160 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA3091 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA3091  decarboxylase family protein  100 
 
 		 454 aa  929    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.00268916  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1809  hypothetical protein  66.15 
 
 		 454 aa  614  1e-175  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3302  hypothetical protein  63.72 
 
 		 457 aa  609  1e-173  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0421  hypothetical protein  61.59 
 
 		 457 aa  602  1.0000000000000001e-171  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.100113  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2715  hypothetical protein  62.89 
 
 		 451 aa  599  1e-170  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.715742  normal  0.0118371 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2783  hypothetical protein  62.89 
 
 		 451 aa  600  1e-170  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.241401  normal  0.0251261 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1290  hypothetical protein  62 
 
 		 451 aa  600  1e-170  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.921441  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2241  hypothetical protein  62.39 
 
 		 457 aa  595  1e-169  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1909  decarboxylase family protein  62.17 
 
 		 457 aa  592  1e-168  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0510531  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27090  hypothetical protein  62.39 
 
 		 457 aa  592  1e-168  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.649053  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3650  hypothetical protein  61.67 
 
 		 460 aa  592  1e-168  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3662  decarboxylase family protein  62.17 
 
 		 457 aa  589  1e-167  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.358077  normal  0.251066 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3498  hypothetical protein  61.95 
 
 		 468 aa  590  1e-167  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.587252 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1069  decarboxylase family protein  59.47 
 
 		 454 aa  590  1e-167  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.317311 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10730  hypothetical protein  61.2 
 
 		 461 aa  588  1e-167  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2885  hypothetical protein  62 
 
 		 451 aa  590  1e-167  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000717465 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2067  hypothetical protein  62.17 
 
 		 457 aa  589  1e-167  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.841023  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0977  hypothetical protein  60.98 
 
 		 461 aa  588  1e-167  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2241  hypothetical protein  61.67 
 
 		 457 aa  588  1e-167  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1550  hypothetical protein  61.33 
 
 		 451 aa  587  1e-166  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1358  hypothetical protein  60.44 
 
 		 451 aa  585  1e-166  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2987  hypothetical protein  60.44 
 
 		 451 aa  585  1e-166  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000362342 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1397  hypothetical protein  60.44 
 
 		 451 aa  586  1e-166  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.262603  hitchhiker  0.0098701 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1372  hypothetical protein  60.22 
 
 		 451 aa  583  1.0000000000000001e-165  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0422  hypothetical protein  60.75 
 
 		 457 aa  580  1e-164  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01190  hypothetical protein  61.33 
 
 		 458 aa  576  1.0000000000000001e-163  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004247  decarboxylase family protein  60.22 
 
 		 458 aa  573  1.0000000000000001e-162  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.124703  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2755  hypothetical protein  60.98 
 
 		 450 aa  566  1e-160  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0317572 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0695  hypothetical protein  57.33 
 
 		 452 aa  564  1e-160  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.360136  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2775  hypothetical protein  59.11 
 
 		 454 aa  563  1.0000000000000001e-159  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2419  hypothetical protein  61.33 
 
 		 451 aa  561  1.0000000000000001e-159  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.425927  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1377  hypothetical protein  61.56 
 
 		 462 aa  563  1.0000000000000001e-159  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.152492  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2775  hypothetical protein  56.42 
 
 		 450 aa  556  1e-157  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.10624 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3796  hypothetical protein  61.07 
 
 		 456 aa  556  1e-157  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.024661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3310  hypothetical protein  60.36 
 
 		 450 aa  556  1e-157  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0029835 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2557  hypothetical protein  58.22 
 
 		 451 aa  554  1e-156  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3373  hypothetical protein  57.71 
 
 		 454 aa  554  1e-156  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.245822  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3801  hypothetical protein  57.93 
 
 		 454 aa  552  1e-156  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.121315  hitchhiker  0.00000603572 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0931  hypothetical protein  57.27 
 
 		 454 aa  550  1e-155  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.10556  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3174  hypothetical protein  56.61 
 
 		 454 aa  548  1e-155  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2975  hypothetical protein  58.67 
 
 		 450 aa  550  1e-155  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.202766  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3537  lysine decarboxylase family protein  56.67 
 
 		 448 aa  545  1e-154  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03047  hypothetical protein  57.98 
 
 		 454 aa  544  1e-154  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0303345  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2990  hypothetical protein  56.67 
 
 		 457 aa  548  1e-154  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1003  putative decarboxylase  57.27 
 
 		 454 aa  548  1e-154  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0026607  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3156  hypothetical protein  57.27 
 
 		 454 aa  548  1e-154  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1056  hypothetical protein  57.27 
 
 		 454 aa  548  1e-154  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01319  decarboxylase family protein  62.17 
 
 		 461 aa  545  1e-154  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.12391  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02640  hypothetical protein  57.52 
 
 		 454 aa  544  1e-153  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02602  hypothetical protein  57.52 
 
 		 454 aa  544  1e-153  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3192  lysine decarboxylase family protein  57.49 
 
