  85.37 
 
 		 451 aa  788    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2715  hypothetical protein  80.27 
 
 		 451 aa  770    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.715742  normal  0.0118371 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2783  hypothetical protein  80.27 
 
 		 451 aa  771    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.241401  normal  0.0251261 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2775  hypothetical protein  100 
 
 		 454 aa  935    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2885  hypothetical protein  80.71 
 
 		 451 aa  771    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000717465 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2419  hypothetical protein  80.27 
 
 		 451 aa  750    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.425927  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1372  hypothetical protein  78.27 
 
 		 451 aa  758    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2755  hypothetical protein  76.17 
 
 		 450 aa  711    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0317572 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1290  hypothetical protein  78.94 
 
 		 451 aa  759    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.921441  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1358  hypothetical protein  78.49 
 
 		 451 aa  761    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3310  hypothetical protein  75.95 
 
 		 450 aa  708    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0029835 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2975  hypothetical protein  80.71 
 
 		 450 aa  744    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.202766  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1397  hypothetical protein  78.27 
 
 		 451 aa  760    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.262603  hitchhiker  0.0098701 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3459  hypothetical protein  76.39 
 
 		 450 aa  708    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000318169 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2987  hypothetical protein  78.49 
 
 		 451 aa  761    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000362342 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004247  decarboxylase family protein  66.67 
 
 		 458 aa  629  1e-179  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.124703  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0421  hypothetical protein  64.52 
 
 		 457 aa  620  1e-176  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.100113  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01190  hypothetical protein  66.89 
 
 		 458 aa  614  1e-175  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3801  hypothetical protein  63.13 
 
 		 454 aa  611  9.999999999999999e-175  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.121315  hitchhiker  0.00000603572 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3174  hypothetical protein  62.61 
 
 		 454 aa  606  9.999999999999999e-173  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0695  hypothetical protein  62 
 
 		 452 aa  601  1.0000000000000001e-171  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.360136  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3248  hypothetical protein  62.39 
 
 		 454 aa  600  1e-170  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.322877  normal  0.240176 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3192  lysine decarboxylase family protein  62.39 
 
 		 454 aa  600  1e-170  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.334996  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3176  lysine decarboxylase family protein  62.39 
 
 		 454 aa  600  1e-170  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.133947  normal  0.691033 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3129  lysine decarboxylase family protein  62.39 
 
 		 454 aa  600  1e-170  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.325789  normal  0.436667 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3111  lysine decarboxylase family protein  62.39 
 
 		 454 aa  600  1e-170  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.113256  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3291  lysine decarboxylase family protein  62.39 
 
 		 454 aa  600  1e-170  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02640  hypothetical protein  62.39 
 
 		 454 aa  595  1e-169  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3537  lysine decarboxylase family protein  62.75 
 
 		 448 aa  597  1e-169  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3373  hypothetical protein  62.2 
 
 		 454 aa  595  1e-169  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.245822  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2939  hypothetical protein  62.39 
 
 		 454 aa  595  1e-169  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.275577  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3100  hypothetical protein  62.39 
 
 		 454 aa  595  1e-169  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.484247  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0917  hypothetical protein  62.39 
 
 		 454 aa  595  1e-169  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4059  hypothetical protein  62.39 
 
 		 454 aa  595  1e-169  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0267999  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2990  hypothetical protein  62.28 
 
 		 457 aa  595  1e-169  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02602  hypothetical protein  62.39 
 
 		 454 aa  595  1e-169  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0931  hypothetical protein  62.2 
 
 		 454 aa  595  1e-169  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.10556  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0893  conserved hypothetical protein  62.17 
 
 		 454 aa  591  1e-168  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0746871  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1003  putative decarboxylase  61.5 
 
 		 454 aa  593  1e-168  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0026607  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3156  hypothetical protein  61.5 
 
 		 454 aa  593  1e-168  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1056  hypothetical protein  61.5 
 
 		 454 aa  593  1e-168  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2935  hypothetical protein  62.39 
 
 		 454 aa  594  1e-168  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.153502  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3077  hypothetical protein  62.17 
 
 		 454 aa  593  1e-168  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.465683  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03047  hypothetical protein  61.57 
 
 		 454 aa  589  1e-167  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0303345  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3194  hypothetical protein  60.49 
 
 		 451 aa  571  1e-161  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2775  hypothetical protein  59.42 
 
 		 450 aa  565  1e-160  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.10624 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3091  decarboxylase family protein  59.11 
 
 		 454 aa  563  1.0000000000000001e-159  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.00268916  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0850  hypothetical protein  60.31 
 
 		 460 aa  560  1e-158  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0350692  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0977  hypothetical protein  57.24 
 
 		 461 aa  558  1e-158  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3302  hypothetical protein  58.39 
 
 		 457 aa  556  1e-157  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10730  hypothetical protein  57.02 
 
 		 461 aa  557  1e-157  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1909  decarboxylase family protein  58.84 
 
 		 457 aa  553  1e-156  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0510531  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1069  decarboxylase family protein  58.26 
 
 		 454 aa  552  1e-156  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.317311 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1809  hypothetical protein  57.75 
 
 		 454 aa  552  1e-156  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3498  hypothetical protein  58.39 
 
 		 468 aa  550  1e-155  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.587252 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3662  decarboxylase family protein  56.95 
 
 		 457 aa  540  9.999999999999999e-153  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.358077  normal  0.251066 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2067  hypothetical protein  56.95 
 
 		 457 aa  540  9.999999999999999e-153  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.841023  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2241  hypothetical protein  57.27 
 
 		 457 aa  541  9.999999999999999e-153  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0422  hypothetical protein  57.05 
 
 		 457 aa  537  1e-151  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2241  hypothetical protein  56.73 
 
 		 457 aa  537  1e-151  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3650  hypothetical protein  57.72 
 
 		 460 aa  533  1e-150  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27090  hypothetical protein  56.15 
 
 		 457 aa  531  1e-149  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.649053  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3796  hypothetical protein  58.48 
 
 		 456 aa  521  1e-147  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.024661  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1377  hypothetical protein  55.26 
 
 		 462 aa  509  1e-143  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.152492  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01319  decarboxylase family protein  55.83 
 
 		 461 aa  503  1e-141  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.12391  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1882  hypothetical protein  51.35 
 
 		 457 aa  469  1.0000000000000001e-131  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000892818  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1770  hypothetical protein  53.79 
 
 		 464 aa  469  1.0000000000000001e-131  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1708  hypothetical protein  54.04 
 
 		 464 aa  470  1.0000000000000001e-131  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0682  putative DNA uptake protein  30.4 
 
 		 313 aa  53.5  0.000008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2839  hypothetical protein  33.91 
 
 		 271 aa  52.8  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2800  hypothetical protein  28.42 
 
 		 275 aa  52.8  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.983756  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1915  hypothetical protein  27.01 
 
 		 266 aa  52.8  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7947  hypothetical protein  29.61 
 
 		 259 aa  52.4  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1082  hypothetical protein  28.8 
 
 		 225 aa  52.4  0.00002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.396045  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3662  hypothetical protein  29.41 
 
 		 263 aa  51.2  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0914373  normal  0.810533 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2520  hypothetical protein  27.32 
 
 		 260 aa  51.2  0.00003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000177513 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0395  hypothetical protein  25.65 
 
 		 245 aa  49.7  0.0001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0342519  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3081  hypothetical protein  31.65 
 
 		 243 aa  49.7  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000255019 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0868  conserved hypothetical protein TIGR00730  28.19 
 
 		 266 aa  48.9  0.0002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1849  hypothetical protein  25.73 
 
 		 245 aa  49.3  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3030  hypothetical protein  29.45 
 
 		 235 aa  48.9  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.862157  hitchhiker  0.00666776 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2461  hypothetical protein  25.73 
 
 		 220 aa  48.5  0.0003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000124566  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3898  hypothetical protein  26.83 
 
 		 261 aa  48.5  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0758722  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4735  hypothetical protein  30.86 
 
 		 289 aa  47.8  0.0004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.691032 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3314  hypothetical protein  28.42 
 
 		 270 aa  47.8  0.0004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.686515  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1555  hypothetical protein  28.86 
 
 		 273 aa  47.4  0.0005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0709  hypothetical protein  23.95 
 
 		 259 aa  47.4  0.0006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0476  hypothetical protein  24.86 
 
 		 218 aa  47.4  0.0006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4048  hypothetical protein  33.33 
 
 		 266 aa  47  0.0006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1089  hypothetical protein  25.52 
 
 		 247 aa  47  0.0006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0496  hypothetical protein  27.68 
 
 		 269 aa  45.8  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8428  Rossmann fold nucleotide-binding protein-like protein  32 
 
 		 267 aa  46.2  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.676666  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2714  hypothetical protein  25.41 
 
 		 190 aa  46.6  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.489323  hitchhiker  0.00087202 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2835  hypothetical protein  26.59 
 
 		 216 aa  45.8  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000181982  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4873  hypothetical protein  25.15 
 
 		 244 aa  45.4  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.626213 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6911  hypothetical protein  25.69 
 
 		 261 aa  45.8  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.135288  normal  0.167118 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2015  hypothetical protein  23.24 
 
 		 205 aa  45.8  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1022  decarboxylase family protein  32.9 
 
 		 315 aa  44.7  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0428  hypothetical protein  24.87 
 
 		 213 aa  44.7  0.003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>