 		 454 aa  543  1e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.334996  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3129  lysine decarboxylase family protein  57.49 
 
 		 454 aa  543  1e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.325789  normal  0.436667 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4059  hypothetical protein  57.52 
 
 		 454 aa  544  1e-153  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0267999  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3176  lysine decarboxylase family protein  57.49 
 
 		 454 aa  543  1e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.133947  normal  0.691033 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3111  lysine decarboxylase family protein  57.49 
 
 		 454 aa  543  1e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.113256  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2939  hypothetical protein  57.52 
 
 		 454 aa  544  1e-153  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.275577  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3100  hypothetical protein  57.52 
 
 		 454 aa  544  1e-153  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.484247  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0917  hypothetical protein  57.52 
 
 		 454 aa  544  1e-153  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2935  hypothetical protein  57.52 
 
 		 454 aa  543  1e-153  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.153502  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3077  hypothetical protein  57.3 
 
 		 454 aa  543  1e-153  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.465683  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3291  lysine decarboxylase family protein  57.49 
 
 		 454 aa  543  1e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0893  conserved hypothetical protein  57.3 
 
 		 454 aa  541  9.999999999999999e-153  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0746871  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3459  hypothetical protein  58.13 
 
 		 450 aa  539  9.999999999999999e-153  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000318169 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3248  hypothetical protein  56.39 
 
 		 454 aa  534  1e-150  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.322877  normal  0.240176 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3194  hypothetical protein  55.9 
 
 		 451 aa  526  1e-148  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1882  hypothetical protein  53.02 
 
 		 457 aa  519  1e-146  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000892818  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1770  hypothetical protein  58.94 
 
 		 464 aa  520  1e-146  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1708  hypothetical protein  59.42 
 
 		 464 aa  521  1e-146  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0850  hypothetical protein  54.26 
 
 		 460 aa  511  1e-144  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0350692  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1082  hypothetical protein  25 
 
 		 225 aa  62  0.00000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.396045  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2520  hypothetical protein  30.34 
 
 		 236 aa  60.8  0.00000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.220081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1863  hypothetical protein  28.4 
 
 		 217 aa  57  0.0000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.9915  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6766  hypothetical protein  27.76 
 
 		 360 aa  54.3  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3064  hypothetical protein  28.29 
 
 		 342 aa  54.7  0.000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00713435  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0395  hypothetical protein  27.88 
 
 		 245 aa  54.3  0.000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0342519  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2426  lysine decarboxylase family protein  30 
 
 		 249 aa  53.9  0.000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000109192 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3314  hypothetical protein  32.12 
 
 		 270 aa  53.1  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.686515  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3081  hypothetical protein  29.51 
 
 		 243 aa  52.4  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000255019 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7947  hypothetical protein  29.93 
 
 		 259 aa  52.8  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0682  putative DNA uptake protein  27.14 
 
 		 313 aa  53.1  0.00001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0496  hypothetical protein  31.03 
 
 		 269 aa  52.4  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1174  hypothetical protein  29.37 
 
 		 197 aa  52  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0253429  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1555  hypothetical protein  28.29 
 
 		 273 aa  52.4  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3662  hypothetical protein  27.61 
 
 		 263 aa  52  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0914373  normal  0.810533 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0774  hypothetical protein  27.33 
 
 		 255 aa  51.6  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8428  Rossmann fold nucleotide-binding protein-like protein  31.03 
 
 		 267 aa  51.2  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.676666  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1915  hypothetical protein  29.22 
 
 		 266 aa  51.6  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1267  hypothetical protein  21.94 
 
 		 342 aa  50.8  0.00005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  3.13698e-16  decreased coverage  0.00000000000243562 
 
 
 
NC_009921  Franean1_0875  hypothetical protein  30.63 
 
 		 332 aa  50.8  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.237559 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3030  hypothetical protein  31.16 
 
 		 235 aa  50.1  0.00007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.862157  hitchhiker  0.00666776 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3710  hypothetical protein  22.8 
 
 		 351 aa  50.1  0.00007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000239361  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0868  conserved hypothetical protein TIGR00730  29.29 
 
 		 266 aa  50.1  0.00009  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2390  hypothetical protein  25.9 
 
 		 245 aa  49.7  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.311617  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1849  hypothetical protein  26.28 
 
 		 245 aa  49.7  0.0001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1089  hypothetical protein  26.17 
 
 		 247 aa  49.3  0.0001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4048  hypothetical protein  26.22 
 
 		 266 aa  49.7  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25950  conserved hypothetical protein, DprA/Smf-related, family 2  31.25 
 
 		 280 aa  49.7  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.256647  normal  0.891073 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06300  conserved hypothetical protein, DprA/Smf-related, family 2  27.86 
 
 		 260 aa  49.7  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0555  hypothetical protein  29.13 
 
 		 241 aa  48.9  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.456463  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4084  hypothetical protein  28.25 
 
 		 275 aa  49.3  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>